More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Gbem_3655 on replicon NC_011146
Organism: Geobacter bemidjiensis Bem



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_012918  GM21_3762  OsmC family protein  97.07 
 
 
410 aa  795    Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3655  OsmC family protein  100 
 
 
410 aa  840    Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_4048  OsmC family protein  58.82 
 
 
415 aa  494  1e-139  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  unclonable  0.0000134708  normal 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1206  OsmC family protein  52.88 
 
 
413 aa  444  1e-123  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.423514  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7018  OsmC family protein  53.45 
 
 
412 aa  416  9.999999999999999e-116  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00716876 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_12698  hypothetical protein  48.66 
 
 
405 aa  412  1e-114  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0941  OsmC family protein  50.36 
 
 
409 aa  394  1e-108  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.3755  normal  0.451532 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2280  OsmC-like protein  50.74 
 
 
406 aa  389  1e-107  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal  0.423404 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4103  OsmC family protein  48.28 
 
 
402 aa  390  1e-107  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.671514  normal 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2694  OsmC-like protein  49.88 
 
 
406 aa  383  1e-105  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2873  hypothetical protein  50.98 
 
 
405 aa  378  1e-104  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.326467  normal  0.0265941 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1835  OsmC-like protein  50.12 
 
 
407 aa  379  1e-104  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3633  OsmC-like protein  50.24 
 
 
406 aa  376  1e-103  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal  0.525721 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1673  OsmC-like protein  50 
 
 
409 aa  372  1e-102  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1930  OsmC family protein  50.49 
 
 
407 aa  371  1e-101  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.0101124  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1777  OsmC-like protein  46.99 
 
 
410 aa  370  1e-101  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.0113862  normal 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1013  OsmC-like protein  48.91 
 
 
423 aa  371  1e-101  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.325781  normal 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5571  OsmC family protein  47.09 
 
 
408 aa  371  1e-101  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal  0.0439292 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1840  hypothetical protein  48.43 
 
 
405 aa  364  2e-99  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal  0.949047 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0049  OsmC family protein  46.44 
 
 
406 aa  350  3e-95  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5429  OsmC family protein  43.17 
 
 
397 aa  315  8e-85  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6635  OsmC family protein  43.69 
 
 
411 aa  311  2e-83  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.659004  hitchhiker  0.00000360166 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_6150  OsmC family protein  47.61 
 
 
408 aa  297  2e-79  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.773624  normal 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6443  OsmC family protein  46.85 
 
 
408 aa  291  2e-77  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.588479  normal 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0979  OsmC family protein  43.73 
 
 
418 aa  290  3e-77  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3394  hypothetical protein  50.8 
 
 
251 aa  252  1e-65  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.689408  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2450  hypothetical protein  45.67 
 
 
258 aa  245  9.999999999999999e-64  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl0227  hypothetical protein  49.42 
 
 
257 aa  236  7e-61  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp0226  hypothetical protein  49.03 
 
 
257 aa  229  5e-59  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0403  OsmC family protein  50 
 
 
259 aa  220  3.9999999999999997e-56  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_3055  OsmC-like family protein  46.43 
 
 
255 aa  216  4e-55  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1127  putative redox protein  41.83 
 
 
256 aa  203  3e-51  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3247  putative redox protein  43.37 
 
 
250 aa  201  1.9999999999999998e-50  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.184697  normal 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1911  hydrolase of the alpha/beta superfamily protein  42.8 
 
 
259 aa  199  7e-50  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.0630248  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2961  OsmC-like family protein  42 
 
 
250 aa  190  2.9999999999999997e-47  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.0745233  normal  0.293641 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0234  alpha/beta hydrolase fold protein  39.61 
 
 
256 aa  189  7e-47  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  normal  0.104073 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2376  putative redox protein  38.25 
 
 
259 aa  188  2e-46  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1200  putative redox protein  41.56 
 
 
256 aa  187  3e-46  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000020196 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1067  hypothetical protein  51.68 
 
 
145 aa  157  4e-37  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.0889291  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4769  OsmC family protein  50.35 
 
 
153 aa  142  7e-33  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  hitchhiker  0.00807264  hitchhiker  0.00049584 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2717  OsmC-like protein  50.86 
 
 
135 aa  116  6.9999999999999995e-25  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00712413 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_48750  hypothetical protein  38.73 
 
 
135 aa  108  2e-22  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000274485 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4175  hypothetical protein  41.86 
 
 
135 aa  107  3e-22  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.214068  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1950  OsmC family protein  38.57 
 
 
132 aa  105  1e-21  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.378128  normal 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3145  redox protein regulator of disulfide bond formation, OsmC-like  40.43 
 
 
132 aa  102  1e-20  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.102127 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0921  OsmC family protein  42.15 
 
 
136 aa  101  3e-20  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.418667  normal 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1082  OsmC-like family protein  38.03 
 
 
141 aa  101  3e-20  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.0521945  normal  0.207247 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1440  OsmC family protein  42.02 
 
 
142 aa  100  4e-20  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3491  OsmC family protein  35.97 
 
 
131 aa  99.8  7e-20  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1403  OsmC family protein  39.01 
 
 
132 aa  99.4  1e-19  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0655694  normal  0.111545 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1917  OsmC family protein  42.28 
 
