21 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rleg_0310 on replicon NC_012850
Organism: Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_012850  Rleg_0310  OsmC family protein  100 
 
 
186 aa  382  1e-105  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0279  OsmC family protein  91.49 
 
 
142 aa  269  2e-71  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0834  hypothetical protein  66.43 
 
 
143 aa  201  4e-51  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4634  OsmC family protein  67.38 
 
 
143 aa  185  4e-46  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal  0.46225 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1413  OsmC family protein  48.23 
 
 
140 aa  144  8.000000000000001e-34  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0458  OsmC-like protein  37.69 
 
 
155 aa  81.6  0.000000000000007  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.725308  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3619  OsmC family protein  34.17 
 
 
149 aa  49.3  0.00003  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.108059  hitchhiker  0.0000417493 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5976  OsmC family protein  37 
 
 
130 aa  48.5  0.00006  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2578  OsmC family protein  23.53 
 
 
142 aa  44.3  0.001  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_6486  OsmC family protein  27.34 
 
 
138 aa  42.4  0.003  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_5733  OsmC family protein  27.34 
 
 
138 aa  42.7  0.003  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.930531  normal  0.319768 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4967  OsmC family protein  26.67 
 
 
141 aa  42.4  0.004  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.35536  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2927  OsmC-like protein  28.16 
 
 
142 aa  42.4  0.004  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.855798  normal  0.446671 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4004  OsmC family protein  32.8 
 
 
136 aa  42  0.005  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.911432  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE1727  hypothetical protein  32.98 
 
 
138 aa  42  0.005  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1204  OsmC family protein  27.62 
 
 
140 aa  41.2  0.008  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal  0.0357718 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1194  OsmC family protein  27.62 
 
 
140 aa  41.2  0.008  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1177  OsmC-like protein  27.62 
 
 
140 aa  41.2  0.008  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.772559  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3491  OsmC family protein  27.05 
 
 
131 aa  41.2  0.009  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3648  OsmC family protein  28.12 
 
 
167 aa  41.2  0.009  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2348  OsmC family protein  26.73 
 
 
163 aa  40.8  0.01  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.684792  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>