247 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Swit_0979 on replicon NC_009511
Organism: Sphingomonas wittichii RW1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009511  Swit_0979  OsmC family protein  100 
 
 
418 aa  820    Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5429  OsmC family protein  61.81 
 
 
397 aa  484  1e-135  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6443  OsmC family protein  57.79 
 
 
408 aa  389  1e-107  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.588479  normal 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_6150  OsmC family protein  57.79 
 
 
408 aa  390  1e-107  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.773624  normal 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0941  OsmC family protein  53.85 
 
 
409 aa  380  1e-104  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.3755  normal  0.451532 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5571  OsmC family protein  49.01 
 
 
408 aa  377  1e-103  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal  0.0439292 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1835  OsmC-like protein  49.26 
 
 
407 aa  357  1.9999999999999998e-97  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3633  OsmC-like protein  49.38 
 
 
406 aa  350  2e-95  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal  0.525721 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1930  OsmC family protein  50.74 
 
 
407 aa  349  4e-95  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.0101124  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2873  hypothetical protein  48.01 
 
 
405 aa  348  7e-95  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.326467  normal  0.0265941 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2280  OsmC-like protein  48.51 
 
 
406 aa  348  9e-95  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal  0.423404 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1777  OsmC-like protein  47.76 
 
 
410 aa  348  1e-94  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.0113862  normal 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2694  OsmC-like protein  48.01 
 
 
406 aa  345  8.999999999999999e-94  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0049  OsmC family protein  49.87 
 
 
406 aa  344  1e-93  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1840  hypothetical protein  50.86 
 
 
405 aa  342  9e-93  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal  0.949047 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1013  OsmC-like protein  50.12 
 
 
423 aa  341  2e-92  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.325781  normal 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1673  OsmC-like protein  48.89 
 
 
409 aa  340  2.9999999999999998e-92  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7018  OsmC family protein  47.36 
 
 
412 aa  336  5e-91  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00716876 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_4048  OsmC family protein  45.32 
 
 
415 aa  336  5e-91  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  unclonable  0.0000134708  normal 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1206  OsmC family protein  46.25 
 
 
413 aa  334  2e-90  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.423514  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4103  OsmC family protein  43.32 
 
 
402 aa  322  9.999999999999999e-87  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.671514  normal 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_12698  hypothetical protein  39.85 
 
 
405 aa  315  9.999999999999999e-85  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3762  OsmC family protein  44.12 
 
 
410 aa  313  3.9999999999999997e-84  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3655  OsmC family protein  43.73 
 
 
410 aa  311  2e-83  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6635  OsmC family protein  42.82 
 
 
411 aa  254  3e-66  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.659004  hitchhiker  0.00000360166 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3394  hypothetical protein  47.74 
 
 
251 aa  247  2e-64  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.689408  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1127  putative redox protein  50.4 
 
 
256 aa  235  9e-61  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp0226  hypothetical protein  48.74 
 
 
257 aa  225  9e-58  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0403  OsmC family protein  53.75 
 
 
259 aa  225  9e-58  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl0227  hypothetical protein  46.99 
 
 
257 aa  224  3e-57  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1911  hydrolase of the alpha/beta superfamily protein  49.21 
 
 
259 aa  223  4e-57  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.0630248  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3247  putative redox protein  48.59 
 
 
250 aa  222  9.999999999999999e-57  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.184697  normal 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1200  putative redox protein  50.4 
 
 
256 aa  221  1.9999999999999999e-56  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000020196 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2961  OsmC-like family protein  49 
 
 
250 aa  218  2e-55  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.0745233  normal  0.293641 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_3055  OsmC-like family protein  47.62 
 
 
255 aa  209  6e-53  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2450  hypothetical protein  44.57 
 
 
258 aa  200  3e-50  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0234  alpha/beta hydrolase fold protein  44.58 
 
 
256 aa  183  4.0000000000000006e-45  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  normal  0.104073 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2376  putative redox protein  35.6 
 
 
259 aa  161  2e-38  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1067  hypothetical protein  48.28 
 
 
145 aa  132  7.999999999999999e-30  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.0889291  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0732  OsmC family protein  48.44 
 
 
137 aa  122  9e-27  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.560509  normal 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2717  OsmC-like protein  45.74 
 
 
135 aa  120  6e-26  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00712413 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4769  OsmC family protein  40.43 
 
 
153 aa  104  3e-21  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  hitchhiker  0.00807264  hitchhiker  0.00049584 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3145  redox protein regulator of disulfide bond formation, OsmC-like  41.73 
 
 
132 aa  102  9e-21  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.102127 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1082  OsmC-like family protein  39.34 
 
 
141 aa  100  4e-20  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.0521945  normal  0.207247 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1403  OsmC family protein  39.37 
 
 
132 aa  98.6  2e-19  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0655694  normal  0.111545 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1438  OsmC family protein  42.5 
 
 
137 aa  96.7  6e-19  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal  0.139134 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1917  OsmC family protein  38.58 
 
 
130 aa  96.3  8e-19  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.591016  normal  0.655521 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1440  OsmC family protein  41.53 
 
 
142 aa  96.3  8e-19  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_48750  hypothetical protein  38.76 
 
 
135 aa  94.4  4e-18  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000274485 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1950  OsmC family protein  38.28 
 
 
132 aa  94  5e-18  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.378128  normal 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1301  OsmC family protein  37.01 
 
