120 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ajs_2279 on replicon NC_008782
Organism: Acidovorax sp. JS42



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008782  Ajs_2279  OsmC family protein  100 
 
 
155 aa  318  9.999999999999999e-87  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.0377998  normal  0.182149 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1595  OsmC family protein  99.25 
 
 
134 aa  272  1.0000000000000001e-72  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2898  OsmC-like protein  69.92 
 
 
135 aa  177  4e-44  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal  0.533642 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3965  OsmC family protein  53.49 
 
 
132 aa  143  7.0000000000000006e-34  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2484  OsmC family protein  49.57 
 
 
133 aa  116  9.999999999999999e-26  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal  0.092178 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1628  OsmC-like protein  42.19 
 
 
138 aa  104  4e-22  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal  0.0181271 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0376  hypothetical protein  48.04 
 
 
134 aa  103  1e-21  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0251  OsmC family protein  47.92 
 
 
134 aa  102  2e-21  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.798103  normal  0.164531 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0232  OsmC family protein  47.92 
 
 
134 aa  100  5e-21  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1832  OsmC-like protein  46.73 
 
 
133 aa  99  2e-20  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_3616  osmotically inducible protein  44.44 
 
 
129 aa  89.4  2e-17  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000818818  normal 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1440  OsmC family protein  38.83 
 
 
142 aa  81.6  0.000000000000004  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3145  redox protein regulator of disulfide bond formation, OsmC-like  38.46 
 
 
132 aa  78.6  0.00000000000003  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.102127 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1919  OsmC family protein  35.78 
 
 
131 aa  79  0.00000000000003  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.148561  normal 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1301  OsmC family protein  40.59 
 
 
130 aa  77.8  0.00000000000005  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal  0.0499071 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1267  OsmC family protein  37.61 
 
 
130 aa  75.5  0.0000000000002  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1368  OsmC family protein  36.7 
 
 
130 aa  75.5  0.0000000000002  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.0210899 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0908  OsmC-like protein  36.7 
 
 
130 aa  75.5  0.0000000000003  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1390  OsmC family protein  36.7 
 
 
130 aa  75.5  0.0000000000003  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.51882  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4533  OsmC-like protein  36.7 
 
 
130 aa  74.3  0.0000000000005  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.257374 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_12698  hypothetical protein  34.38 
 
 
405 aa  74.7  0.0000000000005  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5556  OsmC-like protein  37.38 
 
 
130 aa  74.3  0.0000000000006  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  hitchhiker  0.0000078778  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6635  OsmC family protein  32.87 
 
 
411 aa  73.9  0.0000000000007  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.659004  hitchhiker  0.00000360166 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1403  OsmC family protein  36.54 
 
 
132 aa  73.6  0.000000000001  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0655694  normal  0.111545 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1856  OsmC family protein  30.83 
 
 
129 aa  72  0.000000000003  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.610023  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1917  OsmC family protein  37.62 
 
 
130 aa  72  0.000000000003  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.591016  normal  0.655521 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_48750  hypothetical protein  37.39 
 
 
135 aa  71.2  0.000000000005  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000274485 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4175  hypothetical protein  36.84 
 
 
135 aa  70.5  0.000000000007  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.214068  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1950  OsmC family protein  37.25 
 
 
132 aa  70.5  0.000000000008  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.378128  normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0921  OsmC family protein  36.63 
 
 
136 aa  70.1  0.00000000001  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.418667  normal 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2717  OsmC-like protein  32.11 
 
 
135 aa  67  0.00000000009  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00712413 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1835  OsmC-like protein  30.89 
 
 
407 aa  65.5  0.0000000002  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2694  OsmC-like protein  30.77 
 
 
406 aa  65.5  0.0000000002  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3491  OsmC family protein  30.3 
 
 
131 aa  65.9  0.0000000002  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4103  OsmC family protein  32.81 
 
 
402 aa  66.2  0.0000000002  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.671514  normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1930  OsmC family protein  32.52 
 
 
407 aa  65.1  0.0000000003  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.0101124  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7018  OsmC family protein  32.03 
 
 
412 aa  65.1  0.0000000004  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00716876 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5429  OsmC family protein  32.71 
 
 
397 aa  65.1  0.0000000004  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_4048  OsmC family protein  34.26 
 
 
415 aa  64.7  0.0000000005  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  unclonable  0.0000134708  normal 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2280  OsmC-like protein  31.91 
 
 
406 aa  64.3  0.0000000006  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal  0.423404 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1840  hypothetical protein  34.48 
 
 
405 aa  64.3  0.0000000006  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal  0.949047 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1082  OsmC-like family protein  33.01 
 
 
141 aa  63.5  0.0000000009  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.0521945  normal  0.207247 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1438  OsmC family protein  31.34 
 
 
137 aa  62.8  0.000000002  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal  0.139134 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0732  OsmC family protein  39.05 
 
 
137 aa  62.8  0.000000002  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.560509  normal 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0049  OsmC family protein  29.37 
 
 
406 aa  62  0.000000003  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1206  OsmC family protein  33.33 
 
 
413 aa  61.6  0.000000004  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.423514  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0979  OsmC family protein  31.96 
 
 
418 aa  60.8  0.000000007  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1673  OsmC-like protein  31.25 
 
 
409 aa  59.7  0.00000001  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1013  OsmC-like protein  31.67 
 
