21 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Gobs_1411 on replicon NC_013757
Organism: Geodermatophilus obscurus DSM 43160



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013757  Gobs_1411  OsmC family protein  100 
 
 
153 aa  310  4.999999999999999e-84  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.431224  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1145  OsmC family protein  65.27 
 
 
167 aa  204  3e-52  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.354032  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3648  OsmC family protein  47.59 
 
 
167 aa  140  7e-33  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1148  OsmC family protein  47.53 
 
 
169 aa  136  7.999999999999999e-32  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_2189  OsmC family protein  48.15 
 
 
169 aa  137  7.999999999999999e-32  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.0335227  normal  0.683604 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0330  OsmC family protein  45.45 
 
 
169 aa  135  2e-31  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.514624  normal 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0407  OsmC family protein  45.45 
 
 
169 aa  134  4e-31  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.0496053  normal 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0377  OsmC family protein  45.45 
 
 
169 aa  134  5e-31  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0867  OsmC family protein  46.34 
 
 
169 aa  133  7.000000000000001e-31  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.376239  hitchhiker  0.00350915 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0693  OsmC-like protein  46.58 
 
 
168 aa  133  7.000000000000001e-31  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2855  OsmC family protein  46.88 
 
 
169 aa  133  8e-31  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.0000502537  normal  0.0640135 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1127  OsmC family protein  46.43 
 
 
168 aa  130  6.999999999999999e-30  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal  0.938023 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0781  OsmC family protein  44.12 
 
 
169 aa  130  9e-30  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.764307  normal 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1639  OsmC family protein  46.91 
 
 
167 aa  129  1.0000000000000001e-29  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.945103  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7644  hypothetical protein  42.07 
 
 
170 aa  127  5.0000000000000004e-29  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.601343  normal  0.571261 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0225  OsmC-like protein  42.07 
 
 
169 aa  125  2.0000000000000002e-28  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.439807  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2892  OsmC family protein  42.68 
 
 
169 aa  120  5e-27  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.851644  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0031  OsmC-like protein  40.85 
 
 
169 aa  120  6e-27  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal  0.975846 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0112  OsmC-like protein  40.85 
 
 
169 aa  120  7e-27  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.636366  normal  0.66012 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_2206  OsmC family protein  35.8 
 
 
168 aa  81.6  0.000000000000003  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  normal  0.742376 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0684  OsmC-like protein  36.88 
 
 
167 aa  80.1  0.00000000000001  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.503679  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>