123 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dred_3231 on replicon NC_009253
Organism: Desulfotomaculum reducens MI-1



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009253  Dred_3231  OsmC family protein  100 
 
 		 163 aa  328  2e-89  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0586  OsmC family protein  34.13 
 
 		 179 aa  97.4  7e-20  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  0.128993  normal  0.0133234 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2788  hypothetical protein  34.36 
 
 		 186 aa  89.4  2e-17  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0441  OsmC family protein  32.32 
 
 		 189 aa  89.4  2e-17  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.488218  normal  0.432032 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2488  hypothetical protein  29.88 
 
 		 202 aa  86.3  2e-16  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0339  OsmC family protein  32.84 
 
 		 145 aa  86.3  2e-16  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.53983  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1865  OsmC family protein  35.17 
 
 		 185 aa  86.3  2e-16  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.128326  normal  1 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_2325  OsmC family protein  28.66 
 
 		 180 aa  82.4  0.000000000000002  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5247  OsmC family protein  28.81 
 
 		 187 aa  82.4  0.000000000000002  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.402263 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4791  OsmC family protein  28.25 
 
 		 187 aa  80.1  0.00000000000001  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.361207  normal  0.435509 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2354  OsmC-like protein  34.09 
 
 		 170 aa  78.6  0.00000000000004  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.572746  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1026  OsmC family protein  28.74 
 
 		 206 aa  76.6  0.0000000000001  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2570  OsmC family protein  29.88 
 
 		 187 aa  77  0.0000000000001  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011885  Cyan7425_0190  OsmC family protein  30.36 
 
 		 189 aa  75.5  0.0000000000003  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  n/a    normal  0.155362 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1348  OsmC family protein  30.66 
 
 		 151 aa  74.3  0.0000000000006  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_4241  OsmC family protein  29.88 
 
 		 202 aa  73.9  0.0000000000008  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008545  Bcen2424_6912  OsmC family protein  26.16 
 
 		 184 aa  72.8  0.000000000002  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1644  OsmC family protein  27.27 
 
 		 193 aa  71.6  0.000000000004  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4895  OsmC-like protein  26.16 
 
 		 184 aa  71.6  0.000000000004  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3268  OsmC family protein  26.16 
 
 		 184 aa  71.6  0.000000000004  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  0.200885 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_04790  OsmC family protein  33.98 
 
 		 144 aa  70.5  0.000000000009  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2100  OsmC family protein  28.74 
 
 		 185 aa  70.5  0.000000000009  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5957  OsmC family protein  26.06 
 
 		 190 aa  69.7  0.00000000001  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0443  OsmC-like protein  30.67 
 
 		 176 aa  69.7  0.00000000002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.16081  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0235  OsmC family protein  36.28 
 
 		 147 aa  69.7  0.00000000002  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4264  hypothetical protein  25 
 
 		 184 aa  68.9  0.00000000003  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4432  OsmC family protein  25.95 
 
 		 184 aa  67.4  0.00000000009  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.670087  normal  1 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3421  OsmC family protein  25.95 
 
 		 184 aa  67.4  0.00000000009  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.320541  normal  1 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2254  OsmC-like protein  26.22 
 
 		 199 aa  66.6  0.0000000001  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.0977605  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2505  OsmC family protein  29.1 
 
 		 147 aa  67  0.0000000001  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1892  OsmC-like protein  29.93 
 
 		 148 aa  65.9  0.0000000002  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6453  OsmC family protein  26.44 
 
 		 182 aa  64.7  0.0000000006  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.16719  normal  1 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_6160  OsmC family protein  32.74 
 
 		 182 aa  64.3  0.0000000007  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.76501  normal  1 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2054  OsmC family protein  31.33 
 
 		 164 aa  63.5  0.000000001  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  0.778931 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_13840  predicted redox protein, regulator of disulfide bond formation  29.41 
 
 		 145 aa  62.8  0.000000002  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1978  OsmC family protein  24.71 
 
 		 186 aa  62  0.000000003  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3526  OsmC family protein  25.64 
 
 		 177 aa  62  0.000000004  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.7407  normal  0.298467 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0969  OsmC family protein  28.46 
 
 		 182 aa  59.3  0.00000002  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  0.298439 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_2212  OsmC family protein  32.5 
 
 		 159 aa  59.7  0.00000002  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008545  Bcen2424_6854  OsmC family protein  25.9 
 
 		 186 aa  58.9  0.00000003  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.521419  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1670  OsmC family protein  30.43 
 
 		 156 aa  58.2  0.00000005  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.0539264  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0039  OsmC-like protein  27.34 
 
 		 179 aa  57  0.0000001  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0623  hypothetical protein  27.1 
 
 		 176 aa  57  0.0000001  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  decreased coverage  0.0005983  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2612  OsmC family protein  26.58 
 
 		 208 aa  57  0.0000001  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.43183 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2488  OsmC family protein  31.37 
 
 		 172 aa  55.8  0.0000002  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.0230337  normal  0.160295 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6241  OsmC family protein  23.26 
 
 		 182 aa  56.2  0.0000002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0196837  normal  0.733472 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3793  OsmC family protein  28.38 
 
 		 185 aa  54.7  0.0000005  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.242728 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3413  OsmC family protein  35.82 
 
 		 171 aa  54.3  0.0000006  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1310  OsmC family protein  28.93 
 
