47 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Krad_3648 on replicon NC_009664
Organism: Kineococcus radiotolerans SRS30216



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009664  Krad_3648  OsmC family protein  100 
 
 		 167 aa  335  1.9999999999999998e-91  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1639  OsmC family protein  57.49 
 
 		 167 aa  192  1e-48  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.945103  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1145  OsmC family protein  55.42 
 
 		 167 aa  184  6e-46  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.354032  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2855  OsmC family protein  51.83 
 
 		 169 aa  165  2.9999999999999998e-40  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.0000502537  normal  0.0640135 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0867  OsmC family protein  50 
 
 		 169 aa  162  2.0000000000000002e-39  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.376239  hitchhiker  0.00350915 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0693  OsmC-like protein  48.48 
 
 		 168 aa  162  2.0000000000000002e-39  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0225  OsmC-like protein  50 
 
 		 169 aa  160  6e-39  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.439807  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0330  OsmC family protein  48.48 
 
 		 169 aa  159  1e-38  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.514624  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_2189  OsmC family protein  49.39 
 
 		 169 aa  158  3e-38  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.0335227  normal  0.683604 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0377  OsmC family protein  48.48 
 
 		 169 aa  158  3e-38  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0407  OsmC family protein  48.48 
 
 		 169 aa  157  9e-38  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.0496053  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1148  OsmC family protein  48.17 
 
 		 169 aa  154  5.0000000000000005e-37  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7644  hypothetical protein  46.95 
 
 		 170 aa  152  1e-36  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.601343  normal  0.571261 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2892  OsmC family protein  47.56 
 
 		 169 aa  152  2e-36  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.851644  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0781  OsmC family protein  48.17 
 
 		 169 aa  149  1e-35  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.764307  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0031  OsmC-like protein  46.34 
 
 		 169 aa  149  2e-35  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.975846 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0112  OsmC-like protein  46.95 
 
 		 169 aa  147  1.0000000000000001e-34  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.636366  normal  0.66012 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1411  OsmC family protein  47.59 
 
 		 153 aa  140  9e-33  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.431224  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1127  OsmC family protein  46.1 
 
 		 168 aa  139  1.9999999999999998e-32  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  0.938023 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0684  OsmC-like protein  45.4 
 
 		 167 aa  116  9.999999999999999e-26  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.503679  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_2206  OsmC family protein  39.39 
 
 		 168 aa  101  5e-21  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  0.742376 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0441  OsmC family protein  31.96 
 
 		 189 aa  62  0.000000003  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.488218  normal  0.432032 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2788  hypothetical protein  29.36 
 
 		 186 aa  61.2  0.000000007  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6241  OsmC family protein  31.25 
 
 		 182 aa  55.1  0.0000004  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0196837  normal  0.733472 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2488  hypothetical protein  29.09 
 
 		 202 aa  53.5  0.000001  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2488  OsmC family protein  28.7 
 
 		 172 aa  49.7  0.00002  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.0230337  normal  0.160295 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_4241  OsmC family protein  33.67 
 
 		 202 aa  48.9  0.00003  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1644  OsmC family protein  25.23 
 
 		 193 aa  47.4  0.0001  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2638  hypothetical protein  25.44 
 
 		 137 aa  46.6  0.0002  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2354  OsmC-like protein  27.72 
 
 		 170 aa  46.2  0.0002  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.572746  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2505  OsmC family protein  25.69 
 
 		 147 aa  46.2  0.0002  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1413  OsmC family protein  24.84 
 
 		 140 aa  45.8  0.0003  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1026  OsmC family protein  34.21 
 
 		 206 aa  45.1  0.0005  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2254  OsmC-like protein  30.21 
 
 		 199 aa  44.7  0.0005  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.0977605  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3413  OsmC family protein  26.58 
 
 		 171 aa  43.9  0.001  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2570  OsmC family protein  26.13 
 
 		 187 aa  43.9  0.001  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011885  Cyan7425_0190  OsmC family protein  24.56 
 
 		 189 aa  43.5  0.001  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  n/a    normal  0.155362 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0339  OsmC family protein  22.02 
 
 		 145 aa  43.5  0.001  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.53983  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2794  OsmC family protein  24.07 
 
 		 142 aa  43.1  0.002  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1172  OsmC-like protein  29.2 
 
 		 149 aa  43.1  0.002  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.286311  normal  0.336664 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1892  OsmC-like protein  28.41 
 
 		 148 aa  42.7  0.002  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4264  hypothetical protein  23.21 
 
 		 184 aa  42.4  0.003  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1436  OsmC family protein  24.31 
 
 		 134 aa  42  0.004  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0623  hypothetical protein  26.21 
 
 		 176 aa  41.2  0.006  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  decreased coverage  0.0005983  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0310  OsmC family protein  28.12 
 
 		 186 aa  41.2  0.007  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1341  OsmC family protein  19.26 
 
 		 133 aa  41.2  0.007  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1593  OsmC family protein  24 
 
 		 141 aa  40.8  0.009  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>