74 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Daci_1058 on replicon NC_010002
Organism: Delftia acidovorans SPH-1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010002  Daci_1058  OsmC family protein  100 
 
 		 200 aa  406  1.0000000000000001e-112  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.333829 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7506  hypothetical protein  60.23 
 
 		 188 aa  200  9e-51  Burkholderia sp. 383  Bacteria  hitchhiker  0.000000000101926  normal  0.551931 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1255  OsmC-like protein  59.2 
 
 		 176 aa  196  3e-49  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.340631  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6577  OsmC family protein  59.2 
 
 		 176 aa  196  3e-49  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6182  OsmC family protein  59.2 
 
 		 176 aa  196  3e-49  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.360981 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0206  OsmC family protein  40.59 
 
 		 174 aa  104  1e-21  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.338673  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3865  OsmC family protein  40.57 
 
 		 175 aa  97.1  2e-19  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.745195  normal  0.175914 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3526  OsmC family protein  36.03 
 
 		 177 aa  81.6  0.000000000000006  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.7407  normal  0.298467 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0339  OsmC family protein  35.48 
 
 		 145 aa  76.6  0.0000000000002  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.53983  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2505  OsmC family protein  37.5 
 
 		 147 aa  74.7  0.0000000000008  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2354  OsmC-like protein  36.75 
 
 		 170 aa  73.6  0.000000000002  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.572746  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0443  OsmC-like protein  31.93 
 
 		 176 aa  73.6  0.000000000002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.16081  n/a   
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_6160  OsmC family protein  32.74 
 
 		 182 aa  60.8  0.00000001  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.76501  normal  1 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6453  OsmC family protein  32.74 
 
 		 182 aa  60.5  0.00000002  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.16719  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4895  OsmC-like protein  30.51 
 
 		 184 aa  59.7  0.00000003  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3268  OsmC family protein  30.51 
 
 		 184 aa  59.7  0.00000003  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  0.200885 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5247  OsmC family protein  30.09 
 
 		 187 aa  59.3  0.00000004  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.402263 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1348  OsmC family protein  30.53 
 
 		 151 aa  58.9  0.00000004  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008545  Bcen2424_6912  OsmC family protein  30.51 
 
 		 184 aa  59.3  0.00000004  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4432  OsmC family protein  30.77 
 
 		 184 aa  58.2  0.00000009  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.670087  normal  1 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3421  OsmC family protein  30.77 
 
 		 184 aa  58.2  0.00000009  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.320541  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1978  OsmC family protein  27.88 
 
 		 186 aa  56.6  0.0000002  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1892  OsmC-like protein  27.21 
 
 		 148 aa  56.2  0.0000003  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0235  OsmC family protein  29.66 
 
 		 147 aa  55.5  0.0000005  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1143  OsmC family protein  27.56 
 
 		 142 aa  53.9  0.000001  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  decreased coverage  0.00000523467  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4264  hypothetical protein  27.88 
 
 		 184 aa  54.3  0.000001  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1644  OsmC family protein  29.75 
 
 		 193 aa  53.9  0.000001  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1026  OsmC family protein  28.8 
 
 		 206 aa  54.3  0.000001  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3485  OsmC family protein  32.67 
 
 		 185 aa  53.5  0.000002  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2570  OsmC family protein  27.67 
 
 		 187 aa  53.1  0.000002  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4668  OsmC family protein  33.58 
 
 		 183 aa  52.8  0.000003  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.35857  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1075  OsmC family protein  27.56 
 
 		 142 aa  53.1  0.000003  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1071  OsmC family protein  27.56 
 
 		 142 aa  53.1  0.000003  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.0000000601559  normal  1 
 
 
-
 
NC_008545  Bcen2424_6854  OsmC family protein  26.92 
 
 		 186 aa  51.6  0.000007  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.521419  n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0586  OsmC family protein  27.48 
 
 		 179 aa  51.6  0.000007  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  0.128993  normal  0.0133234 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3793  OsmC family protein  32 
 
 		 185 aa  51.6  0.000008  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.242728 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0897  OsmC family protein  27.97 
 
