84 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Htur_1026 on replicon NC_013743
Organism: Haloterrigena turkmenica DSM 5511



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013743  Htur_1026  OsmC family protein  100 
 
 
206 aa  419  1e-116  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0441  OsmC family protein  43.2 
 
 
189 aa  140  1.9999999999999998e-32  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.488218  normal  0.432032 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3268  OsmC family protein  41.18 
 
 
184 aa  138  4.999999999999999e-32  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal  0.200885 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4895  OsmC-like protein  41.18 
 
 
184 aa  138  4.999999999999999e-32  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4432  OsmC family protein  41.67 
 
 
184 aa  137  7.999999999999999e-32  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.670087  normal 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3421  OsmC family protein  41.67 
 
 
184 aa  137  7.999999999999999e-32  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.320541  normal 
 
 
-
 
NC_008545  Bcen2424_6912  OsmC family protein  41.18 
 
 
184 aa  137  7.999999999999999e-32  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4264  hypothetical protein  40.94 
 
 
184 aa  136  2e-31  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6453  OsmC family protein  40.8 
 
 
182 aa  135  6.0000000000000005e-31  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.16719  normal 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_6160  OsmC family protein  40.8 
 
 
182 aa  134  7.000000000000001e-31  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.76501  normal 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2488  hypothetical protein  40.12 
 
 
202 aa  134  9.999999999999999e-31  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_4241  OsmC family protein  38.64 
 
 
202 aa  128  5.0000000000000004e-29  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2788  hypothetical protein  39.43 
 
 
186 aa  125  5e-28  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1978  OsmC family protein  38.15 
 
 
186 aa  124  7e-28  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008545  Bcen2424_6854  OsmC family protein  39.77 
 
 
186 aa  124  9e-28  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.521419  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5247  OsmC family protein  33.52 
 
 
187 aa  123  2e-27  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal  0.402263 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2254  OsmC-like protein  36.36 
 
 
199 aa  122  3e-27  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.0977605  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2570  OsmC family protein  36.99 
 
 
187 aa  119  3e-26  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5957  OsmC family protein  34.83 
 
 
190 aa  113  2.0000000000000002e-24  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6241  OsmC family protein  34.07 
 
 
182 aa  112  4.0000000000000004e-24  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0196837  normal  0.733472 
 
 
-
 
NC_011885  Cyan7425_0190  OsmC family protein  34.81 
 
 
189 aa  109  3e-23  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  n/a    normal  0.155362 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1644  OsmC family protein  32.58 
 
 
193 aa  106  2e-22  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4791  OsmC family protein  35.2 
 
 
187 aa  107  2e-22  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.361207  normal  0.435509 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0586  OsmC family protein  33.15 
 
 
179 aa  101  6e-21  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  0.128993  normal  0.0133234 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1865  OsmC family protein  32.96 
 
 
185 aa  100  1e-20  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.128326  normal 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1892  OsmC-like protein  39.72 
 
 
148 aa  97.8  9e-20  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3526  OsmC family protein  31.93 
 
 
177 aa  96.7  2e-19  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.7407  normal  0.298467 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_04790  OsmC family protein  41.32 
 
 
144 aa  94.7  8e-19  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2354  OsmC-like protein  35.37 
 
 
170 aa  92  6e-18  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.572746  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_2325  OsmC family protein  32.95 
 
 
180 aa  90.5  2e-17  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2100  OsmC family protein  30 
 
 
185 aa  86.7  2e-16  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2836  OsmC family protein  42.86 
 
 
177 aa  86.3  3e-16  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0339  OsmC family protein  35.33 
 
 
145 aa  84.7  9e-16  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.53983  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0969  OsmC family protein  39.64 
 
 
182 aa  83.6  0.000000000000002  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  normal  0.298439 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1670  OsmC family protein  35.38 
 
 
156 aa  82.4  0.000000000000004  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.0539264  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_07015  hypothetical protein  26.26 
 
 
181 aa  81.6  0.000000000000007  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0235  OsmC family protein  39.13 
 
 
147 aa  80.9  0.00000000000001  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3413  OsmC family protein  38.26 
 
 
171 aa  78.6  0.00000000000007  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0443  OsmC-like protein  36.24 
 
 
176 aa  78.6  0.00000000000007  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.16081  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3848  OsmC family protein  24.86 
 
 
181 aa  78.2  0.00000000000007  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.323457  normal 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_3231  OsmC family protein  28.74 
 
 
163 aa  76.6  0.0000000000002  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2488  OsmC family protein  36.84 
 
 
172 aa  76.3  0.0000000000003  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.0230337  normal  0.160295 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0039  OsmC-like protein  38.66 
 