 
130 aa  99  2e-19  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.591016  normal  0.655521 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1856  OsmC family protein  35.77 
 
 
129 aa  98.6  2e-19  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.610023  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1267  OsmC family protein  42.11 
 
 
130 aa  98.2  2e-19  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1368  OsmC family protein  42.11 
 
 
130 aa  97.8  3e-19  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.0210899 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0908  OsmC-like protein  42.11 
 
 
130 aa  97.8  3e-19  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1301  OsmC family protein  42.11 
 
 
130 aa  97.8  3e-19  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal  0.0499071 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1390  OsmC family protein  42.11 
 
 
130 aa  97.8  3e-19  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.51882  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4533  OsmC-like protein  40.65 
 
 
130 aa  97.1  5e-19  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.257374 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1923  OsmC-like protein  41.73 
 
 
127 aa  95.9  1e-18  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1438  OsmC family protein  37.86 
 
 
137 aa  93.6  6e-18  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal  0.139134 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0974  OsmC family protein  39.37 
 
 
128 aa  92.4  1e-17  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.637714  normal  0.331477 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1919  OsmC family protein  40.16 
 
 
131 aa  91.7  2e-17  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.148561  normal 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4937  OsmC family protein  40.91 
 
 
133 aa  91.7  2e-17  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal  0.659641 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3725  OsmC family protein  39.23 
 
 
133 aa  90.1  7e-17  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.196532 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4564  OsmC-like protein  39.23 
 
 
133 aa  90.1  7e-17  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3799  OsmC family protein  39.23 
 
 
133 aa  90.1  7e-17  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.732158  normal  0.104892 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0982  OsmC family protein  41.86 
 
 
127 aa  89.7  8e-17  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2297  OsmC-like protein  40 
 
 
133 aa  89.7  9e-17  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.922047  normal  0.948773 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0732  OsmC family protein  40.48 
 
 
137 aa  88.6  2e-16  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.560509  normal 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2658  OsmC family protein  38.85 
 
 
133 aa  86.3  8e-16  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.653298  normal  0.498397 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2484  OsmC family protein  33.85 
 
 
133 aa  84.7  0.000000000000003  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal  0.092178 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_5525  OsmC family protein  39.06 
 
 
133 aa  84.3  0.000000000000004  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_1423  hypothetical protein  39.69 
 
 
133 aa  83.6  0.000000000000006  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0240  hypothetical protein  39.69 
 
 
133 aa  83.6  0.000000000000006  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2518  hypothetical protein  39.69 
 
 
133 aa  83.6  0.000000000000006  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.0608844  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2657  putative hydrolase  39.69 
 
 
133 aa  83.6  0.000000000000006  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0949  hydrolase  39.69 
 
 
133 aa  83.2  0.000000000000007  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3689  OsmC family protein  38.28 
 
 
133 aa  83.2  0.000000000000008  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal  0.952273 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0518  OsmC-like protein superfamily protein  38.93 
 
 
153 aa  82.8  0.000000000000009  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_3616  osmotically inducible protein  40.59 
 
 
129 aa  77  0.0000000000005  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000818818  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1628  OsmC-like protein  31.3 
 
 
138 aa  76.6  0.0000000000007  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal  0.0181271 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2193  OsmC family protein  40.37 
 
 
129 aa  75.1  0.000000000002  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.208378  normal 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1279  dipeptidyl aminopeptidase/acylaminoacyl-peptidase-like protein  31.54 
 
 
261 aa  75.1  0.000000000002  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.000359236  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1619  hypothetical protein  38.17 
 
 
129 aa  75.5  0.000000000002  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0276  hypothetical protein  38.17 
 
 
129 aa  75.5  0.000000000002  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0929  putative hydrolase  25.59 
 
 
252 aa  74.7  0.000000000002  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.119531  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5556  OsmC-like protein  37.38 
 
 
130 aa  73.2  0.000000000007  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  hitchhiker  0.0000078778  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2142  OsmC family protein  34.09 
 
 
129 aa  72  0.00000000002  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3965  OsmC family protein  38.78 
 
 
132 aa  70.9  0.00000000004  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1578  dienelactone hydrolase  24.66 
 
 
255 aa  69.3  0.0000000001  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2898  OsmC-like protein  32.52 
 
 
135 aa  68.2  0.0000000002  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal  0.533642 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0251  OsmC family protein  33.33 
 
 
134 aa  68.6  0.0000000002  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.798103  normal  0.164531 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0376  hypothetical protein  33.33 
 
 
134 aa  68.2  0.0000000003  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0232  OsmC family protein  34.23 
 
 
134 aa  67.4  0.0000000005  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0601  dienelactone hydrolase  25.11 
 
 
259 aa  63.2  0.000000008  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE1727  hypothetical protein  42.37 
 
 
138 aa  62.4  0.00000001  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2505  OsmC family protein  28.35 
 
 
147 aa  62.4  0.00000001  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007798  NSE_0472  putative hydrolase  27.69 
 
 
279 aa  61.2  0.00000003  Neorickettsia sennetsu str. Miyayama  Bacteria  normal  0.465833  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3928  hypothetical protein  28.12 
 
 
728 aa  60.8  0.00000004  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3253  hypothetical protein  27.34 
 
 
728 aa  60.1  0.00000007  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>