 
423 aa  60.1  0.00000001  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.325781  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2873  hypothetical protein  27.86 
 
 
405 aa  59.7  0.00000001  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.326467  normal  0.0265941 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4769  OsmC family protein  31.36 
 
 
153 aa  58.9  0.00000002  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  hitchhiker  0.00807264  hitchhiker  0.00049584 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3633  OsmC-like protein  31.25 
 
 
406 aa  59.3  0.00000002  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal  0.525721 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3762  OsmC family protein  33.67 
 
 
410 aa  59.3  0.00000002  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5571  OsmC family protein  28.57 
 
 
408 aa  59.3  0.00000002  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal  0.0439292 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2193  OsmC family protein  37.14 
 
 
129 aa  57.8  0.00000005  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.208378  normal 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3655  OsmC family protein  32.65 
 
 
410 aa  57.8  0.00000006  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2348  OsmC family protein  29.46 
 
 
163 aa  57  0.00000009  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.684792  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1777  OsmC-like protein  31.15 
 
 
410 aa  55.5  0.0000003  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.0113862  normal 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0941  OsmC family protein  28.68 
 
 
409 aa  55.5  0.0000003  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.3755  normal  0.451532 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6443  OsmC family protein  28.57 
 
 
408 aa  53.5  0.0000009  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.588479  normal 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1923  OsmC-like protein  41.82 
 
 
127 aa  53.5  0.000001  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0897  OsmC family protein  29.91 
 
 
145 aa  53.5  0.000001  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.669017  normal 
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_1560  OsmC family protein  35.38 
 
 
88 aa  52.4  0.000002  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0974  OsmC family protein  33.01 
 
 
128 aa  52  0.000003  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.637714  normal  0.331477 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_6150  OsmC family protein  27.73 
 
 
408 aa  52  0.000003  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.773624  normal 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2297  OsmC-like protein  33.93 
 
 
133 aa  51.6  0.000004  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.922047  normal  0.948773 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4564  OsmC-like protein  31.82 
 
 
133 aa  51.6  0.000004  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3799  OsmC family protein  31.82 
 
 
133 aa  51.6  0.000004  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.732158  normal  0.104892 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3725  OsmC family protein  31.82 
 
 
133 aa  51.6  0.000004  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.196532 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1436  OsmC family protein  28.12 
 
 
134 aa  51.6  0.000004  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_10251  redox protein, regulator of disulfide bond formation  30.09 
 
 
135 aa  50.1  0.00001  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2354  OsmC-like protein  28.95 
 
 
170 aa  49.3  0.00002  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.572746  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4937  OsmC family protein  32.17 
 
 
133 aa  49.3  0.00002  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal  0.659641 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_5525  OsmC family protein  31.82 
 
 
133 aa  48.9  0.00003  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2142  OsmC family protein  27.12 
 
 
129 aa  48.5  0.00003  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3689  OsmC family protein  31.82 
 
 
133 aa  48.5  0.00003  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal  0.952273 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0518  OsmC-like protein superfamily protein  30.36 
 
 
153 aa  47.8  0.00006  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0541  OsmC family protein  29.17 
 
 
151 aa  47.8  0.00006  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.489752  normal 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0443  OsmC-like protein  37.88 
 
 
176 aa  47.4  0.00007  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.16081  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0949  hydrolase  29.46 
 
 
133 aa  45.8  0.0002  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4617  OsmC family protein  25 
 
 
133 aa  45.4  0.0002  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  normal  0.327663 
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0240  hypothetical protein  29.46 
 
 
133 aa  45.4  0.0003  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_4465  OsmC-like protein  30.28 
 
 
248 aa  45.4  0.0003  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_1423  hypothetical protein  29.46 
 
 
133 aa  45.4  0.0003  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2657  putative hydrolase  29.46 
 
 
133 aa  45.4  0.0003  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2518  hypothetical protein  29.46 
 
 
133 aa  45.4  0.0003  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.0608844  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0982  OsmC family protein  42 
 
 
127 aa  45.4  0.0003  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0335  OsmC family protein  35.71 
 
 
127 aa  45.4  0.0003  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  0.252391  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3526  OsmC family protein  27.74 
 
 
177 aa  45.4  0.0003  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.7407  normal  0.298467 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_4221  OsmC family protein  25.22 
 
 
135 aa  45.1  0.0003  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.741744  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2658  OsmC family protein  28.89 
 
 
133 aa  45.1  0.0004  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.653298  normal  0.498397 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_4196  OsmC family protein  25.22 
 
 
135 aa  45.1  0.0004  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_4072  hypothetical protein  24.35 
 
 
134 aa  43.9  0.0008  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.0853904  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3413  OsmC family protein  30.33 
 
 
171 aa  43.9  0.0009  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0887  hypothetical protein  21.05 
 
 
132 aa  43.1  0.001  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.873349  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0526  OsmC-like protein protein  33.67 
 
 
145 aa  43.5  0.001  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  normal  0.455269 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1613  OsmC family protein  25.74 
 
 
133 aa  43.5  0.001  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2557  OsmC family protein  25.96 
 
 
138 aa  43.5  0.001  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.00000559572  hitchhiker  0.00383779 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3485  OsmC family protein  38.46 
 
 
185 aa  43.5  0.001  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0339  OsmC family protein  25 
 
 
145 aa  43.1  0.001  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.53983  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>