117 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene BamMC406_3689 on replicon NC_010552
Organism: Burkholderia ambifaria MC40-6



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010552  BamMC406_3689  OsmC family protein  100 
 
 		 133 aa  272  1.0000000000000001e-72  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.952273 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_5525  OsmC family protein  97.74 
 
 		 133 aa  249  6e-66  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2297  OsmC-like protein  89.47 
 
 		 133 aa  243  4.9999999999999997e-64  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.922047  normal  0.948773 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4564  OsmC-like protein  87.97 
 
 		 133 aa  238  2e-62  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3799  OsmC family protein  87.97 
 
 		 133 aa  238  2e-62  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.732158  normal  0.104892 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3725  OsmC family protein  87.97 
 
 		 133 aa  238  2e-62  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.196532 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4937  OsmC family protein  87.12 
 
 		 133 aa  238  2.9999999999999997e-62  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.659641 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0518  OsmC-like protein superfamily protein  69.92 
 
 		 153 aa  195  2.0000000000000003e-49  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0240  hypothetical protein  69.17 
 
 		 133 aa  194  3e-49  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_1423  hypothetical protein  69.17 
 
 		 133 aa  194  3e-49  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2657  putative hydrolase  69.17 
 
 		 133 aa  194  3e-49  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2518  hypothetical protein  69.17 
 
 		 133 aa  194  3e-49  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.0608844  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0949  hydrolase  68.42 
 
 		 133 aa  194  4.0000000000000005e-49  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1619  hypothetical protein  67.67 
 
 		 129 aa  186  1e-46  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0276  hypothetical protein  67.67 
 
 		 129 aa  186  1e-46  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0974  OsmC family protein  45.31 
 
 		 128 aa  112  1.0000000000000001e-24  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.637714  normal  0.331477 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0982  OsmC family protein  45.38 
 
 		 127 aa  104  4e-22  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2193  OsmC family protein  44.09 
 
 		 129 aa  102  2e-21  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.208378  normal  1 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_6150  OsmC family protein  42.5 
 
 		 408 aa  96.7  9e-20  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.773624  normal  1 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6443  OsmC family protein  41.67 
 
 		 408 aa  94.4  4e-19  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.588479  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1923  OsmC-like protein  43.1 
 
 		 127 aa  91.7  3e-18  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_12698  hypothetical protein  35.97 
 
 		 405 aa  89.7  1e-17  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2142  OsmC family protein  40.54 
 
 		 129 aa  89.4  1e-17  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1777  OsmC-like protein  40.77 
 
 		 410 aa  87.4  6e-17  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.0113862  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2717  OsmC-like protein  39.82 
 
 		 135 aa  86.7  1e-16  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00712413 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3762  OsmC family protein  38.93 
 
 		 410 aa  86.7  1e-16  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_4048  OsmC family protein  40.71 
 
 		 415 aa  84.7  4e-16  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  unclonable  0.0000134708  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3655  OsmC family protein  38.17 
 
 		 410 aa  84.3  5e-16  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4533  OsmC-like protein  38.46 
 
 		 130 aa  84  6e-16  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.257374 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1301  OsmC family protein  38.46 
 
 		 130 aa  84  6e-16  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.0499071 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1267  OsmC family protein  37.61 
 
 		 130 aa  82.8  0.000000000000001  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2873  hypothetical protein  39.83 
 
 		 405 aa  82.8  0.000000000000001  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.326467  normal  0.0265941 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4769  OsmC family protein  35.16 
 
 		 153 aa  81.6  0.000000000000003  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  hitchhiker  0.00807264  hitchhiker  0.00049584 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1840  hypothetical protein  38.93 
 
 		 405 aa  81.3  0.000000000000004  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  0.949047 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1440  OsmC family protein  34.51 
 
 		 142 aa  80.9  0.000000000000006  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0908  OsmC-like protein  36.75 
 
 		 130 aa  80.5  0.000000000000006  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1390  OsmC family protein  36.75 
 
 		 130 aa  80.5  0.000000000000006  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.51882  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0921  OsmC family protein  34.09 
 
 		 136 aa  80.5  0.000000000000006  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.418667  normal  1 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1368  OsmC family protein  36.75 
 
 		 130 aa  80.9  0.000000000000006  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.0210899 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1917  OsmC family protein  37.29 
 
 		 130 aa  80.5  0.000000000000007  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.591016  normal  0.655521 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2694  OsmC-like protein  37.29 
 
 		 406 aa  79.7  0.00000000000001  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0732  OsmC family protein  41.74 
 
 		 137 aa  79.7  0.00000000000001  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.560509  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6635  OsmC family protein  36.51 
 
 		 411 aa  79  0.00000000000002  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.659004  hitchhiker  0.00000360166 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0941  OsmC family protein  42.11 
 
 		 409 aa  79  0.00000000000002  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.3755  normal  0.451532 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2484  OsmC family protein  38.79 
 
 		 133 aa  79  0.00000000000002  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  0.092178 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4175  hypothetical protein  36.97 
 
 		 135 aa  78.6  0.00000000000003  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.214068  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0049  OsmC family protein  37.6 
 
 		 406 aa  78.6  0.00000000000003  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3145  redox protein regulator of disulfide bond formation, OsmC-like  36.13 
 
 		 132 aa  77.8  0.00000000000005  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.102127 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1403  OsmC family protein  34.45 
 
 		 132 aa  77.4  0.00000000000006  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0655694  normal  0.111545 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1082  OsmC-like family protein  31.36 
 
