15 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Msed_1311 on replicon NC_009440
Organism: Metallosphaera sedula DSM 5348



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009440  Msed_1311  OsmC family protein  100 
 
 		 169 aa  345  2e-94  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  0.474766  normal  1 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_3231  OsmC family protein  31.68 
 
 		 163 aa  53.5  0.000001  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1670  OsmC family protein  27.86 
 
 		 156 aa  53.9  0.000001  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.0539264  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0862  OsmC family protein  24.26 
 
 		 173 aa  50.4  0.00001  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.219925  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1923  OsmC-like protein  33.03 
 
 		 127 aa  48.9  0.00004  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2570  OsmC family protein  27.34 
 
 		 187 aa  46.2  0.0002  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2488  hypothetical protein  26.27 
 
 		 202 aa  45.1  0.0005  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2488  OsmC family protein  25.93 
 
 		 172 aa  44.3  0.0007  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.0230337  normal  0.160295 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4791  OsmC family protein  26.06 
 
 		 187 aa  44.3  0.001  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.361207  normal  0.435509 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1301  OsmC family protein  28.3 
 
 		 130 aa  42  0.004  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.0499071 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1644  OsmC family protein  24.6 
 
 		 193 aa  41.6  0.005  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1267  OsmC family protein  28.3 
 
 		 130 aa  41.6  0.006  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_17941  hypothetical protein  25.53 
 
 		 122 aa  41.2  0.006  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  0.758447  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0974  OsmC family protein  26.96 
 
 		 128 aa  41.6  0.006  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.637714  normal  0.331477 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0339  OsmC family protein  19.25 
 
 		 145 aa  40.8  0.009  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.53983  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>