96 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mpop_3867 on replicon NC_010725
Organism: Methylobacterium populi BJ001



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010725  Mpop_3867  OsmC family protein  100 
 
 
185 aa  374  1e-103  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal  0.0319528 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3485  OsmC family protein  95.68 
 
 
185 aa  357  6e-98  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3793  OsmC family protein  94.59 
 
 
185 aa  353  5.999999999999999e-97  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal  0.242728 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2612  OsmC family protein  59.41 
 
 
208 aa  213  9.999999999999999e-55  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal  0.43183 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5418  hypothetical protein  60.49 
 
 
180 aa  205  3e-52  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0304  hypothetical protein  60.59 
 
 
190 aa  202  2e-51  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal  0.119499 
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0623  hypothetical protein  60.76 
 
 
176 aa  195  4.0000000000000005e-49  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  decreased coverage  0.0005983  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0969  OsmC family protein  54.71 
 
 
182 aa  187  5.999999999999999e-47  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  normal  0.298439 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2836  OsmC family protein  55.29 
 
 
177 aa  182  2.0000000000000003e-45  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_2212  OsmC family protein  54.43 
 
 
159 aa  173  1.9999999999999998e-42  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0039  OsmC-like protein  49.4 
 
 
179 aa  169  3e-41  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2175  OsmC-like protein  39.25 
 
 
185 aa  136  2e-31  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.416909  normal 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1151  OsmC family protein  38.71 
 
 
183 aa  125  4.0000000000000003e-28  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.824502  normal  0.359642 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1310  OsmC family protein  38.71 
 
 
183 aa  124  8.000000000000001e-28  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.47097  normal 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4668  OsmC family protein  37.63 
 
 
183 aa  124  1e-27  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.35857  normal 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4851  OsmC-like protein  39.77 
 
 
187 aa  115  1.9999999999999998e-25  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal  0.137347 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0441  OsmC family protein  40.5 
 
 
189 aa  83.2  0.000000000000002  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.488218  normal  0.432032 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2788  hypothetical protein  37.93 
 
 
186 aa  81.3  0.000000000000008  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0586  OsmC family protein  35.33 
 
 
179 aa  77  0.0000000000002  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  0.128993  normal  0.0133234 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2488  hypothetical protein  37.31 
 
 
202 aa  73.6  0.000000000002  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_2325  OsmC family protein  36.09 
 
 
180 aa  73.6  0.000000000002  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1026  OsmC family protein  38.74 
 
 
206 aa  72.4  0.000000000004  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1644  OsmC family protein  37.07 
 
 
193 aa  71.6  0.000000000005  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5247  OsmC family protein  38.46 
 
 
187 aa  71.6  0.000000000006  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal  0.402263 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2570  OsmC family protein  40.17 
 
 
187 aa  71.2  0.000000000007  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011885  Cyan7425_0190  OsmC family protein  40.17 
 
 
189 aa  71.2  0.000000000008  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  n/a    normal  0.155362 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4791  OsmC family protein  32.97 
 
 
187 aa  71.2  0.000000000008  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.361207  normal  0.435509 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1978  OsmC family protein  39.64 
 
 
186 aa  70.5  0.00000000001  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0443  OsmC-like protein  34.97 
 
 
176 aa  70.9  0.00000000001  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.16081  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0339  OsmC family protein  34.38 
 
 
145 aa  69.7  0.00000000003  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.53983  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1670  OsmC family protein  33.57 
 
 
156 aa  68.6  0.00000000005  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.0539264  n/a   
 
 
-
 
NC_008545  Bcen2424_6854  OsmC family protein  33.06 
 
 
186 aa  68.2  0.00000000007  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.521419  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2100  OsmC family protein  36.84 
 
 
185 aa  68.2  0.00000000007  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2505  OsmC family protein  35.59 
 
 
147 aa  67.4  0.0000000001  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4264  hypothetical protein  33.33 
 
 
184 aa  67.4  0.0000000001  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_6160  OsmC family protein  35.4 
 
 
182 aa  65.5  0.0000000004  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.76501  normal 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4895  OsmC-like protein  35.11 
 
 
184 aa  65.5  0.0000000004  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2354  OsmC-like protein  35.65 
 
 
170 aa  65.5  0.0000000004  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.572746  n/a   
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6453  OsmC family protein  32.62 
 
 
182 aa  65.9  0.0000000004  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.16719  normal 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3268  OsmC family protein  35.11 
 
 
184 aa  65.5  0.0000000004  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal  0.200885 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3421  OsmC family protein  35.11 
 
 
184 aa  65.1  0.0000000006  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.320541  normal 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4432  OsmC family protein  35.11 
 
 
184 aa  65.1  0.0000000006  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.670087  normal 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3413  OsmC family protein  38.79 
 
 
171 aa  64.3  0.0000000008  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0235  OsmC family protein  33.9 
 
 
147 aa  64.3  0.0000000009  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008545  Bcen2424_6912  OsmC family protein  35.11 
 
 
184 aa  63.9  0.000000001  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_07015  hypothetical protein  29.57 
 
 
181 aa  62  0.000000004  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3526  OsmC family protein  32.79 
 
