190 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Arth_2348 on replicon NC_008541
Organism: Arthrobacter sp. FB24



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008541  Arth_2348  OsmC family protein  100 
 
 
163 aa  328  1e-89  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.684792  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2557  OsmC family protein  57.94 
 
 
138 aa  152  2e-36  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.00000559572  hitchhiker  0.00383779 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0541  OsmC family protein  54.35 
 
 
151 aa  150  7e-36  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.489752  normal 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0361  OsmC family protein  55.12 
 
 
140 aa  147  6e-35  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_4465  OsmC-like protein  50.68 
 
 
248 aa  137  3.9999999999999997e-32  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0395  OsmC family protein  52.8 
 
 
138 aa  132  3e-30  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4617  OsmC family protein  56 
 
 
133 aa  131  3e-30  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  normal  0.327663 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1613  OsmC family protein  55.2 
 
 
133 aa  131  3.9999999999999996e-30  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3081  OsmC-like protein  37.9 
 
 
134 aa  92  3e-18  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.344842  normal 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_4221  OsmC family protein  34.15 
 
 
135 aa  90.1  1e-17  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.741744  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_4072  hypothetical protein  34.15 
 
 
134 aa  89.4  2e-17  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.0853904  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_4196  OsmC family protein  34.15 
 
 
135 aa  89.4  2e-17  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0351  OsmC family protein  34.75 
 
 
134 aa  89.4  2e-17  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.999657  normal  0.881663 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1605  OsmC family protein  38.71 
 
 
161 aa  89  3e-17  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_3179  OsmC family protein  38.53 
 
 
159 aa  83.2  0.000000000000002  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1919  OsmC family protein  39.05 
 
 
131 aa  79.7  0.00000000000002  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.148561  normal 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0382  hypothetical protein  28.8 
 
 
134 aa  79  0.00000000000003  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0335  OsmC family protein  35.19 
 
 
127 aa  75.5  0.0000000000003  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  0.252391  normal 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1489  OsmC family protein  31.09 
 
 
181 aa  74.7  0.0000000000005  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.172419  normal 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0887  hypothetical protein  29.66 
 
 
132 aa  73.2  0.000000000001  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.873349  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1267  OsmC family protein  37.27 
 
 
130 aa  72  0.000000000003  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1251  OsmC family protein  27.97 
 
 
134 aa  71.2  0.000000000005  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.106129  normal  0.568503 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1368  OsmC family protein  36.36 
 
 
130 aa  71.2  0.000000000006  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.0210899 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0908  OsmC-like protein  36.36 
 
 
130 aa  70.9  0.000000000006  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1429  OsmC family protein  27.91 
 
 
135 aa  71.2  0.000000000006  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.640592  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1390  OsmC family protein  36.36 
 
 
130 aa  70.9  0.000000000006  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.51882  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4533  OsmC-like protein  36.36 
 
 
130 aa  70.9  0.000000000007  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.257374 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1301  OsmC family protein  36.36 
 
 
130 aa  70.5  0.000000000009  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal  0.0499071 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1341  OsmC family protein  28.21 
 
 
133 aa  70.1  0.00000000001  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3965  OsmC family protein  34.71 
 
 
132 aa  69.3  0.00000000002  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1917  OsmC family protein  36.36 
 
 
130 aa  69.7  0.00000000002  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.591016  normal  0.655521 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3145  redox protein regulator of disulfide bond formation, OsmC-like  33.64 
 
 
132 aa  68.6  0.00000000004  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.102127 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1835  OsmC-like protein  32.35 
 
 
407 aa  68.6  0.00000000004  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1130  hypothetical protein  27.2 
 
 
135 aa  67.8  0.00000000006  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  normal  0.362808 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1930  OsmC family protein  30.41 
 
 
407 aa  66.6  0.0000000001  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.0101124  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_4048  OsmC family protein  31.76 
 
 
415 aa  66.2  0.0000000002  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  unclonable  0.0000134708  normal 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1403  OsmC family protein  31.82 
 
 
132 aa  64.3  0.0000000006  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0655694  normal  0.111545 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1001  OsmC family protein  26.02 
 
 
135 aa  64.7  0.0000000006  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1673  OsmC-like protein  30.28 
 
 
409 aa  63.9  0.0000000008  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6635  OsmC family protein  34.23 
 
 
411 aa  62.8  0.000000002  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.659004  hitchhiker  0.00000360166 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3491  OsmC family protein  28.18 
 
 
131 aa  62.8  0.000000002  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0979  OsmC family protein  32.88 
 
 
418 aa  62.8  0.000000002  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_48750  hypothetical protein  31.19 
 
 
135 aa  61.6  0.000000004  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000274485 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1628  OsmC-like protein  29.03 
 
 
138 aa  61.6  0.000000005  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal  0.0181271 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0342  OsmC family protein  30.7 
 
 
135 aa  60.8  0.000000008  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  0.720795  normal  0.012657 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0974  OsmC family protein  33.64 
 
 
128 aa  60.5  0.00000001  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.637714  normal  0.331477 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2717  OsmC-like protein  26.92 
 
 
135 aa  59.3  0.00000002  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00712413 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3214  hypothetical protein  28.21 
 
 
734 aa  59.3  0.00000002  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.668386  normal  0.254813 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2280  OsmC-like protein  26.03 
 
