71 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tcr_0039 on replicon NC_007520
Organism: Thiomicrospira crunogena XCL-2



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007520  Tcr_0039  OsmC-like protein  100 
 
 		 179 aa  363  1e-100  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2612  OsmC family protein  60 
 
 		 208 aa  204  6e-52  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.43183 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0969  OsmC family protein  60.59 
 
 		 182 aa  203  1e-51  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  0.298439 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_2212  OsmC family protein  62.5 
 
 		 159 aa  201  6e-51  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5418  hypothetical protein  59.39 
 
 		 180 aa  199  9.999999999999999e-51  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0304  hypothetical protein  58.24 
 
 		 190 aa  194  4.0000000000000005e-49  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.119499 
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0623  hypothetical protein  53.93 
 
 		 176 aa  187  8e-47  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  decreased coverage  0.0005983  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2836  OsmC family protein  56.8 
 
 		 177 aa  184  5e-46  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3793  OsmC family protein  50.3 
 
 		 185 aa  177  9e-44  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.242728 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3485  OsmC family protein  49.7 
 
 		 185 aa  173  9.999999999999999e-43  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3867  OsmC family protein  49.4 
 
 		 185 aa  169  2e-41  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.0319528 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4668  OsmC family protein  47.31 
 
 		 183 aa  154  9e-37  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.35857  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1151  OsmC family protein  45.51 
 
 		 183 aa  147  8e-35  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.824502  normal  0.359642 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1310  OsmC family protein  45.51 
 
 		 183 aa  145  2.0000000000000003e-34  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.47097  normal  1 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2175  OsmC-like protein  45.4 
 
 		 185 aa  136  2e-31  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.416909  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4851  OsmC-like protein  43.11 
 
 		 187 aa  135  5e-31  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.137347 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0441  OsmC family protein  42.61 
 
 		 189 aa  88.6  5e-17  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.488218  normal  0.432032 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0586  OsmC family protein  34.15 
 
 		 179 aa  86.7  2e-16  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  0.128993  normal  0.0133234 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6453  OsmC family protein  34.48 
 
 		 182 aa  85.5  4e-16  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.16719  normal  1 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_6160  OsmC family protein  33.91 
 
 		 182 aa  84.3  8e-16  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.76501  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2788  hypothetical protein  41.67 
 
 		 186 aa  82.8  0.000000000000002  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0339  OsmC family protein  35.46 
 
 		 145 aa  79  0.00000000000003  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.53983  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2488  hypothetical protein  39.32 
 
 		 202 aa  79  0.00000000000004  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4791  OsmC family protein  36.13 
 
 		 187 aa  77  0.0000000000001  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.361207  normal  0.435509 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2505  OsmC family protein  36.36 
 
 		 147 aa  76.3  0.0000000000002  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2100  OsmC family protein  36.44 
 
 		 185 aa  74.7  0.0000000000007  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1026  OsmC family protein  38.66 
 
 		 206 aa  73.9  0.000000000001  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1978  OsmC family protein  31.72 
 
 		 186 aa  72  0.000000000004  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2570  OsmC family protein  35.59 
 
 		 187 aa  71.2  0.000000000007  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_2325  OsmC family protein  31.82 
 
 		 180 aa  70.5  0.00000000001  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5247  OsmC family protein  28.33 
 
 		 187 aa  70.1  0.00000000001  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.402263 
 
 
-
 
NC_008545  Bcen2424_6854  OsmC family protein  32.5 
 
 		 186 aa  70.5  0.00000000001  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.521419  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4264  hypothetical protein  29.38 
 
 		 184 aa  69.7  0.00000000002  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6241  OsmC family protein  34.78 
 
 		 182 aa  66.2  0.0000000002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0196837  normal  0.733472 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0443  OsmC-like protein  30.86 
 
 		 176 aa  66.2  0.0000000002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.16081  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3848  OsmC family protein  30.61 
 
