88 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene CFF8240_0623 on replicon NC_008599
Organism: Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008599  CFF8240_0623  hypothetical protein  100 
 
 		 176 aa  355  1.9999999999999998e-97  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  decreased coverage  0.0005983  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5418  hypothetical protein  71.51 
 
 		 180 aa  245  2e-64  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2612  OsmC family protein  71.52 
 
 		 208 aa  242  1.9999999999999999e-63  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.43183 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0304  hypothetical protein  66.67 
 
 		 190 aa  239  2e-62  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.119499 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2836  OsmC family protein  60 
 
 		 177 aa  212  2.9999999999999995e-54  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3867  OsmC family protein  60.76 
 
 		 185 aa  195  4.0000000000000005e-49  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.0319528 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3485  OsmC family protein  60.13 
 
 		 185 aa  194  4.0000000000000005e-49  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0969  OsmC family protein  56.47 
 
 		 182 aa  194  5.000000000000001e-49  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  0.298439 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3793  OsmC family protein  59.49 
 
 		 185 aa  192  2e-48  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.242728 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_2212  OsmC family protein  60 
 
 		 159 aa  189  1e-47  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0039  OsmC-like protein  53.93 
 
 		 179 aa  187  8e-47  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2175  OsmC-like protein  41.21 
 
 		 185 aa  143  1e-33  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.416909  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4668  OsmC family protein  40.24 
 
 		 183 aa  137  1e-31  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.35857  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4851  OsmC-like protein  41.57 
 
 		 187 aa  132  1.9999999999999998e-30  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.137347 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1151  OsmC family protein  39.29 
 
 		 183 aa  132  1.9999999999999998e-30  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.824502  normal  0.359642 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1310  OsmC family protein  38.69 
 
 		 183 aa  129  2.0000000000000002e-29  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.47097  normal  1 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0586  OsmC family protein  35.76 
 
 		 179 aa  95.9  2e-19  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  0.128993  normal  0.0133234 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0339  OsmC family protein  35.71 
 
 		 145 aa  83.2  0.000000000000002  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.53983  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0441  OsmC family protein  35.65 
 
 		 189 aa  79  0.00000000000003  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.488218  normal  0.432032 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2788  hypothetical protein  35.04 
 
 		 186 aa  79  0.00000000000004  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2505  OsmC family protein  39.81 
 
 		 147 aa  77.8  0.00000000000006  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5247  OsmC family protein  31.64 
 
 		 187 aa  77  0.0000000000001  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.402263 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_6160  OsmC family protein  42.57 
 
 		 182 aa  76.3  0.0000000000002  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.76501  normal  1 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6453  OsmC family protein  42.57 
 
 		 182 aa  75.5  0.0000000000003  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.16719  normal  1 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_2325  OsmC family protein  34.75 
 
 		 180 aa  75.5  0.0000000000004  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2488  hypothetical protein  38.79 
 
 		 202 aa  73.6  0.000000000001  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1978  OsmC family protein  36.22 
 
 		 186 aa  71.2  0.000000000006  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008545  Bcen2424_6854  OsmC family protein  31.85 
 
 		 186 aa  70.5  0.00000000001  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.521419  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1670  OsmC family protein  33.59 
 
 		 156 aa  69.7  0.00000000002  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.0539264  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4264  hypothetical protein  40 
 
 		 184 aa  69.7  0.00000000002  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2570  OsmC family protein  33.91 
 
 		 187 aa  68.2  0.00000000006  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1644  OsmC family protein  29.14 
 
 		 193 aa  66.2  0.0000000002  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0443  OsmC-like protein  32.91 
 
 		 176 aa  66.6  0.0000000002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.16081  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3268  OsmC family protein  40.22 
 
 		 184 aa  65.9  0.0000000003  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  0.200885 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4895  OsmC-like protein  40.22 
 
 		 184 aa  65.9  0.0000000003  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008545  Bcen2424_6912  OsmC family protein  40.22 
 
 		 184 aa  65.5  0.0000000003  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3421  OsmC family protein  40.22 
 
 		 184 aa  65.9  0.0000000003  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.320541  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4432  OsmC family protein  40.22 
 
 		 184 aa  65.9  0.0000000003  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.670087  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4791  OsmC family protein  32.77 
 
 		 187 aa  65.1  0.0000000005  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.361207  normal  0.435509 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0235  OsmC family protein  35.96 
 
 		 147 aa  63.5  0.000000001  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011885  Cyan7425_0190  OsmC family protein  32.17 
 
 		 189 aa  63.5  0.000000002  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  n/a    normal  0.155362 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1026  OsmC family protein  35.4 
 
 		 206 aa  62.4  0.000000003  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3413  OsmC family protein  44.94 
 
 		 171 aa  62  0.000000004  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3526  OsmC family protein  30.65 
 