 		 141 aa  77.4  0.00000000000007  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.0521945  normal  0.207247 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3491  OsmC family protein  35.71 
 
 		 131 aa  77  0.00000000000008  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0979  OsmC family protein  37.5 
 
 		 418 aa  76.6  0.0000000000001  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2280  OsmC-like protein  36.44 
 
 		 406 aa  75.5  0.0000000000002  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  0.423404 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1013  OsmC-like protein  38.17 
 
 		 423 aa  75.9  0.0000000000002  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.325781  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_48750  hypothetical protein  36.13 
 
 		 135 aa  75.5  0.0000000000002  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000274485 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1673  OsmC-like protein  34.4 
 
 		 409 aa  75.1  0.0000000000003  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1930  OsmC family protein  34.55 
 
 		 407 aa  73.6  0.0000000000008  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.0101124  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1950  OsmC family protein  33.33 
 
 		 132 aa  71.6  0.000000000003  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.378128  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1206  OsmC family protein  38.71 
 
 		 413 aa  71.2  0.000000000005  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.423514  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4103  OsmC family protein  34.45 
 
 		 402 aa  70.9  0.000000000005  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.671514  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7018  OsmC family protein  37.1 
 
 		 412 aa  70.9  0.000000000005  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00716876 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1835  OsmC-like protein  31.15 
 
 		 407 aa  70.5  0.000000000008  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3633  OsmC-like protein  31.97 
 
 		 406 aa  67.8  0.00000000005  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.525721 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5429  OsmC family protein  31.3 
 
 		 397 aa  66.6  0.00000000009  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5571  OsmC family protein  31.25 
 
 		 408 aa  65.5  0.0000000003  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.0439292 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1919  OsmC family protein  36.89 
 
 		 131 aa  63.9  0.0000000008  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.148561  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1628  OsmC-like protein  31.25 
 
 		 138 aa  62.4  0.000000002  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0181271 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1438  OsmC family protein  33.33 
 
 		 137 aa  62.8  0.000000002  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.139134 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1856  OsmC family protein  31.86 
 
 		 129 aa  60.5  0.000000008  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.610023  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2898  OsmC-like protein  34.95 
 
 		 135 aa  57.4  0.00000006  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.533642 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0251  OsmC family protein  30.56 
 
 		 134 aa  57  0.00000008  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.798103  normal  0.164531 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0232  OsmC family protein  34.41 
 
 		 134 aa  56.6  0.0000001  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3965  OsmC family protein  32.74 
 
 		 132 aa  53.9  0.0000007  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc0376  hypothetical protein  29.81 
 
 		 134 aa  52  0.000002  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_3616  osmotically inducible protein  30.16 
 
 		 129 aa  52.8  0.000002  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000818818  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2658  OsmC family protein  29.75 
 
 		 133 aa  52.4  0.000002  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.653298  normal  0.498397 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1436  OsmC family protein  29.47 
 
 		 134 aa  50.8  0.000006  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1489  OsmC family protein  26.14 
 
 		 181 aa  49.3  0.00002  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.172419  normal  1 
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_1560  OsmC family protein  45.1 
 
 		 88 aa  48.5  0.00003  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1595  OsmC family protein  32.14 
 
 		 134 aa  48.1  0.00003  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2279  OsmC family protein  31.82 
 
 		 155 aa  48.1  0.00004  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.0377998  normal  0.182149 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0339  OsmC family protein  27.73 
 
 		 145 aa  47.4  0.00007  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.53983  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2488  OsmC family protein  30.95 
 
 		 172 aa  47.4  0.00007  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.0230337  normal  0.160295 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0466  OsmC-like protein  35.44 
 
 		 140 aa  46.2  0.0001  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  hitchhiker  0.0000000604896  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1832  OsmC-like protein  31.62 
 
 		 133 aa  45.8  0.0002  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0887  hypothetical protein  26.25 
 
 		 132 aa  44.7  0.0004  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.873349  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3253  hypothetical protein  26.36 
 
 		 728 aa  44.7  0.0004  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5556  OsmC-like protein  27.84 
 
 		 130 aa  44.3  0.0006  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  hitchhiker  0.0000078778  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02028  hypothetical protein  38.03 
 
 		 92 aa  43.9  0.0006  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.326334  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3321  hypothetical protein  25.45 
 
 		 742 aa  43.5  0.001  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0632  hypothetical protein  25.45 
 
 		 742 aa  43.5  0.001  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3489  hypothetical protein  25.45 
 
 		 742 aa  43.5  0.001  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3928  hypothetical protein  25.45 
 
 		 728 aa  42.4  0.002  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0365  OsmC family protein  35.71 
 
 		 148 aa  42.7  0.002  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  hitchhiker  0.000167168  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0380  OsmC family protein  35.71 
 
 		 148 aa  42.7  0.002  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  decreased coverage  0.00128775  normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2796  OsmC/Ohr family protein  29.81 
 
 		 149 aa  42.4  0.002  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.122145  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0351  OsmC family protein  22.81 
 
 		 134 aa  42  0.003  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.999657  normal  0.881663 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0380  OsmC-like protein  28.32 
 
 		 154 aa  41.2  0.004  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.0303481  normal  0.204016 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1001  OsmC family protein  24.47 
 
 		 135 aa  41.2  0.004  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2505  OsmC family protein  28.12 
 
 		 147 aa  41.6  0.004  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>