More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene GM21_3762 on replicon NC_012918
Organism: Geobacter sp. M21



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011146  Gbem_3655  OsmC family protein  97.07 
 
 		 410 aa  795    Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3762  OsmC family protein  100 
 
 		 410 aa  840    Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_4048  OsmC family protein  59.31 
 
 		 415 aa  494  1e-139  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  unclonable  0.0000134708  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1206  OsmC family protein  53.61 
 
 		 413 aa  449  1e-125  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.423514  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7018  OsmC family protein  54.68 
 
 		 412 aa  424  1e-117  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00716876 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_12698  hypothetical protein  48.66 
 
 		 405 aa  411  1e-113  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0941  OsmC family protein  51.32 
 
 		 409 aa  396  1e-109  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.3755  normal  0.451532 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4103  OsmC family protein  49.14 
 
 		 402 aa  393  1e-108  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.671514  normal  1 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2280  OsmC-like protein  51.46 
 
 		 406 aa  390  1e-107  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  0.423404 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2694  OsmC-like protein  50.37 
 
 		 406 aa  387  1e-106  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3633  OsmC-like protein  51.21 
 
 		 406 aa  380  1e-104  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.525721 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1835  OsmC-like protein  50.49 
 
 		 407 aa  381  1e-104  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2873  hypothetical protein  51.08 
 
 		 405 aa  376  1e-103  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.326467  normal  0.0265941 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1777  OsmC-like protein  47.92 
 
 		 410 aa  373  1e-102  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.0113862  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1673  OsmC-like protein  49.76 
 
 		 409 aa  372  1e-102  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1930  OsmC family protein  50.97 
 
 		 407 aa  372  1e-102  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.0101124  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1013  OsmC-like protein  49.64 
 
 		 423 aa  374  1e-102  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.325781  normal  1 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5571  OsmC family protein  47.33 
 
 		 408 aa  368  1e-101  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.0439292 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1840  hypothetical protein  48.08 
 
 		 405 aa  363  3e-99  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  0.949047 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0049  OsmC family protein  47.17 
 
 		 406 aa  358  7e-98  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5429  OsmC family protein  43.9 
 
 		 397 aa  320  3e-86  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6635  OsmC family protein  44.1 
 
 		 411 aa  311  2e-83  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.659004  hitchhiker  0.00000360166 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_6150  OsmC family protein  48.36 
 
 		 408 aa  305  1.0000000000000001e-81  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.773624  normal  1 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6443  OsmC family protein  47.61 
 
 		 408 aa  298  8e-80  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.588479  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0979  OsmC family protein  44.12 
 
 		 418 aa  293  4e-78  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3394  hypothetical protein  51.2 
 
 		 251 aa  254  2.0000000000000002e-66  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.689408  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2450  hypothetical protein  46.85 
 
 		 258 aa  248  2e-64  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl0227  hypothetical protein  50.39 
 
 		 257 aa  238  1e-61  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp0226  hypothetical protein  50.39 
 
 		 257 aa  233  4.0000000000000004e-60  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_3055  OsmC-like family protein  47.62 
 
 		 255 aa  223  6e-57  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0403  OsmC family protein  50.39 
 
 		 259 aa  218  2e-55  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1127  putative redox protein  43.43 
 
 		 256 aa  209  1e-52  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1911  hydrolase of the alpha/beta superfamily protein  43.97 
 
 		 259 aa  204  3e-51  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.0630248  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3247  putative redox protein  44.18 
 
 		 250 aa  202  8e-51  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.184697  normal  1 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0234  alpha/beta hydrolase fold protein  40.78 
 
 		 256 aa  194  2e-48  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  0.104073 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2961  OsmC-like family protein  42.8 
 
 		 250 aa  192  9e-48  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.0745233  normal  0.293641 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1200  putative redox protein  43.29 
 
 		 256 aa  191  2e-47  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000020196 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2376  putative redox protein  38.65 
 
 		 259 aa  187  3e-46  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1067  hypothetical protein  51.01 
 
 		 145 aa  154  2e-36  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.0889291  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4769  OsmC family protein  51.05 
 
 		 153 aa  145  1e-33  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  hitchhiker  0.00807264  hitchhiker  0.00049584 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2717  OsmC-like protein  45.59 
 
 		 135 aa  120  4.9999999999999996e-26  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00712413 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_48750  hypothetical protein  40.14 
 
 		 135 aa  111  2.0000000000000002e-23  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000274485 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4175  hypothetical protein  40.85 
 
 		 135 aa  110  4.0000000000000004e-23  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.214068  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1950  OsmC family protein  40 
 
 		 132 aa  109  9.000000000000001e-23  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.378128  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3145  redox protein regulator of disulfide bond formation, OsmC-like  41.84 
 
 		 132 aa  105  1e-21  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.102127 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1856  OsmC family protein  37.23 
 
 		 129 aa  103  5e-21  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.610023  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1403  OsmC family protein  40.88 
 
 		 132 aa  102  1e-20  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0655694  normal  0.111545 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1440  OsmC family protein  42.02 
 
 		 142 aa  101  2e-20  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3491  OsmC family protein  35.97 
 
 		 131 aa  101  3e-20  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1082  OsmC-like family protein  38.03 
 
 		 141 aa  99.8  7e-20  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.0521945  normal  0.207247 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1917  OsmC family protein  43.09 
 