 		 183 aa  54.3  0.0000007  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.47097  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1151  OsmC family protein  31.4 
 
 		 183 aa  53.9  0.0000009  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.824502  normal  0.359642 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_1311  OsmC family protein  31.68 
 
 		 169 aa  53.5  0.000001  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  0.474766  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1206  OsmC family protein  33.33 
 
 		 413 aa  52.8  0.000002  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.423514  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE1270  hypothetical protein  27.69 
 
 		 144 aa  52.4  0.000003  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  hitchhiker  0.00225413  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0897  OsmC family protein  30.48 
 
 		 145 aa  52.4  0.000003  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.669017  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5418  hypothetical protein  26.35 
 
 		 180 aa  52  0.000003  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_07015  hypothetical protein  30.16 
 
 		 181 aa  52.4  0.000003  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4668  OsmC family protein  29.75 
 
 		 183 aa  52.4  0.000003  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.35857  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0304  hypothetical protein  26.53 
 
 		 190 aa  51.6  0.000005  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.119499 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4851  OsmC-like protein  27.89 
 
 		 187 aa  50.4  0.00001  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.137347 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2175  OsmC-like protein  28.46 
 
 		 185 aa  49.7  0.00002  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.416909  normal  1 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1917  OsmC family protein  29.55 
 
 		 130 aa  49.7  0.00002  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.591016  normal  0.655521 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3848  OsmC family protein  26.02 
 
 		 181 aa  48.9  0.00003  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.323457  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4103  OsmC family protein  23.91 
 
 		 402 aa  48.9  0.00003  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.671514  normal  1 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_2031  OsmC family protein  24.74 
 
 		 138 aa  48.5  0.00004  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.650355  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4769  OsmC family protein  31.9 
 
 		 153 aa  48.5  0.00004  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  hitchhiker  0.00807264  hitchhiker  0.00049584 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3485  OsmC family protein  26.32 
 
 		 185 aa  47.8  0.00007  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3867  OsmC family protein  27.03 
 
 		 185 aa  47.8  0.00007  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.0319528 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2484  OsmC family protein  39.19 
 
 		 133 aa  47.4  0.00008  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  0.092178 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0941  OsmC family protein  29.55 
 
 		 409 aa  47.4  0.00009  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.3755  normal  0.451532 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2717  OsmC-like protein  28.75 
 
 		 135 aa  46.6  0.0001  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00712413 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0908  OsmC-like protein  28.41 
 
 		 130 aa  46.6  0.0001  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1390  OsmC family protein  28.41 
 
 		 130 aa  46.6  0.0001  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.51882  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0049  OsmC family protein  32.73 
 
 		 406 aa  47.4  0.0001  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1368  OsmC family protein  28.41 
 
 		 130 aa  46.6  0.0001  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.0210899 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1950  OsmC family protein  29.21 
 
 		 132 aa  47  0.0001  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.378128  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4533  OsmC-like protein  28.41 
 
 		 130 aa  46.2  0.0002  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.257374 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1832  OsmC-like protein  28.85 
 
 		 133 aa  46.6  0.0002  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1267  OsmC family protein  28.41 
 
 		 130 aa  46.2  0.0002  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1301  OsmC family protein  28.41 
 
 		 130 aa  45.8  0.0002  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.0499071 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7018  OsmC family protein  38.18 
 
 		 412 aa  45.4  0.0003  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00716876 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0428  hypothetical protein  32.61 
 
 		 144 aa  45.4  0.0003  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3145  redox protein regulator of disulfide bond formation, OsmC-like  30 
 
 		 132 aa  45.1  0.0004  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.102127 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0349  OsmC family protein  26.6 
 
 		 163 aa  45.4  0.0004  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1930  OsmC family protein  29.63 
 
 		 407 aa  45.4  0.0004  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.0101124  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1923  OsmC-like protein  40 
 
 		 127 aa  44.7  0.0005  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0921  OsmC family protein  37.25 
 
 		 136 aa  44.7  0.0005  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.418667  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1919  OsmC family protein  31.82 
 
 		 131 aa  44.7  0.0006  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.148561  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3655  OsmC family protein  26.96 
 
 		 410 aa  44.7  0.0006  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2873  hypothetical protein  24.65 
 
 		 405 aa  44.3  0.0007  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.326467  normal  0.0265941 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3762  OsmC family protein  26.96 
 
 		 410 aa  44.3  0.0007  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2193  OsmC family protein  26.36 
 
 		 129 aa  44.3  0.0007  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.208378  normal  1 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2280  OsmC-like protein  33.96 
 
 		 406 aa  43.5  0.001  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  0.423404 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_4048  OsmC family protein  32.08 
 
 		 415 aa  43.5  0.001  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  unclonable  0.0000134708  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0982  OsmC family protein  28.57 
 
 		 127 aa  43.9  0.001  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0862  OsmC family protein  26.74 
 
 		 173 aa  43.5  0.001  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.219925  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1231  OsmC family protein  34.09 
 
 		 139 aa  43.9  0.001  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  hitchhiker  0.0000016936  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2836  OsmC family protein  30.53 
 
 		 177 aa  43.1  0.001  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0097  OsmC-like protein  29.13 
 
 		 143 aa  42.7  0.002  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1673  OsmC-like protein  28.1 
 
 		 409 aa  42.7  0.002  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1436  OsmC family protein  25 
 
 		 134 aa  43.1  0.002  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>