91 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene BBta_5418 on replicon NC_009485
Organism: Bradyrhizobium sp. BTAi1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009485  BBta_5418  hypothetical protein  100 
 
 
180 aa  366  1e-101  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2612  OsmC family protein  85.56 
 
 
208 aa  319  9.999999999999999e-87  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal  0.43183 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0304  hypothetical protein  74.42 
 
 
190 aa  270  8.000000000000001e-72  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal  0.119499 
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0623  hypothetical protein  71.51 
 
 
176 aa  245  2e-64  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  decreased coverage  0.0005983  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3793  OsmC family protein  56.67 
 
 
185 aa  211  4.9999999999999996e-54  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal  0.242728 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3485  OsmC family protein  56.67 
 
 
185 aa  207  5e-53  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3867  OsmC family protein  60.49 
 
 
185 aa  205  3e-52  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal  0.0319528 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2836  OsmC family protein  60 
 
 
177 aa  204  4e-52  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0969  OsmC family protein  56.18 
 
 
182 aa  201  5e-51  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  normal  0.298439 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_2212  OsmC family protein  64.29 
 
 
159 aa  201  6e-51  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0039  OsmC-like protein  59.39 
 
 
179 aa  199  9.999999999999999e-51  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4668  OsmC family protein  40.11 
 
 
183 aa  142  3e-33  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.35857  normal 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1151  OsmC family protein  40.11 
 
 
183 aa  140  7e-33  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.824502  normal  0.359642 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1310  OsmC family protein  40.11 
 
 
183 aa  139  1.9999999999999998e-32  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.47097  normal 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2175  OsmC-like protein  40.68 
 
 
185 aa  137  7e-32  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.416909  normal 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4851  OsmC-like protein  39.43 
 
 
187 aa  126  1.0000000000000001e-28  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal  0.137347 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0586  OsmC family protein  38.65 
 
 
179 aa  93.2  2e-18  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  0.128993  normal  0.0133234 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0339  OsmC family protein  34.27 
 
 
145 aa  82  0.000000000000004  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.53983  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4791  OsmC family protein  41.59 
 
 
187 aa  79.3  0.00000000000003  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.361207  normal  0.435509 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5247  OsmC family protein  38.79 
 
 
187 aa  77  0.0000000000001  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal  0.402263 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0441  OsmC family protein  38.79 
 
 
189 aa  75.9  0.0000000000003  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.488218  normal  0.432032 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2788  hypothetical protein  37.5 
 
 
186 aa  75.1  0.0000000000005  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2505  OsmC family protein  36.96 
 
 
147 aa  74.7  0.0000000000006  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1978  OsmC family protein  34.29 
 
 
186 aa  74.7  0.0000000000006  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_6160  OsmC family protein  37.17 
 
 
182 aa  72.4  0.000000000003  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.76501  normal 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6453  OsmC family protein  37.17 
 
 
182 aa  72  0.000000000004  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.16719  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4264  hypothetical protein  32.22 
 
 
184 aa  72  0.000000000005  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1026  OsmC family protein  37.61 
 
 
206 aa  70.1  0.00000000002  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2570  OsmC family protein  38.18 
 
 
187 aa  68.6  0.00000000005  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1644  OsmC family protein  34.48 
 
 
193 aa  67.8  0.00000000007  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0443  OsmC-like protein  31.25 
 
 
176 aa  67.8  0.00000000008  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.16081  n/a   
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4895  OsmC-like protein  37.17 
 
 
184 aa  66.2  0.0000000002  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1670  OsmC family protein  28.87 
 
 
156 aa  66.2  0.0000000002  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.0539264  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3268  OsmC family protein  37.17 
 
 
184 aa  66.2  0.0000000002  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal  0.200885 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_2325  OsmC family protein  31.25 
 
 
180 aa  66.2  0.0000000003  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3421  OsmC family protein  37.17 
 
 
184 aa  65.1  0.0000000005  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.320541  normal 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4432  OsmC family protein  37.17 
 
 
184 aa  65.1  0.0000000005  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.670087  normal 
 
 
-
 
NC_011885  Cyan7425_0190  OsmC family protein  33.64 
 
 
189 aa  65.1  0.0000000005  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  n/a    normal  0.155362 
 
 
-
 
NC_008545  Bcen2424_6912  OsmC family protein  37.17 
 
 
184 aa  64.7  0.0000000006  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008545  Bcen2424_6854  OsmC family protein  32.14 
 
 
186 aa  65.1  0.0000000006  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.521419  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2488  hypothetical protein  27.47 
 
 
202 aa  64.3  0.0000000009  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2100  OsmC family protein  32.43 
 
 
185 aa  64.3  0.0000000009  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3413  OsmC family protein  39.64 
 
 
171 aa  63.9  0.000000001  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0235  OsmC family protein  34.78 
 