 		 130 aa  99.8  7e-20  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.591016  normal  0.655521 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1368  OsmC family protein  42.98 
 
 		 130 aa  99  1e-19  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.0210899 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0908  OsmC-like protein  42.98 
 
 		 130 aa  99  1e-19  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1267  OsmC family protein  42.98 
 
 		 130 aa  99.4  1e-19  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1390  OsmC family protein  42.98 
 
 		 130 aa  99  1e-19  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.51882  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4533  OsmC-like protein  41.46 
 
 		 130 aa  98.2  2e-19  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.257374 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1301  OsmC family protein  42.98 
 
 		 130 aa  99  2e-19  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.0499071 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0921  OsmC family protein  43.33 
 
 		 136 aa  99  2e-19  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.418667  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0974  OsmC family protein  40 
 
 		 128 aa  96.7  7e-19  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.637714  normal  0.331477 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1923  OsmC-like protein  41.18 
 
 		 127 aa  96.7  7e-19  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1438  OsmC family protein  37.86 
 
 		 137 aa  93.6  5e-18  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.139134 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4937  OsmC family protein  41.67 
 
 		 133 aa  93.6  6e-18  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.659641 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1919  OsmC family protein  40.6 
 
 		 131 aa  92.8  9e-18  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.148561  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0982  OsmC family protein  41.61 
 
 		 127 aa  92.4  1e-17  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2297  OsmC-like protein  40.77 
 
 		 133 aa  91.7  2e-17  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.922047  normal  0.948773 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3725  OsmC family protein  40 
 
 		 133 aa  92  2e-17  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.196532 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4564  OsmC-like protein  40 
 
 		 133 aa  92  2e-17  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3799  OsmC family protein  40 
 
 		 133 aa  92  2e-17  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.732158  normal  0.104892 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0732  OsmC family protein  40.77 
 
 		 137 aa  90.9  4e-17  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.560509  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2658  OsmC family protein  39.57 
 
 		 133 aa  87.4  4e-16  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.653298  normal  0.498397 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_5525  OsmC family protein  39.84 
 
 		 133 aa  86.3  8e-16  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_1423  hypothetical protein  40.46 
 
 		 133 aa  85.1  0.000000000000002  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0240  hypothetical protein  40.46 
 
 		 133 aa  85.1  0.000000000000002  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0949  hydrolase  40.46 
 
 		 133 aa  84.7  0.000000000000002  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2657  putative hydrolase  40.46 
 
 		 133 aa  85.1  0.000000000000002  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3689  OsmC family protein  39.06 
 
 		 133 aa  85.1  0.000000000000002  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.952273 
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2518  hypothetical protein  40.46 
 
 		 133 aa  85.1  0.000000000000002  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.0608844  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0518  OsmC-like protein superfamily protein  39.69 
 
 		 153 aa  84.3  0.000000000000003  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2484  OsmC family protein  33.08 
 
 		 133 aa  82.8  0.00000000000001  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  0.092178 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_3616  osmotically inducible protein  41.58 
 
 		 129 aa  78.6  0.0000000000002  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000818818  normal  1 
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1619  hypothetical protein  38.93 
 
 		 129 aa  77  0.0000000000005  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0276  hypothetical protein  38.93 
 
 		 129 aa  77  0.0000000000005  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2193  OsmC family protein  41.28 
 
 		 129 aa  76.6  0.0000000000007  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.208378  normal  1 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5556  OsmC-like protein  39.25 
 
 		 130 aa  76.3  0.0000000000009  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  hitchhiker  0.0000078778  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1628  OsmC-like protein  31.54 
 
 		 138 aa  76.3  0.000000000001  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0181271 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3965  OsmC family protein  35.48 
 
 		 132 aa  73.6  0.000000000007  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0929  putative hydrolase  25.2 
 
 		 252 aa  72.8  0.000000000009  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.119531  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2142  OsmC family protein  34.09 
 
 		 129 aa  72  0.00000000002  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1279  dipeptidyl aminopeptidase/acylaminoacyl-peptidase-like protein  31.54 
 
 		 261 aa  71.6  0.00000000003  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.000359236  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1578  dienelactone hydrolase  25.11 
 
 		 255 aa  70.1  0.00000000007  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2898  OsmC-like protein  34.29 
 
 		 135 aa  66.6  0.0000000007  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.533642 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0251  OsmC family protein  32.43 
 
 		 134 aa  66.2  0.000000001  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.798103  normal  0.164531 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0376  hypothetical protein  32.03 
 
 		 134 aa  65.9  0.000000001  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0601  dienelactone hydrolase  25 
 
 		 259 aa  65.1  0.000000002  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0232  OsmC family protein  33.33 
 
 		 134 aa  65.1  0.000000002  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002967  TDE1727  hypothetical protein  42.37 
 
 		 138 aa  62.4  0.00000001  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1832  OsmC-like protein  31.9 
 
 		 133 aa  60.8  0.00000004  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3928  hypothetical protein  28.12 
 
 		 728 aa  60.5  0.00000005  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2505  OsmC family protein  27.56 
 
 		 147 aa  60.1  0.00000008  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1146  hypothetical protein  27.59 
 
 		 732 aa  59.7  0.00000008  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.202327  normal  0.214349 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>