68 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene BBta_7644 on replicon NC_009485
Organism: Bradyrhizobium sp. BTAi1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009485  BBta_7644  hypothetical protein  100 
 
 
170 aa  336  9.999999999999999e-92  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.601343  normal  0.571261 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0112  OsmC-like protein  86.39 
 
 
169 aa  275  3e-73  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.636366  normal  0.66012 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0225  OsmC-like protein  83.43 
 
 
169 aa  272  2.0000000000000002e-72  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.439807  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2892  OsmC family protein  83.43 
 
 
169 aa  268  2e-71  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.851644  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0693  OsmC-like protein  73.81 
 
 
168 aa  262  2e-69  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_2189  OsmC family protein  74.4 
 
 
169 aa  261  2e-69  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.0335227  normal  0.683604 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0377  OsmC family protein  73.21 
 
 
169 aa  256  7e-68  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0330  OsmC family protein  72.62 
 
 
169 aa  256  1e-67  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.514624  normal 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0407  OsmC family protein  72.02 
 
 
169 aa  254  3e-67  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.0496053  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1148  OsmC family protein  72.62 
 
 
169 aa  252  1.0000000000000001e-66  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0867  OsmC family protein  73.33 
 
 
169 aa  249  9.000000000000001e-66  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.376239  hitchhiker  0.00350915 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0031  OsmC-like protein  78.11 
 
 
169 aa  248  3e-65  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal  0.975846 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0781  OsmC family protein  66.87 
 
 
169 aa  226  1e-58  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.764307  normal 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2855  OsmC family protein  62.65 
 
 
169 aa  210  7.999999999999999e-54  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.0000502537  normal  0.0640135 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1127  OsmC family protein  60.74 
 
 
168 aa  203  8e-52  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal  0.938023 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1145  OsmC family protein  53.66 
 
 
167 aa  175  2e-43  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.354032  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1639  OsmC family protein  53.7 
 
 
167 aa  175  3e-43  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.945103  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3648  OsmC family protein  46.95 
 
 
167 aa  155  3e-37  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0684  OsmC-like protein  50 
 
 
167 aa  144  6e-34  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.503679  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_2206  OsmC family protein  45.78 
 
 
168 aa  136  1e-31  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  normal  0.742376 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1411  OsmC family protein  42.07 
 
 
153 aa  129  2.0000000000000002e-29  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.431224  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0339  OsmC family protein  30.82 
 
 
145 aa  73.6  0.000000000001  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.53983  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1892  OsmC-like protein  35.56 
 
 
148 aa  69.7  0.00000000002  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0441  OsmC family protein  37.11 
 
 
189 aa  68.6  0.00000000004  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.488218  normal  0.432032 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_4241  OsmC family protein  31.34 
 
 
202 aa  66.2  0.0000000002  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2788  hypothetical protein  36 
 
 
186 aa  66.6  0.0000000002  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2488  hypothetical protein  35.64 
 
 
202 aa  65.1  0.0000000005  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2254  OsmC-like protein  35.42 
 
 
199 aa  60.5  0.00000001  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.0977605  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_07015  hypothetical protein  35.79 
 
 
181 aa  60.1  0.00000001  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0235  OsmC family protein  32.87 
 
 
147 aa  59.3  0.00000003  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3848  OsmC family protein  34.02 
 
 
181 aa  58.9  0.00000003  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.323457  normal 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1644  OsmC family protein  32.35 
 
 
193 aa  56.6  0.0000002  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3526  OsmC family protein  29.81 
 
 
177 aa  55.8  0.0000003  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.7407  normal  0.298467 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6241  OsmC family protein  30.61 
 
 
182 aa  55.8  0.0000003  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0196837  normal  0.733472 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2570  OsmC family protein  33.66 
 
 
187 aa  55.1  0.0000004  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_13840  predicted redox protein, regulator of disulfide bond formation  31.25 
 
 
145 aa  54.3  0.0000008  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1865  OsmC family protein  34.51 
 
 
185 aa  53.1  0.000002  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.128326  normal 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2505  OsmC family protein  28.57 
 
 
147 aa  53.1  0.000002  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_2325  OsmC family protein  29.3 
 
 
180 aa  52  0.000004  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2488  OsmC family protein  28.23 
 
 
172 aa  51.6  0.000005  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.0230337  normal  0.160295 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_04790  OsmC family protein  34.69 
 
 
144 aa  50.8  0.000009  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2354  OsmC-like protein  32.99 
 
 
170 aa  50.1  0.00002  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.572746  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4851  OsmC-like protein  32.63 
 
 
187 aa  49.7  0.00002  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal  0.137347 
 
 
-
 
NC_008545  Bcen2424_6854  OsmC family protein  33.75 
 
 
186 aa  48.9  0.00004  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.521419  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2175  OsmC-like protein  31.07 
 
 
185 aa  48.5  0.00005  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.416909  normal 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_2212  OsmC family protein  29.14 
 
 
159 aa  48.1  0.00006  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011885  Cyan7425_0190  OsmC family protein  29.41 
 
 
189 aa  47.8  0.00007  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  n/a    normal  0.155362 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6453  OsmC family protein  29.7 
 
 
182 aa  47  0.0001  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.16719  normal 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1593  OsmC family protein  27.45 
 
 
141 aa  46.2  0.0002  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3413  OsmC family protein  28.47 
 
 
171 aa  46.2  0.0002  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3793  OsmC family protein  31.06 
 
 
185 aa  46.6  0.0002  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal  0.242728 
 
 
-
 
NC_002967  TDE1727  hypothetical protein  27.59 
 
 
138 aa  45.8  0.0002  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4668  OsmC family protein  31.58 
 
 
183 aa  46.2  0.0002  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.35857  normal 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_6160  OsmC family protein  29.7 
 
 
182 aa  46.6  0.0002  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.76501  normal 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0304  hypothetical protein  28.76 
 
 
190 aa  46.2  0.0002  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal  0.119499 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1151  OsmC family protein  29.47 
 
 
183 aa  46.2  0.0002  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.824502  normal  0.359642 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1310  OsmC family protein  30.53 
 
 
183 aa  45.8  0.0003  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.47097  normal 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1978  OsmC family protein  28 
 
 
186 aa  45.1  0.0004  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4264  hypothetical protein  26 
 
 
184 aa  45.4  0.0004  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4432  OsmC family protein  28.92 
 
 
184 aa  43.5  0.001  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.670087  normal 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3421  OsmC family protein  28.92 
 
 
184 aa  43.5  0.001  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.320541  normal 
 
 
-
 
NC_008545  Bcen2424_6912  OsmC family protein  28.92 
 
 
184 aa  43.5  0.001  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3268  OsmC family protein  28.92 
 
 
184 aa  43.1  0.002  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal  0.200885 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4895  OsmC-like protein  28.92 
 
 
184 aa  43.1  0.002  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2100  OsmC family protein  25.61 
 
 
185 aa  42.4  0.003  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0443  OsmC-like protein  27.66 
 
 
176 aa  42.7  0.003  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.16081  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2836  OsmC family protein  28.39 
 
 
177 aa  42.4  0.003  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0586  OsmC family protein  31.68 
 
 
179 aa  41.6  0.005  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  0.128993  normal  0.0133234 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>