 		 177 aa  61.2  0.000000006  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.7407  normal  0.298467 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_04790  OsmC family protein  33.33 
 
 		 144 aa  59.7  0.00000002  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3848  OsmC family protein  26.61 
 
 		 181 aa  58.5  0.00000005  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.323457  normal  1 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_07015  hypothetical protein  25.45 
 
 		 181 aa  58.2  0.00000007  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1892  OsmC-like protein  33.64 
 
 		 148 aa  57.8  0.00000007  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2254  OsmC-like protein  26.4 
 
 		 199 aa  57.8  0.00000008  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.0977605  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_4241  OsmC family protein  28.07 
 
 		 202 aa  57.4  0.0000001  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_3231  OsmC family protein  27.1 
 
 		 163 aa  57  0.0000001  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1348  OsmC family protein  31.9 
 
 		 151 aa  56.2  0.0000002  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2354  OsmC-like protein  33.64 
 
 		 170 aa  55.8  0.0000003  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.572746  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2100  OsmC family protein  30.43 
 
 		 185 aa  54.3  0.0000009  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1865  OsmC family protein  29.14 
 
 		 185 aa  52.8  0.000002  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.128326  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1904  OsmC family protein  31.25 
 
 		 193 aa  52.8  0.000002  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.576095  unclonable  0.00000937306 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_13840  predicted redox protein, regulator of disulfide bond formation  24.35 
 
 		 145 aa  52  0.000004  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2488  OsmC family protein  40.24 
 
 		 172 aa  51.6  0.000006  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.0230337  normal  0.160295 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6241  OsmC family protein  27.12 
 
 		 182 aa  51.2  0.000007  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0196837  normal  0.733472 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5957  OsmC family protein  37.7 
 
 		 190 aa  50.1  0.00001  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0897  OsmC family protein  26.17 
 
 		 145 aa  50.1  0.00002  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.669017  normal  1 
 
 
-
 
NC_002967  TDE1270  hypothetical protein  27.46 
 
 		 144 aa  47.4  0.0001  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  hitchhiker  0.00225413  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1127  OsmC family protein  31.07 
 
 		 168 aa  47.4  0.0001  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  0.938023 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_2206  OsmC family protein  33.71 
 
 		 168 aa  46.2  0.0002  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  0.742376 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0377  OsmC family protein  31.63 
 
 		 169 aa  45.1  0.0005  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0330  OsmC family protein  31.63 
 
 		 169 aa  45.1  0.0005  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.514624  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2638  hypothetical protein  25.64 
 
 		 137 aa  44.7  0.0007  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0921  OsmC family protein  28.81 
 
 		 136 aa  44.7  0.0008  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.418667  normal  1 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0042  OsmC family protein  30.28 
 
 		 142 aa  44.3  0.0009  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2855  OsmC family protein  30.1 
 
 		 169 aa  44.3  0.0009  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.0000502537  normal  0.0640135 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1071  OsmC family protein  25.45 
 
 		 142 aa  43.5  0.001  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.0000000601559  normal  1 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_09780  truncated hemoglobin  31.48 
 
 		 357 aa  44.3  0.001  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1075  OsmC family protein  25.45 
 
 		 142 aa  43.5  0.001  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1639  OsmC family protein  30.19 
 
 		 167 aa  44.3  0.001  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.945103  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1143  OsmC family protein  25.45 
 
 		 142 aa  43.5  0.002  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  decreased coverage  0.00000523467  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2794  OsmC family protein  24.55 
 
 		 142 aa  43.1  0.002  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0407  OsmC family protein  30.61 
 
 		 169 aa  42.4  0.003  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.0496053  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7018  OsmC family protein  38.18 
 
 		 412 aa  42.7  0.003  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00716876 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1058  OsmC family protein  27.45 
 
 		 200 aa  42.7  0.003  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.333829 
 
 
-
 
NC_010511  M446_2189  OsmC family protein  30.3 
 
 		 169 aa  42.4  0.003  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.0335227  normal  0.683604 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_48750  hypothetical protein  28.12 
 
 		 135 aa  42  0.004  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000274485 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4175  hypothetical protein  28.12 
 
 		 135 aa  41.6  0.005  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.214068  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0597  OsmC family protein  30.1 
 
 		 129 aa  41.6  0.006  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3648  OsmC family protein  26.21 
 
 		 167 aa  41.2  0.007  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1145  OsmC family protein  26.79 
 
 		 167 aa  41.2  0.007  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.354032  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0112  OsmC-like protein  27.47 
 
 		 169 aa  41.2  0.007  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.636366  normal  0.66012 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1957  OsmC family protein  27.45 
 
 		 201 aa  41.2  0.008  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  0.226046 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1628  OsmC-like protein  34.62 
 
 		 138 aa  40.8  0.009  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0181271 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>