185 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Pmen_2484 on replicon NC_009439
Organism: Pseudomonas mendocina ymp



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009439  Pmen_2484  OsmC family protein  100 
 
 		 133 aa  266  5e-71  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  0.092178 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1628  OsmC-like protein  52.46 
 
 		 138 aa  149  2e-35  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0181271 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3965  OsmC family protein  53.72 
 
 		 132 aa  139  1.9999999999999998e-32  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0232  OsmC family protein  57.28 
 
 		 134 aa  125  2.0000000000000002e-28  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2898  OsmC-like protein  50.85 
 
 		 135 aa  124  3e-28  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.533642 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0251  OsmC family protein  57.28 
 
 		 134 aa  124  3e-28  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.798103  normal  0.164531 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0376  hypothetical protein  55.34 
 
 		 134 aa  122  2e-27  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1832  OsmC-like protein  44.19 
 
 		 133 aa  118  1.9999999999999998e-26  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1595  OsmC family protein  49.57 
 
 		 134 aa  117  3.9999999999999996e-26  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2279  OsmC family protein  49.57 
 
 		 155 aa  116  9.999999999999999e-26  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.0377998  normal  0.182149 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_3616  osmotically inducible protein  47.52 
 
 		 129 aa  96.3  1e-19  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000818818  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6635  OsmC family protein  41.01 
 
 		 411 aa  96.7  1e-19  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.659004  hitchhiker  0.00000360166 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2280  OsmC-like protein  35.25 
 
 		 406 aa  95.1  3e-19  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  0.423404 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2873  hypothetical protein  38.97 
 
 		 405 aa  94.4  5e-19  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.326467  normal  0.0265941 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7018  OsmC family protein  42.64 
 
 		 412 aa  94  7e-19  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00716876 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1835  OsmC-like protein  37.98 
 
 		 407 aa  92.8  1e-18  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_48750  hypothetical protein  42.61 
 
 		 135 aa  91.7  3e-18  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000274485 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1856  OsmC family protein  39.67 
 
 		 129 aa  91.7  3e-18  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.610023  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_4048  OsmC family protein  36.84 
 
 		 415 aa  91.3  4e-18  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  unclonable  0.0000134708  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4175  hypothetical protein  40.87 
 
 		 135 aa  90.1  8e-18  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.214068  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2717  OsmC-like protein  40.35 
 
 		 135 aa  89  2e-17  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00712413 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2694  OsmC-like protein  33.86 
 
 		 406 aa  88.6  3e-17  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1930  OsmC family protein  35.43 
 
 		 407 aa  87.4  5e-17  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.0101124  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1673  OsmC-like protein  36.76 
 
 		 409 aa  87  7e-17  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3633  OsmC-like protein  37.21 
 
 		 406 aa  86.3  1e-16  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.525721 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3655  OsmC family protein  33.85 
 
 		 410 aa  84.7  4e-16  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4769  OsmC family protein  35.66 
 
 		 153 aa  84.3  5e-16  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  hitchhiker  0.00807264  hitchhiker  0.00049584 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5556  OsmC-like protein  36.84 
 
 		 130 aa  83.2  0.000000000000001  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  hitchhiker  0.0000078778  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3762  OsmC family protein  33.08 
 
 		 410 aa  82.8  0.000000000000001  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1206  OsmC family protein  36.09 
 
 		 413 aa  81.3  0.000000000000004  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.423514  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0049  OsmC family protein  35.59 
 
 		 406 aa  81.3  0.000000000000004  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_5525  OsmC family protein  39.32 
 
 		 133 aa  80.9  0.000000000000005  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0732  OsmC family protein  37.39 
 
 		 137 aa  80.1  0.000000000000009  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.560509  normal  1 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1013  OsmC-like protein  36.09 
 
 		 423 aa  79  0.00000000000002  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.325781  normal  1 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0941  OsmC family protein  34.11 
 
 		 409 aa  79  0.00000000000002  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.3755  normal  0.451532 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1840  hypothetical protein  35.94 
 
 		 405 aa  78.6  0.00000000000003  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  0.949047 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3689  OsmC family protein  38.79 
 
 		 133 aa  78.6  0.00000000000003  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.952273 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6443  OsmC family protein  33.94 
 
 		 408 aa  77.8  0.00000000000005  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.588479  normal  1 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1917  OsmC family protein  37.17 
 
 		 130 aa  77.8  0.00000000000005  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.591016  normal  0.655521 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0908  OsmC-like protein  36.28 
 
 		 130 aa  77.4  0.00000000000006  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1390  OsmC family protein  36.28 
 
 		 130 aa  77.4  0.00000000000006  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.51882  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1368  OsmC family protein  36.28 
 
 		 130 aa  77.4  0.00000000000006  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.0210899 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1440  OsmC family protein  34.51 
 
 		 142 aa  77  0.00000000000007  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4533  OsmC-like protein  36.28 
 
 		 130 aa  77  0.00000000000009  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.257374 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3145  redox protein regulator of disulfide bond formation, OsmC-like  33.6 
 
 		 132 aa  76.3  0.0000000000001  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.102127 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1267  OsmC family protein  36.28 
 
 		 130 aa  76.3  0.0000000000001  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2297  OsmC-like protein  37.14 
 
 		 133 aa  75.9  0.0000000000002  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.922047  normal  0.948773 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1301  OsmC family protein  36.28 
 
 		 130 aa  75.9  0.0000000000002  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.0499071 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_6150  OsmC family protein  33.03 
 