 
406 aa  59.3  0.00000002  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal  0.423404 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2898  OsmC-like protein  29.81 
 
 
135 aa  59.3  0.00000002  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal  0.533642 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0921  OsmC family protein  30.63 
 
 
136 aa  59.7  0.00000002  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.418667  normal 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1950  OsmC family protein  29.57 
 
 
132 aa  59.7  0.00000002  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.378128  normal 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0982  OsmC family protein  38.75 
 
 
127 aa  59.7  0.00000002  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4175  hypothetical protein  28.7 
 
 
135 aa  59.7  0.00000002  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.214068  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0034  hypothetical protein  28.97 
 
 
735 aa  58.9  0.00000003  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1206  OsmC family protein  28.76 
 
 
413 aa  58.9  0.00000003  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.423514  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2505  OsmC family protein  29.37 
 
 
147 aa  58.5  0.00000003  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4103  OsmC family protein  28.93 
 
 
402 aa  58.2  0.00000004  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.671514  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2873  hypothetical protein  29.36 
 
 
405 aa  58.5  0.00000004  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.326467  normal  0.0265941 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0976  OsmC family protein  33.96 
 
 
118 aa  57.8  0.00000006  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0845  OsmC family protein  29.63 
 
 
132 aa  57.8  0.00000006  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  normal  0.0344874 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2694  OsmC-like protein  27.87 
 
 
406 aa  57.4  0.00000008  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1595  OsmC family protein  29.46 
 
 
134 aa  56.6  0.0000001  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2142  OsmC family protein  37.84 
 
 
129 aa  57  0.0000001  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3592  protein of unknown function DUF181  29.06 
 
 
734 aa  56.6  0.0000001  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.0680194  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2279  OsmC family protein  29.46 
 
 
155 aa  57  0.0000001  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.0377998  normal  0.182149 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1146  hypothetical protein  27.35 
 
 
732 aa  57  0.0000001  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.202327  normal  0.214349 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1440  OsmC family protein  26.87 
 
 
142 aa  57  0.0000001  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2710  hypothetical protein  26.5 
 
 
731 aa  55.8  0.0000002  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal  0.579153 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3633  OsmC-like protein  26.03 
 
 
406 aa  55.8  0.0000002  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal  0.525721 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7018  OsmC family protein  31.09 
 
 
412 aa  55.5  0.0000003  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00716876 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1438  OsmC family protein  29.81 
 
 
137 aa  55.5  0.0000003  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal  0.139134 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1923  OsmC-like protein  38.46 
 
 
127 aa  55.5  0.0000003  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0941  OsmC family protein  31.19 
 
 
409 aa  55.5  0.0000003  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.3755  normal  0.451532 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3569  hypothetical protein  23.48 
 
 
727 aa  55.5  0.0000003  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5571  OsmC family protein  27.66 
 
 
408 aa  55.5  0.0000003  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal  0.0439292 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3787  hypothetical protein  22.61 
 
 
729 aa  55.1  0.0000004  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.859391  normal 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3599  protein of unknown function DUF181  22.61 
 
 
729 aa  55.1  0.0000004  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3928  hypothetical protein  22.61 
 
 
728 aa  55.1  0.0000004  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0643  hypothetical protein  22.61 
 
 
729 aa  55.1  0.0000004  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3199  hypothetical protein  22.61 
 
 
728 aa  55.1  0.0000004  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3664  hypothetical protein  22.61 
 
 
729 aa  55.1  0.0000004  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4822  hypothetical protein  26.5 
 
 
734 aa  55.1  0.0000005  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  decreased coverage  0.000227003  normal  0.373155 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2354  OsmC-like protein  30.58 
 
 
170 aa  54.7  0.0000005  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.572746  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3476  OsmC family protein  25 
 
 
135 aa  54.7  0.0000005  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  0.00107457  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1856  OsmC family protein  27.45 
 
 
129 aa  55.1  0.0000005  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.610023  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3253  hypothetical protein  22.61 
 
 
728 aa  54.3  0.0000006  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2174  hypothetical protein  24.79 
 
 
728 aa  54.3  0.0000007  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2484  OsmC family protein  29.03 
 
 
133 aa  54.3  0.0000007  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal  0.092178 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3321  hypothetical protein  22.61 
 
 
742 aa  54.3  0.0000008  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0632  hypothetical protein  22.61 
 
 
742 aa  54.3  0.0000008  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3489  hypothetical protein  22.61 
 
 
742 aa  54.3  0.0000008  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0339  OsmC family protein  27.87 
 
 
145 aa  53.5  0.000001  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.53983  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0824  hypothetical protein  23.48 
 
 
728 aa  53.5  0.000001  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.0307116  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1082  OsmC-like family protein  25.62 
 
 
141 aa  53.5  0.000001  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.0521945  normal  0.207247 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_2073  hypothetical protein  27.27 
 
 
734 aa  53.5  0.000001  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_3620  hypothetical protein  25.64 
 
 
728 aa  52.8  0.000002  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1013  OsmC-like protein  30.19 
 
 
423 aa  52.8  0.000002  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.325781  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2113  hypothetical protein  25.64 
 
 
728 aa  52.8  0.000002  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.20686  normal 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3211  hypothetical protein  22.61 
 
 
728 aa  52.8  0.000002  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.357431  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>