 
177 aa  61.6  0.000000007  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.7407  normal  0.298467 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3848  OsmC family protein  31.03 
 
 
181 aa  58.9  0.00000004  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.323457  normal 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1892  OsmC-like protein  35.4 
 
 
148 aa  58.5  0.00000005  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_4241  OsmC family protein  34.65 
 
 
202 aa  58.2  0.00000008  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1904  OsmC family protein  28.7 
 
 
193 aa  57  0.0000001  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.576095  unclonable  0.00000937306 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2254  OsmC-like protein  32.17 
 
 
199 aa  56.2  0.0000003  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.0977605  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2488  OsmC family protein  37.7 
 
 
172 aa  55.8  0.0000004  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.0230337  normal  0.160295 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_04790  OsmC family protein  31.91 
 
 
144 aa  54.3  0.0000009  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1348  OsmC family protein  32.46 
 
 
151 aa  53.5  0.000001  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5957  OsmC family protein  40.98 
 
 
190 aa  52.8  0.000003  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_13840  predicted redox protein, regulator of disulfide bond formation  25.68 
 
 
145 aa  52.4  0.000004  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0781  OsmC family protein  30.38 
 
 
169 aa  51.6  0.000007  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.764307  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4175  hypothetical protein  31.4 
 
 
135 aa  50.8  0.00001  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.214068  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2855  OsmC family protein  33.33 
 
 
169 aa  50.1  0.00002  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.0000502537  normal  0.0640135 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1058  OsmC family protein  32 
 
 
200 aa  49.7  0.00002  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal  0.333829 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0693  OsmC-like protein  33.01 
 
 
168 aa  50.1  0.00002  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6241  OsmC family protein  27.83 
 
 
182 aa  49.7  0.00003  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0196837  normal  0.733472 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1865  OsmC family protein  30.09 
 
 
185 aa  48.9  0.00005  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.128326  normal 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1440  OsmC family protein  36.25 
 
 
142 aa  48.5  0.00005  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE1270  hypothetical protein  31.93 
 
 
144 aa  48.9  0.00005  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  hitchhiker  0.00225413  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0921  OsmC family protein  38.89 
 
 
136 aa  48.5  0.00005  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.418667  normal 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1206  OsmC family protein  30 
 
 
413 aa  48.5  0.00006  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.423514  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_3231  OsmC family protein  27.03 
 
 
163 aa  47.8  0.0001  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0330  OsmC family protein  32.69 
 
 
169 aa  45.8  0.0003  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.514624  normal 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0377  OsmC family protein  32.69 
 
 
169 aa  45.4  0.0004  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1923  OsmC-like protein  28.81 
 
 
127 aa  45.8  0.0004  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1301  OsmC family protein  36.99 
 
 
130 aa  45.4  0.0004  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal  0.0499071 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_48750  hypothetical protein  30.58 
 
 
135 aa  45.1  0.0005  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000274485 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1267  OsmC family protein  36.99 
 
 
130 aa  45.4  0.0005  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE1727  hypothetical protein  31.3 
 
 
138 aa  45.1  0.0006  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0684  OsmC-like protein  30.59 
 
 
167 aa  44.7  0.0007  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.503679  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1919  OsmC family protein  42 
 
 
131 aa  44.7  0.0007  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.148561  normal 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1595  OsmC family protein  33.06 
 
 
134 aa  43.9  0.001  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_4048  OsmC family protein  42.86 
 
 
415 aa  43.9  0.001  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  unclonable  0.0000134708  normal 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0407  OsmC family protein  33.33 
 
 
169 aa  43.1  0.002  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.0496053  normal 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0908  OsmC-like protein  34.25 
 
 
130 aa  43.1  0.002  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1390  OsmC family protein  34.25 
 
 
130 aa  43.1  0.002  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.51882  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1917  OsmC family protein  29.66 
 
 
130 aa  43.1  0.002  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.591016  normal  0.655521 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1368  OsmC family protein  34.25 
 
 
130 aa  43.1  0.002  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.0210899 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1950  OsmC family protein  37.93 
 
 
132 aa  43.1  0.002  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.378128  normal 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4533  OsmC-like protein  36.62 
 
 
130 aa  42.7  0.003  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.257374 
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6577  OsmC family protein  27.27 
 
 
176 aa  42.4  0.004  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2279  OsmC family protein  33.33 
 
 
155 aa  42.4  0.004  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.0377998  normal  0.182149 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1255  OsmC-like protein  27.27 
 
 
176 aa  42.4  0.004  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.340631  n/a   
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6182  OsmC family protein  27.27 
 
 
176 aa  42.4  0.004  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.360981 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3655  OsmC family protein  34.33 
 
 
410 aa  42.4  0.004  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0897  OsmC family protein  27.78 
 
 
145 aa  41.6  0.006  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.669017  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6635  OsmC family protein  42 
 
 
411 aa  42  0.006  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.659004  hitchhiker  0.00000360166 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3762  OsmC family protein  34.33 
 
 
410 aa  41.2  0.009  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3145  redox protein regulator of disulfide bond formation, OsmC-like  36.73 
 
 
132 aa  40.8  0.01  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.102127 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>