 		 408 aa  75.9  0.0000000000002  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.773624  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0979  OsmC family protein  32.26 
 
 		 418 aa  75.5  0.0000000000002  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0974  OsmC family protein  38.26 
 
 		 128 aa  75.1  0.0000000000003  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.637714  normal  0.331477 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4103  OsmC family protein  34.13 
 
 		 402 aa  73.9  0.0000000000006  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.671514  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3725  OsmC family protein  37.07 
 
 		 133 aa  73.6  0.0000000000009  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.196532 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4564  OsmC-like protein  37.07 
 
 		 133 aa  73.6  0.0000000000009  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3799  OsmC family protein  37.07 
 
 		 133 aa  73.6  0.0000000000009  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.732158  normal  0.104892 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1950  OsmC family protein  31.75 
 
 		 132 aa  73.2  0.000000000001  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.378128  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1923  OsmC-like protein  31.75 
 
 		 127 aa  73.2  0.000000000001  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1403  OsmC family protein  32 
 
 		 132 aa  71.6  0.000000000003  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0655694  normal  0.111545 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_12698  hypothetical protein  31.78 
 
 		 405 aa  70.9  0.000000000006  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4937  OsmC family protein  36.21 
 
 		 133 aa  70.9  0.000000000006  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.659641 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1082  OsmC-like family protein  33.33 
 
 		 141 aa  70.5  0.000000000007  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.0521945  normal  0.207247 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0921  OsmC family protein  35.45 
 
 		 136 aa  70.1  0.00000000001  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.418667  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0982  OsmC family protein  35.9 
 
 		 127 aa  69.7  0.00000000001  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1489  OsmC family protein  28.23 
 
 		 181 aa  67.4  0.00000000006  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.172419  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3491  OsmC family protein  32.41 
 
 		 131 aa  67.4  0.00000000006  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1919  OsmC family protein  32.41 
 
 		 131 aa  66.6  0.0000000001  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.148561  normal  1 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5429  OsmC family protein  29.63 
 
 		 397 aa  66.6  0.0000000001  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2658  OsmC family protein  33.62 
 
 		 133 aa  65.9  0.0000000002  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.653298  normal  0.498397 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5571  OsmC family protein  30.08 
 
 		 408 aa  65.9  0.0000000002  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.0439292 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0351  OsmC family protein  30.53 
 
 		 134 aa  65.9  0.0000000002  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.999657  normal  0.881663 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1777  OsmC-like protein  30.17 
 
 		 410 aa  65.1  0.0000000003  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.0113862  normal  1 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_4196  OsmC family protein  30.89 
 
 		 135 aa  63.2  0.000000001  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_4221  OsmC family protein  31.19 
 
 		 135 aa  62.4  0.000000002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.741744  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_4072  hypothetical protein  31.19 
 
 		 134 aa  62.4  0.000000002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.0853904  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2354  OsmC-like protein  33.62 
 
 		 170 aa  62.4  0.000000002  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.572746  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1130  hypothetical protein  26.61 
 
 		 135 aa  61.2  0.000000004  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  0.362808 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0518  OsmC-like protein superfamily protein  31.3 
 
 		 153 aa  60.1  0.000000009  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2193  OsmC family protein  35.19 
 
 		 129 aa  60.1  0.000000009  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.208378  normal  1 
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0240  hypothetical protein  30.17 
 
 		 133 aa  59.7  0.00000001  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0949  hydrolase  30.17 
 
 		 133 aa  59.7  0.00000001  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_1423  hypothetical protein  30.17 
 
 		 133 aa  59.7  0.00000001  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2657  putative hydrolase  30.17 
 
 		 133 aa  59.7  0.00000001  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2518  hypothetical protein  30.17 
 
 		 133 aa  59.7  0.00000001  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.0608844  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1438  OsmC family protein  26.17 
 
 		 137 aa  59.7  0.00000001  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.139134 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0887  hypothetical protein  29.35 
 
 		 132 aa  57.8  0.00000006  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.873349  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1001  OsmC family protein  27.1 
 
 		 135 aa  57.4  0.00000007  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1341  OsmC family protein  26.17 
 
 		 133 aa  57  0.00000009  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1429  OsmC family protein  28.04 
 
 		 135 aa  57  0.00000009  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.640592  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0382  hypothetical protein  25.6 
 
 		 134 aa  56.6  0.0000001  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1251  OsmC family protein  28.3 
 
 		 134 aa  56.6  0.0000001  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.106129  normal  0.568503 
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_1560  OsmC family protein  38.57 
 
 		 88 aa  55.8  0.0000002  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3526  OsmC family protein  26.89 
 
 		 177 aa  55.1  0.0000003  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.7407  normal  0.298467 
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1619  hypothetical protein  30.77 
 
 		 129 aa  55.1  0.0000003  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0276  hypothetical protein  30.77 
 
 		 129 aa  55.1  0.0000003  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2142  OsmC family protein  26.27 
 
 		 129 aa  54.7  0.0000004  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2348  OsmC family protein  29.03 
 
 		 163 aa  54.3  0.0000005  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.684792  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0335  OsmC family protein  28.12 
 
 		 127 aa  54.7  0.0000005  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  0.252391  normal  1 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2505  OsmC family protein  29.06 
 
 		 147 aa  53.9  0.0000008  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2832  hypothetical protein  25.83 
 
 		 728 aa  53.5  0.0000009  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.134905  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2297  hypothetical protein  25.83 
 
 		 728 aa  53.5  0.0000009  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.806493 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>