 
179 aa  73.9  0.000000000002  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0304  hypothetical protein  38.94 
 
 
190 aa  72.4  0.000000000004  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal  0.119499 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3867  OsmC family protein  38.74 
 
 
185 aa  72.4  0.000000000005  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal  0.0319528 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3485  OsmC family protein  39.64 
 
 
185 aa  71.2  0.00000000001  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_2212  OsmC family protein  34.17 
 
 
159 aa  70.5  0.00000000002  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5418  hypothetical protein  37.61 
 
 
180 aa  70.1  0.00000000002  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2505  OsmC family protein  30.56 
 
 
147 aa  69.3  0.00000000003  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3793  OsmC family protein  36.94 
 
 
185 aa  69.7  0.00000000003  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal  0.242728 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1348  OsmC family protein  29.66 
 
 
151 aa  65.5  0.0000000005  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2612  OsmC family protein  35.96 
 
 
208 aa  65.5  0.0000000006  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal  0.43183 
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0623  hypothetical protein  35.4 
 
 
176 aa  62.4  0.000000004  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  decreased coverage  0.0005983  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1310  OsmC family protein  31.62 
 
 
183 aa  62  0.000000006  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.47097  normal 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1151  OsmC family protein  31.62 
 
 
183 aa  60.5  0.00000002  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.824502  normal  0.359642 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4851  OsmC-like protein  29.57 
 
 
187 aa  60.1  0.00000002  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal  0.137347 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_13840  predicted redox protein, regulator of disulfide bond formation  30.25 
 
 
145 aa  59.7  0.00000003  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4668  OsmC family protein  28.7 
 
 
183 aa  58.2  0.00000009  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.35857  normal 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2855  OsmC family protein  31.62 
 
 
169 aa  58.2  0.0000001  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.0000502537  normal  0.0640135 
 
 
-
 
NC_002967  TDE1270  hypothetical protein  27.83 
 
 
144 aa  57.8  0.0000001  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  hitchhiker  0.00225413  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2175  OsmC-like protein  27.12 
 
 
185 aa  56.6  0.0000002  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.416909  normal 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0897  OsmC family protein  28.33 
 
 
145 aa  57  0.0000002  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.669017  normal 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1145  OsmC family protein  37.84 
 
 
167 aa  55.8  0.0000005  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.354032  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0693  OsmC-like protein  33.68 
 
 
168 aa  54.7  0.000001  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1058  OsmC family protein  28.8 
 
 
200 aa  54.3  0.000001  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal  0.333829 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1904  OsmC family protein  25.42 
 
 
193 aa  54.3  0.000001  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.576095  unclonable  0.00000937306 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0684  OsmC-like protein  43.55 
 
 
167 aa  50.1  0.00003  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.503679  n/a   
 
 
-
 
NC_009475  BBta_p0218  hypothetical protein  43.86 
 
 
74 aa  49.3  0.00004  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  n/a    normal  0.354041 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0867  OsmC family protein  36.49 
 
 
169 aa  48.9  0.00005  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.376239  hitchhiker  0.00350915 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1127  OsmC family protein  30.85 
 
 
168 aa  48.9  0.00005  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal  0.938023 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2794  OsmC family protein  31.87 
 
 
142 aa  47  0.0002  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0330  OsmC family protein  33.78 
 
 
169 aa  46.2  0.0003  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.514624  normal 
 
 
-
 
NC_002967  TDE1727  hypothetical protein  26.92 
 
 
138 aa  46.2  0.0004  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_2206  OsmC family protein  24.53 
 
 
168 aa  45.8  0.0005  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  normal  0.742376 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0377  OsmC family protein  33.78 
 
 
169 aa  45.8  0.0005  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1148  OsmC family protein  32.43 
 
 
169 aa  45.1  0.0007  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3648  OsmC family protein  34.21 
 
 
167 aa  45.1  0.0008  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_2189  OsmC family protein  32.43 
 
 
169 aa  44.7  0.0009  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.0335227  normal  0.683604 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0042  OsmC family protein  28.57 
 
 
142 aa  43.5  0.002  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0781  OsmC family protein  32 
 
 
169 aa  43.9  0.002  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.764307  normal 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0407  OsmC family protein  32.43 
 
 
169 aa  43.1  0.003  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.0496053  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3865  OsmC family protein  30 
 
 
175 aa  42.4  0.005  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.745195  normal  0.175914 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1957  OsmC family protein  22.36 
 
 
201 aa  42.4  0.005  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  normal  0.226046 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7506  hypothetical protein  26.61 
 
 
188 aa  41.6  0.008  Burkholderia sp. 383  Bacteria  hitchhiker  0.000000000101926  normal  0.551931 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>