 		 181 aa  66.2  0.0000000003  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.323457  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1865  OsmC family protein  36.04 
 
 		 185 aa  65.1  0.0000000005  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.128326  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4895  OsmC-like protein  29.66 
 
 		 184 aa  64.3  0.0000000008  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3268  OsmC family protein  29.66 
 
 		 184 aa  64.3  0.0000000008  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  0.200885 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2254  OsmC-like protein  32.17 
 
 		 199 aa  63.9  0.000000001  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.0977605  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3526  OsmC family protein  29.1 
 
 		 177 aa  63.5  0.000000001  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.7407  normal  0.298467 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5957  OsmC family protein  29.3 
 
 		 190 aa  63.2  0.000000002  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2488  OsmC family protein  32.26 
 
 		 172 aa  62.4  0.000000003  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.0230337  normal  0.160295 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0235  OsmC family protein  32.77 
 
 		 147 aa  62.4  0.000000003  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4432  OsmC family protein  34.48 
 
 		 184 aa  62.8  0.000000003  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.670087  normal  1 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3421  OsmC family protein  34.48 
 
 		 184 aa  62.8  0.000000003  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.320541  normal  1 
 
 
-
 
NC_008545  Bcen2424_6912  OsmC family protein  28.97 
 
 		 184 aa  62.4  0.000000003  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1644  OsmC family protein  34.91 
 
 		 193 aa  62.4  0.000000003  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_4241  OsmC family protein  32.14 
 
 		 202 aa  62  0.000000005  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011885  Cyan7425_0190  OsmC family protein  34.45 
 
 		 189 aa  61.6  0.000000006  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  n/a    normal  0.155362 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_07015  hypothetical protein  26.59 
 
 		 181 aa  61.2  0.000000007  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1892  OsmC-like protein  28.68 
 
 		 148 aa  59.7  0.00000002  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2354  OsmC-like protein  33.33 
 
 		 170 aa  58.9  0.00000003  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.572746  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1670  OsmC family protein  34.88 
 
 		 156 aa  57  0.0000001  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.0539264  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_3231  OsmC family protein  27.34 
 
 		 163 aa  57  0.0000001  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3413  OsmC family protein  33.33 
 
 		 171 aa  56.2  0.0000002  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1904  OsmC family protein  37.88 
 
 		 193 aa  54.3  0.0000009  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.576095  unclonable  0.00000937306 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_04790  OsmC family protein  31.11 
 
 		 144 aa  50.8  0.00001  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_13840  predicted redox protein, regulator of disulfide bond formation  27.73 
 
 		 145 aa  50.4  0.00001  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002967  TDE1270  hypothetical protein  27.87 
 
 		 144 aa  48.9  0.00004  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  hitchhiker  0.00225413  n/a   
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7506  hypothetical protein  30.68 
 
 		 188 aa  44.3  0.0009  Burkholderia sp. 383  Bacteria  hitchhiker  0.000000000101926  normal  0.551931 
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6577  OsmC family protein  26.92 
 
 		 176 aa  44.3  0.001  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1255  OsmC-like protein  26.92 
 
 		 176 aa  44.3  0.001  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.340631  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE1727  hypothetical protein  27.87 
 
 		 138 aa  44.3  0.001  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6182  OsmC family protein  26.92 
 
 		 176 aa  44.3  0.001  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.360981 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0042  OsmC family protein  29.73 
 
 		 142 aa  43.1  0.002  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1923  OsmC-like protein  32.08 
 
 		 127 aa  41.2  0.007  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7018  OsmC family protein  38.18 
 
 		 412 aa  41.2  0.008  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00716876 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1832  OsmC-like protein  25.25 
 
 		 133 aa  41.2  0.008  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_2031  OsmC family protein  29.92 
 
 		 138 aa  41.2  0.008  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.650355  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0921  OsmC family protein  39.22 
 
 		 136 aa  40.8  0.009  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.418667  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>