 		 145 aa  51.6  0.000009  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.669017  normal  1 
 
 
-
 
NC_002967  TDE1727  hypothetical protein  28.95 
 
 		 138 aa  51.2  0.000009  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_04790  OsmC family protein  25.56 
 
 		 144 aa  50.8  0.00001  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0304  hypothetical protein  28.29 
 
 		 190 aa  50.1  0.00002  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.119499 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1310  OsmC family protein  32.12 
 
 		 183 aa  49.7  0.00003  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.47097  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3867  OsmC family protein  32 
 
 		 185 aa  49.7  0.00003  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.0319528 
 
 
-
 
NC_004347  SO_3495  hypothetical protein  26.77 
 
 		 142 aa  49.3  0.00004  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_2325  OsmC family protein  32.71 
 
 		 180 aa  48.9  0.00005  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1151  OsmC family protein  32.12 
 
 		 183 aa  48.5  0.00007  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.824502  normal  0.359642 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3413  OsmC family protein  28.1 
 
 		 171 aa  48.1  0.00009  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1904  OsmC family protein  22.92 
 
 		 193 aa  47  0.0002  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.576095  unclonable  0.00000937306 
 
 
-
 
NC_011885  Cyan7425_0190  OsmC family protein  25 
 
 		 189 aa  47.4  0.0002  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  n/a    normal  0.155362 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0969  OsmC family protein  25.61 
 
 		 182 aa  46.2  0.0003  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  0.298439 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0441  OsmC family protein  24.56 
 
 		 189 aa  46.2  0.0003  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.488218  normal  0.432032 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5957  OsmC family protein  30.17 
 
 		 190 aa  45.8  0.0005  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2836  OsmC family protein  29.08 
 
 		 177 aa  45.4  0.0005  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2794  OsmC family protein  26.19 
 
 		 142 aa  45.4  0.0005  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1865  OsmC family protein  39.66 
 
 		 185 aa  45.4  0.0005  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.128326  normal  1 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0541  OsmC family protein  31.5 
 
 		 151 aa  45.1  0.0007  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.489752  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2788  hypothetical protein  27.1 
 
 		 186 aa  44.7  0.0008  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2612  OsmC family protein  27.1 
 
 		 208 aa  44.7  0.0008  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.43183 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_13840  predicted redox protein, regulator of disulfide bond formation  24.6 
 
 		 145 aa  45.1  0.0008  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5418  hypothetical protein  26.19 
 
 		 180 aa  44.7  0.0009  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2484  OsmC family protein  30.99 
 
 		 133 aa  44.3  0.001  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  0.092178 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1639  OsmC family protein  29.29 
 
 		 167 aa  43.9  0.001  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.945103  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2488  OsmC family protein  26.61 
 
 		 172 aa  43.9  0.001  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.0230337  normal  0.160295 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7018  OsmC family protein  24.37 
 
 		 412 aa  43.5  0.002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00716876 
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0623  hypothetical protein  27.45 
 
 		 176 aa  42.7  0.003  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  decreased coverage  0.0005983  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3965  OsmC family protein  36.84 
 
 		 132 aa  42.7  0.003  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1127  OsmC family protein  25.9 
 
 		 168 aa  43.1  0.003  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  0.938023 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2175  OsmC-like protein  26.95 
 
 		 185 aa  43.1  0.003  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.416909  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0982  OsmC family protein  35.19 
 
 		 127 aa  42.4  0.004  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1670  OsmC family protein  23.73 
 
 		 156 aa  42.4  0.005  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.0539264  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4791  OsmC family protein  29.36 
 
 		 187 aa  41.6  0.007  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.361207  normal  0.435509 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_2212  OsmC family protein  27.85 
 
 		 159 aa  41.6  0.008  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1436  OsmC family protein  26.09 
 
 		 134 aa  41.6  0.008  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0693  OsmC-like protein  25.24 
 
 		 168 aa  41.6  0.009  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4851  OsmC-like protein  28.21 
 
 		 187 aa  41.2  0.009  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.137347 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>