 
147 aa  62  0.000000005  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_07015  hypothetical protein  27.59 
 
 
181 aa  58.9  0.00000003  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1865  OsmC family protein  32.48 
 
 
185 aa  57.4  0.0000001  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.128326  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2488  OsmC family protein  35 
 
 
172 aa  56.6  0.0000002  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.0230337  normal  0.160295 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3526  OsmC family protein  28.8 
 
 
177 aa  56.6  0.0000002  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.7407  normal  0.298467 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_04790  OsmC family protein  34.31 
 
 
144 aa  55.5  0.0000004  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_13840  predicted redox protein, regulator of disulfide bond formation  27.59 
 
 
145 aa  55.1  0.0000005  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3848  OsmC family protein  30.77 
 
 
181 aa  55.1  0.0000005  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.323457  normal 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2354  OsmC-like protein  33.63 
 
 
170 aa  54.7  0.0000007  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.572746  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6241  OsmC family protein  27.5 
 
 
182 aa  54.7  0.0000007  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0196837  normal  0.733472 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1904  OsmC family protein  29.73 
 
 
193 aa  54.7  0.0000008  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.576095  unclonable  0.00000937306 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1348  OsmC family protein  31.58 
 
 
151 aa  54.3  0.0000009  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_3231  OsmC family protein  26.35 
 
 
163 aa  52  0.000004  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_4241  OsmC family protein  27.35 
 
 
202 aa  51.2  0.000007  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002967  TDE1270  hypothetical protein  28.78 
 
 
144 aa  50.4  0.00001  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  hitchhiker  0.00225413  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5957  OsmC family protein  30.17 
 
 
190 aa  50.4  0.00001  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1892  OsmC-like protein  30.56 
 
 
148 aa  50.4  0.00001  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2254  OsmC-like protein  32.05 
 
 
199 aa  46.2  0.0003  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.0977605  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1950  OsmC family protein  25 
 
 
132 aa  45.8  0.0003  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.378128  normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0921  OsmC family protein  33.78 
 
 
136 aa  45.8  0.0003  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.418667  normal 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0897  OsmC family protein  26.5 
 
 
145 aa  45.1  0.0006  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.669017  normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1058  OsmC family protein  26.19 
 
 
200 aa  44.7  0.0007  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal  0.333829 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_2031  OsmC family protein  27.03 
 
 
138 aa  44.7  0.0008  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.650355  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2794  OsmC family protein  25 
 
 
142 aa  44.3  0.0009  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1440  OsmC family protein  31.43 
 
 
142 aa  44.3  0.001  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6635  OsmC family protein  42.59 
 
 
411 aa  43.5  0.001  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.659004  hitchhiker  0.00000360166 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1923  OsmC-like protein  28.7 
 
 
127 aa  43.9  0.001  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3007  OsmC family protein  24.14 
 
 
146 aa  43.1  0.002  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1919  OsmC family protein  35.82 
 
 
131 aa  43.5  0.002  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.148561  normal 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0908  OsmC-like protein  23.44 
 
 
130 aa  43.1  0.002  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1390  OsmC family protein  23.44 
 
 
130 aa  43.1  0.002  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.51882  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4533  OsmC-like protein  27.35 
 
 
130 aa  43.5  0.002  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.257374 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1917  OsmC family protein  29.06 
 
 
130 aa  43.1  0.002  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.591016  normal  0.655521 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1368  OsmC family protein  23.44 
 
 
130 aa  42.7  0.003  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.0210899 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1127  OsmC family protein  29.55 
 
 
168 aa  42.4  0.003  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal  0.938023 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1267  OsmC family protein  24.22 
 
 
130 aa  42.7  0.003  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0042  OsmC family protein  29.36 
 
 
142 aa  42  0.004  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1957  OsmC family protein  22.33 
 
 
201 aa  42  0.005  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  normal  0.226046 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1255  OsmC-like protein  27.59 
 
 
176 aa  42  0.005  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.340631  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6577  OsmC family protein  27.59 
 
 
176 aa  42  0.005  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1301  OsmC family protein  24.22 
 
 
130 aa  42  0.005  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal  0.0499071 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6182  OsmC family protein  27.59 
 
 
176 aa  42  0.005  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.360981 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4175  hypothetical protein  27.55 
 
 
135 aa  41.6  0.007  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.214068  n/a   
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7506  hypothetical protein  27.59 
 
 
188 aa  41.2  0.007  Burkholderia sp. 383  Bacteria  hitchhiker  0.000000000101926  normal  0.551931 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_2206  OsmC family protein  30.93 
 
 
168 aa  41.2  0.008  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  normal  0.742376 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1595  OsmC family protein  40 
 
 
134 aa  41.2  0.008  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2818  OsmC-like protein  30.58 
 
 
138 aa  40.8  0.009  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7018  OsmC family protein  31.25 
 
 
412 aa  41.2  0.009  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00716876 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>