 
130 aa  92.8  1e-17  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal  0.0499071 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4175  hypothetical protein  36.43 
 
 
135 aa  92.4  1e-17  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.214068  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3491  OsmC family protein  40.18 
 
 
131 aa  91.7  2e-17  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1368  OsmC family protein  37.8 
 
 
130 aa  91.7  2e-17  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.0210899 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0908  OsmC-like protein  37.8 
 
 
130 aa  91.7  2e-17  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1267  OsmC family protein  37.8 
 
 
130 aa  92  2e-17  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1390  OsmC family protein  37.8 
 
 
130 aa  91.7  2e-17  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.51882  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1856  OsmC family protein  37.01 
 
 
129 aa  90.9  4e-17  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.610023  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4533  OsmC-like protein  37.01 
 
 
130 aa  90.9  4e-17  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.257374 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0921  OsmC family protein  38.05 
 
 
136 aa  89.4  1e-16  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.418667  normal 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0982  OsmC family protein  42.62 
 
 
127 aa  88.2  3e-16  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1923  OsmC-like protein  40.34 
 
 
127 aa  86.7  8e-16  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0974  OsmC family protein  37.21 
 
 
128 aa  83.6  0.000000000000006  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.637714  normal  0.331477 
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0240  hypothetical protein  40.16 
 
 
133 aa  82.4  0.00000000000001  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2518  hypothetical protein  40.16 
 
 
133 aa  82.4  0.00000000000001  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.0608844  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2193  OsmC family protein  40.68 
 
 
129 aa  82.4  0.00000000000001  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.208378  normal 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2657  putative hydrolase  40.16 
 
 
133 aa  82.4  0.00000000000001  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_1423  hypothetical protein  40.16 
 
 
133 aa  82.4  0.00000000000001  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0949  hydrolase  40.16 
 
 
133 aa  82  0.00000000000002  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1919  OsmC family protein  40.54 
 
 
131 aa  81.3  0.00000000000003  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.148561  normal 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4564  OsmC-like protein  38.84 
 
 
133 aa  80.9  0.00000000000004  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3799  OsmC family protein  38.84 
 
 
133 aa  80.9  0.00000000000004  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.732158  normal  0.104892 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3725  OsmC family protein  38.84 
 
 
133 aa  80.9  0.00000000000004  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.196532 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_3616  osmotically inducible protein  38.32 
 
 
129 aa  80.1  0.00000000000006  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000818818  normal 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0518  OsmC-like protein superfamily protein  39.34 
 
 
153 aa  79.7  0.00000000000008  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2658  OsmC family protein  34.96 
 
 
133 aa  79.7  0.00000000000009  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.653298  normal  0.498397 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1578  dienelactone hydrolase  27.24 
 
 
255 aa  79.7  0.00000000000009  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2297  OsmC-like protein  38.52 
 
 
133 aa  78.2  0.0000000000003  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.922047  normal  0.948773 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4937  OsmC family protein  38.66 
 
 
133 aa  77.4  0.0000000000004  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal  0.659641 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5556  OsmC-like protein  34.51 
 
 
130 aa  77.4  0.0000000000004  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  hitchhiker  0.0000078778  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1619  hypothetical protein  39.34 
 
 
129 aa  77  0.0000000000005  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0819  hypothetical protein  32.44 
 
 
253 aa  77.4  0.0000000000005  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0276  hypothetical protein  39.34 
 
 
129 aa  77  0.0000000000005  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_5525  OsmC family protein  37.82 
 
 
133 aa  76.6  0.0000000000007  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3689  OsmC family protein  37.5 
 
 
133 aa  76.6  0.0000000000008  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal  0.952273 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2484  OsmC family protein  32.26 
 
 
133 aa  75.9  0.000000000001  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal  0.092178 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2142  OsmC family protein  38.94 
 
 
129 aa  75.1  0.000000000002  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1279  dipeptidyl aminopeptidase/acylaminoacyl-peptidase-like protein  28.64 
 
 
261 aa  71.2  0.00000000003  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.000359236  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0929  putative hydrolase  27.81 
 
 
252 aa  68.9  0.0000000002  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.119531  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1832  OsmC-like protein  41.84 
 
 
133 aa  67.8  0.0000000004  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1628  OsmC-like protein  28.93 
 
 
138 aa  67  0.0000000006  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal  0.0181271 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0457  Lysophospholipase-like protein  27.83 
 
 
274 aa  63.9  0.000000005  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_1560  OsmC family protein  47.54 
 
 
88 aa  62.8  0.00000001  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2348  OsmC family protein  32.88 
 
 
163 aa  63.2  0.00000001  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.684792  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1762  alpha/beta fold family hydrolase  32.5 
 
 
260 aa  61.6  0.00000002  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  hitchhiker  0.00000326151  normal  0.089199 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1595  OsmC family protein  31.96 
 
 
134 aa  61.6  0.00000003  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1483  hypothetical protein  28.35 
 
 
237 aa  61.6  0.00000003  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc0376  hypothetical protein  32.67 
 
 
134 aa  60.5  0.00000005  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2279  OsmC family protein  31.96 
 
 
155 aa  60.1  0.00000007  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.0377998  normal  0.182149 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0601  dienelactone hydrolase  24.48 
 
 
259 aa  59.7  0.00000008  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>