93 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bamb_1978 on replicon NC_008390
Organism: Burkholderia ambifaria AMMD



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008390  Bamb_1978  OsmC family protein  100 
 
 		 186 aa  384  1e-106  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008545  Bcen2424_6854  OsmC family protein  81.72 
 
 		 186 aa  320  9.000000000000001e-87  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.521419  n/a   
 
 
-
 
NC_008545  Bcen2424_6912  OsmC family protein  80.11 
 
 		 184 aa  304  5.0000000000000004e-82  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4895  OsmC-like protein  79.57 
 
 		 184 aa  302  2.0000000000000002e-81  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3268  OsmC family protein  79.57 
 
 		 184 aa  302  2.0000000000000002e-81  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  0.200885 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3421  OsmC family protein  78.49 
 
 		 184 aa  297  5e-80  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.320541  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4432  OsmC family protein  78.49 
 
 		 184 aa  297  5e-80  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.670087  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4264  hypothetical protein  74.73 
 
 		 184 aa  284  5e-76  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_6160  OsmC family protein  60.11 
 
 		 182 aa  230  9e-60  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.76501  normal  1 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6453  OsmC family protein  60.11 
 
 		 182 aa  229  2e-59  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.16719  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5247  OsmC family protein  46.99 
 
 		 187 aa  177  5.999999999999999e-44  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.402263 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5957  OsmC family protein  44.13 
 
 		 190 aa  150  8.999999999999999e-36  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1026  OsmC family protein  38.15 
 
 		 206 aa  124  6e-28  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0441  OsmC family protein  34.29 
 
 		 189 aa  103  1e-21  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.488218  normal  0.432032 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2488  hypothetical protein  31.79 
 
 		 202 aa  97.1  1e-19  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_07015  hypothetical protein  27.75 
 
 		 181 aa  97.4  1e-19  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0586  OsmC family protein  29.83 
 
 		 179 aa  95.5  4e-19  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  0.128993  normal  0.0133234 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_4241  OsmC family protein  31.61 
 
 		 202 aa  94  1e-18  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3848  OsmC family protein  28.32 
 
 		 181 aa  94  1e-18  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.323457  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2788  hypothetical protein  32.39 
 
 		 186 aa  92.4  3e-18  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_2325  OsmC family protein  34.81 
 
 		 180 aa  90.9  1e-17  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2254  OsmC-like protein  31.07 
 
 		 199 aa  90.1  2e-17  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.0977605  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4791  OsmC family protein  34.78 
 
 		 187 aa  89.4  3e-17  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.361207  normal  0.435509 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2354  OsmC-like protein  37.1 
 
 		 170 aa  89  4e-17  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.572746  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2570  OsmC family protein  33.76 
 
 		 187 aa  86.7  2e-16  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0339  OsmC family protein  43.27 
 
 		 145 aa  84.7  7e-16  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.53983  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2836  OsmC family protein  37.12 
 
 		 177 aa  84  0.000000000000001  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3526  OsmC family protein  33.06 
 
 		 177 aa  82.4  0.000000000000004  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.7407  normal  0.298467 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0304  hypothetical protein  41.07 
 
 		 190 aa  82  0.000000000000004  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.119499 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0443  OsmC-like protein  35.46 
 
 		 176 aa  82.4  0.000000000000004  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.16081  n/a   
 
 
-
 
NC_011885  Cyan7425_0190  OsmC family protein  30.63 
 
 		 189 aa  80.1  0.00000000000002  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  n/a    normal  0.155362 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0235  OsmC family protein  32.85 
 
 		 147 aa  79.3  0.00000000000003  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2612  OsmC family protein  35.71 
 
 		 208 aa  77.8  0.00000000000008  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.43183 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1865  OsmC family protein  33.1 
 
 		 185 aa  76.3  0.0000000000003  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.128326  normal  1 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0969  OsmC family protein  37.82 
 
 		 182 aa  75.9  0.0000000000003  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  0.298439 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5418  hypothetical protein  34.29 
 
 		 180 aa  74.7  0.0000000000006  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6241  OsmC family protein  30.43 
 
 		 182 aa  75.1  0.0000000000006  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0196837  normal  0.733472 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1644  OsmC family protein  29.38 
 
 		 193 aa  74.7  0.0000000000007  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3485  OsmC family protein  40.54 
 
 		 185 aa  73.6  0.000000000002  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1892  OsmC-like protein  39.77 
 
 		 148 aa  72.8  0.000000000003  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2100  OsmC family protein  32.23 
 
 		 185 aa  72.8  0.000000000003  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_2212  OsmC family protein  38.53 
 
 		 159 aa  72  0.000000000004  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0039  OsmC-like protein  31.72 
 
 		 179 aa  72  0.000000000005  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0623  hypothetical protein  36.22 
 
 		 176 aa  71.2  0.000000000007  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  decreased coverage  0.0005983  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1348  OsmC family protein  30.22 
 
 		 151 aa  70.5  0.00000000001  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3867  OsmC family protein  39.64 
 
 		 185 aa  70.5  0.00000000001  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.0319528 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3413  OsmC family protein  36.63 
 
