More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rmar_1206 on replicon NC_013501
Organism: Rhodothermus marinus DSM 4252



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013501  Rmar_1206  OsmC family protein  100 
 
 		 413 aa  841    Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.423514  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_4048  OsmC family protein  56.39 
 
 		 415 aa  464  1e-129  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  unclonable  0.0000134708  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3762  OsmC family protein  53.61 
 
 		 410 aa  428  1e-119  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3655  OsmC family protein  52.88 
 
 		 410 aa  423  1e-117  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0941  OsmC family protein  56.04 
 
 		 409 aa  424  1e-117  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.3755  normal  0.451532 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5571  OsmC family protein  50.12 
 
 		 408 aa  397  1e-109  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.0439292 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7018  OsmC family protein  52.58 
 
 		 412 aa  392  1e-108  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00716876 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0049  OsmC family protein  51.33 
 
 		 406 aa  391  1e-107  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2280  OsmC-like protein  52.23 
 
 		 406 aa  385  1e-106  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  0.423404 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2694  OsmC-like protein  50.99 
 
 		 406 aa  383  1e-105  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2873  hypothetical protein  51.58 
 
 		 405 aa  380  1e-104  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.326467  normal  0.0265941 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_12698  hypothetical protein  44.04 
 
 		 405 aa  378  1e-103  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1673  OsmC-like protein  50.36 
 
 		 409 aa  373  1e-102  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1930  OsmC family protein  49.88 
 
 		 407 aa  369  1e-101  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.0101124  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1835  OsmC-like protein  49.4 
 
 		 407 aa  367  1e-100  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3633  OsmC-like protein  49.4 
 
 		 406 aa  363  2e-99  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.525721 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4103  OsmC family protein  45.97 
 
 		 402 aa  363  4e-99  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.671514  normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1840  hypothetical protein  49.51 
 
 		 405 aa  357  2.9999999999999997e-97  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  0.949047 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1013  OsmC-like protein  47.22 
 
 		 423 aa  355  5.999999999999999e-97  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.325781  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1777  OsmC-like protein  48.08 
 
 		 410 aa  355  8.999999999999999e-97  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.0113862  normal  1 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5429  OsmC family protein  44.42 
 
 		 397 aa  318  1e-85  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0979  OsmC family protein  46.25 
 
 		 418 aa  296  7e-79  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6443  OsmC family protein  45.54 
 
 		 408 aa  280  2e-74  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.588479  normal  1 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_6150  OsmC family protein  45.3 
 
 		 408 aa  280  3e-74  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.773624  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6635  OsmC family protein  41.05 
 
 		 411 aa  268  1e-70  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.659004  hitchhiker  0.00000360166 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3394  hypothetical protein  51.24 
 
 		 251 aa  251  2e-65  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.689408  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2450  hypothetical protein  48.44 
 
 		 258 aa  248  2e-64  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp0226  hypothetical protein  51.6 
 
 		 257 aa  248  2e-64  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl0227  hypothetical protein  51.41 
 
 		 257 aa  247  3e-64  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1127  putative redox protein  45.6 
 
 		 256 aa  231  2e-59  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_3055  OsmC-like family protein  49.6 
 
 		 255 aa  229  6e-59  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1200  putative redox protein  45.22 
 
 		 256 aa  213  4.9999999999999996e-54  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000020196 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1911  hydrolase of the alpha/beta superfamily protein  40.39 
 
 		 259 aa  209  6e-53  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.0630248  normal  1 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0403  OsmC family protein  47.22 
 
 		 259 aa  202  7e-51  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0234  alpha/beta hydrolase fold protein  43.82 
 
 		 256 aa  201  1.9999999999999998e-50  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  0.104073 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3247  putative redox protein  41.7 
 
 		 250 aa  194  2e-48  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.184697  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2961  OsmC-like family protein  41.3 
 
 		 250 aa  192  1e-47  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.0745233  normal  0.293641 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2376  putative redox protein  37.2 
 
 		 259 aa  181  2e-44  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1067  hypothetical protein  56.25 
 
 		 145 aa  158  2e-37  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.0889291  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4769  OsmC family protein  46.81 
 
 		 153 aa  130  3e-29  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  hitchhiker  0.00807264  hitchhiker  0.00049584 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2717  OsmC-like protein  41.91 
 
 		 135 aa  119  9.999999999999999e-26  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00712413 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4175  hypothetical protein  46.76 
 
 		 135 aa  115  2.0000000000000002e-24  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.214068  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_48750  hypothetical protein  45.32 
 
 		 135 aa  109  1e-22  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000274485 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1438  OsmC family protein  42.86 
 
 		 137 aa  106  9e-22  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.139134 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1917  OsmC family protein  41.61 
 
 		 130 aa  103  8e-21  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.591016  normal  0.655521 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1082  OsmC-like family protein  35.76 
 
 		 141 aa  101  3e-20  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.0521945  normal  0.207247 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0982  OsmC family protein  42.96 
 
 		 127 aa  100  4e-20  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1950  OsmC family protein  35.86 
 
 		 132 aa  100  7e-20  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.378128  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4533  OsmC-like protein  40.88 
 
 		 130 aa  99.8  9e-20  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.257374 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3145  redox protein regulator of disulfide bond formation, OsmC-like  38.62 
 
 		 132 aa  99  1e-19  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.102127 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1923  OsmC-like protein  42.96 
 
 		 127 aa  98.6  2e-19  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1301  OsmC family protein  43.31 
 
 		 130 aa  96.7  7e-19  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.0499071 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0908  OsmC-like protein  41.94 
 
 		 130 aa  96.7  8e-19  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1368  OsmC family protein  41.94 
 
 		 130 aa  96.7  8e-19  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.0210899 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1390  OsmC family protein  41.94 
 
 		 130 aa  96.7  8e-19  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.51882  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1403  OsmC family protein  37.24 
 
 		 132 aa  95.5  1e-18  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0655694  normal  0.111545 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1267  OsmC family protein  39.42 
 
 		 130 aa  95.5  1e-18  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0601  dienelactone hydrolase  31.09 
 
 		 259 aa  94.4  4e-18  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3491  OsmC family protein  38.06 
 
 		 131 aa  94.4  4e-18  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0974  OsmC family protein  40.97 
 
 		 128 aa  93.6  6e-18  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.637714  normal  0.331477 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0921  OsmC family protein  43.07 
 
 		 136 aa  92.8  1e-17  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.418667  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2658  OsmC family protein  41.43 
 
 		 133 aa  91.7  2e-17  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.653298  normal  0.498397 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1440  OsmC family protein  38.69 
 
 		 142 aa  89.4  1e-16  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1578  dienelactone hydrolase  26.32 
 
 		 255 aa  85.9  0.000000000000001  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1279  dipeptidyl aminopeptidase/acylaminoacyl-peptidase-like protein  30.74 
 
 		 261 aa  83.6  0.000000000000006  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.000359236  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1628  OsmC-like protein  36.43 
 
 		 138 aa  82  0.00000000000002  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0181271 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2484  OsmC family protein  36.09 
 
 		 133 aa  81.3  0.00000000000003  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  0.092178 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1919  OsmC family protein  38.85 
 
 		 131 aa  80.9  0.00000000000004  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.148561  normal  1 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1856  OsmC family protein  36.28 
 
 		 129 aa  80.5  0.00000000000005  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.610023  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0819  hypothetical protein  26.38 
 
 		 253 aa  77  0.0000000000006  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0732  OsmC family protein  48.08 
 
 		 137 aa  74.3  0.000000000004  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.560509  normal  1 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4937  OsmC family protein  37.31 
 
 		 133 aa  73.6  0.000000000006  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.659641 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2297  OsmC-like protein  36.76 
 
 		 133 aa  73.6  0.000000000006  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.922047  normal  0.948773 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2142  OsmC family protein  37.21 
 
 		 129 aa  73.2  0.000000000008  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0929  putative hydrolase  28.7 
 
 		 252 aa  73.2  0.000000000008  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.119531  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0457  Lysophospholipase-like protein  28.25 
 
 		 274 aa  72.8  0.00000000001  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_3616  osmotically inducible protein  30.26 
 
 		 129 aa  71.6  0.00000000002  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000818818  normal  1 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0962  dipeptidyl aminopeptidase/acylaminoacyl-peptidase-like protein  32.46 
 
 		 364 aa  72  0.00000000002  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_5525  OsmC family protein  38.4 
 
 		 133 aa  72  0.00000000002  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3689  OsmC family protein  38.71 
 
 		 133 aa  71.2  0.00000000003  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.952273 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3725  OsmC family protein  35.56 
 
 		 133 aa  70.9  0.00000000004  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.196532 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4564  OsmC-like protein  35.56 
 
 		 133 aa  70.9  0.00000000004  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3799  OsmC family protein  35.56 
 
 		 133 aa  70.9  0.00000000004  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.732158  normal  0.104892 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2582  peptidase S15  27.52 
 
 		 258 aa  70.1  0.00000000006  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0518  OsmC-like protein superfamily protein  34.81 
 
 		 153 aa  70.1  0.00000000007  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0240  hypothetical protein  34.07 
 
 		 133 aa  69.7  0.00000000008  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_1423  hypothetical protein  34.07 
 
 		 133 aa  69.7  0.00000000008  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2518  hypothetical protein  34.07 
 
 		 133 aa  69.7  0.00000000008  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.0608844  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2657  putative hydrolase  34.07 
 
 		 133 aa  69.7  0.00000000008  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0949  hydrolase  34.07 
 
 		 133 aa  69.7  0.00000000009  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1483  hypothetical protein  27.16 
 
 		 237 aa  67.4  0.0000000004  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3965  OsmC family protein  33.59 
 
 		 132 aa  67.8  0.0000000004  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1832  OsmC-like protein  34.48 
 
 		 133 aa  67  0.0000000006  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2898  OsmC-like protein  35.09 
 
 		 135 aa  66.2  0.0000000009  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.533642 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3365  alpha/beta fold family hydrolase-like protein  27.11 
 
 		 297 aa  65.9  0.000000001  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.432106  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1156  hypothetical protein  25.79 
 
 		 294 aa  65.1  0.000000002  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.40892  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2193  OsmC family protein  37.8 
 
 		 129 aa  64.7  0.000000003  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.208378  normal  1 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0798  hydrolase, putative  31.31 
 
 		 246 aa  64.7  0.000000003  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  0.905028 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1297  hypothetical protein  26.36 
 
 		 324 aa  63.9  0.000000004  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.12258  normal  0.997754 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_16600  alpha/beta family hydrolase  27.31 
 
 		 301 aa  63.5  0.000000006  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.579607  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>