 		 171 aa  70.5  0.00000000001  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3793  OsmC family protein  39.17 
 
 		 185 aa  70.9  0.00000000001  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.242728 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_04790  OsmC family protein  32.52 
 
 		 144 aa  69.3  0.00000000003  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1310  OsmC family protein  29.14 
 
 		 183 aa  68.9  0.00000000004  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.47097  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4668  OsmC family protein  28.32 
 
 		 183 aa  67.8  0.00000000009  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.35857  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1151  OsmC family protein  28.32 
 
 		 183 aa  67.4  0.0000000001  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.824502  normal  0.359642 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2488  OsmC family protein  35.09 
 
 		 172 aa  65.5  0.0000000004  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.0230337  normal  0.160295 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2175  OsmC-like protein  27.37 
 
 		 185 aa  62.4  0.000000003  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.416909  normal  1 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_3231  OsmC family protein  24.71 
 
 		 163 aa  62  0.000000005  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4851  OsmC-like protein  26.86 
 
 		 187 aa  61.6  0.000000007  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.137347 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1670  OsmC family protein  30.89 
 
 		 156 aa  61.2  0.000000008  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.0539264  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_13840  predicted redox protein, regulator of disulfide bond formation  29.06 
 
 		 145 aa  61.2  0.000000009  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2505  OsmC family protein  24.34 
 
 		 147 aa  58.5  0.00000005  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1058  OsmC family protein  27.88 
 
 		 200 aa  56.6  0.0000002  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.333829 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7506  hypothetical protein  30.63 
 
 		 188 aa  53.5  0.000002  Burkholderia sp. 383  Bacteria  hitchhiker  0.000000000101926  normal  0.551931 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1904  OsmC family protein  21.93 
 
 		 193 aa  50.4  0.00001  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.576095  unclonable  0.00000937306 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0693  OsmC-like protein  29 
 
 		 168 aa  49.3  0.00003  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3762  OsmC family protein  28.69 
 
 		 410 aa  48.1  0.00006  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1639  OsmC family protein  26.79 
 
 		 167 aa  48.1  0.00007  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.945103  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE1727  hypothetical protein  28.81 
 
 		 138 aa  47.8  0.00009  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6182  OsmC family protein  30.43 
 
 		 176 aa  47.4  0.0001  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.360981 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3655  OsmC family protein  28.69 
 
 		 410 aa  47.4  0.0001  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0377  OsmC family protein  28.24 
 
 		 169 aa  47  0.0001  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1255  OsmC-like protein  30.43 
 
 		 176 aa  47.4  0.0001  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.340631  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6577  OsmC family protein  30.43 
 
 		 176 aa  47.4  0.0001  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1148  OsmC family protein  25.84 
 
 		 169 aa  47.4  0.0001  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_2031  OsmC family protein  34.18 
 
 		 138 aa  47  0.0002  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.650355  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1127  OsmC family protein  28.92 
 
 		 168 aa  46.6  0.0002  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  0.938023 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2054  OsmC family protein  31.58 
 
 		 164 aa  46.6  0.0002  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  0.778931 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0867  OsmC family protein  27.06 
 
 		 169 aa  45.8  0.0003  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.376239  hitchhiker  0.00350915 
 
 
-
 
NC_010511  M446_2189  OsmC family protein  25.88 
 
 		 169 aa  45.4  0.0004  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.0335227  normal  0.683604 
 
 
-
 
NC_009475  BBta_p0218  hypothetical protein  36.36 
 
 		 74 aa  45.8  0.0004  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  n/a    normal  0.354041 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0407  OsmC family protein  28.24 
 
 		 169 aa  45.1  0.0005  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.0496053  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0897  OsmC family protein  28.57 
 
 		 145 aa  45.1  0.0006  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.669017  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0330  OsmC family protein  27.06 
 
 		 169 aa  45.1  0.0007  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.514624  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0225  OsmC-like protein  24.86 
 
 		 169 aa  43.9  0.001  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.439807  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1436  OsmC family protein  28.07 
 
 		 134 aa  43.5  0.002  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0781  OsmC family protein  26 
 
 		 169 aa  43.5  0.002  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.764307  normal  1 
 
 
-
 
NC_002967  TDE1270  hypothetical protein  25.56 
 
 		 144 aa  43.1  0.002  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  hitchhiker  0.00225413  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1440  OsmC family protein  28.8 
 
 		 142 aa  43.1  0.003  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1919  OsmC family protein  29.91 
 
 		 131 aa  43.1  0.003  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.148561  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1923  OsmC-like protein  34.72 
 
 		 127 aa  42.7  0.003  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2873  hypothetical protein  51.52 
 
 		 405 aa  42.4  0.004  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.326467  normal  0.0265941 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_1477  OsmC family protein  30.56 
 
 		 137 aa  41.6  0.007  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0206  OsmC family protein  29.13 
 
 		 174 aa  41.2  0.008  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.338673  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7018  OsmC family protein  28.12 
 
 		 412 aa  41.2  0.009  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00716876 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1145  OsmC family protein  27 
 
 		 167 aa  40.8  0.01  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.354032  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>