109 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Francci3_4465 on replicon NC_007777
Organism: Frankia sp. CcI3



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007777  Francci3_4465  OsmC-like protein  100 
 
 		 248 aa  492  9.999999999999999e-139  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4617  OsmC family protein  60.47 
 
 		 133 aa  160  2e-38  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  0.327663 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1613  OsmC family protein  60.47 
 
 		 133 aa  159  3e-38  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2348  OsmC family protein  50.68 
 
 		 163 aa  137  1e-31  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.684792  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0361  OsmC family protein  53.12 
 
 		 140 aa  132  3.9999999999999996e-30  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2557  OsmC family protein  54.47 
 
 		 138 aa  130  2.0000000000000002e-29  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.00000559572  hitchhiker  0.00383779 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0395  OsmC family protein  50.39 
 
 		 138 aa  124  1e-27  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0541  OsmC family protein  47.69 
 
 		 151 aa  120  3e-26  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.489752  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3081  OsmC-like protein  35.16 
 
 		 134 aa  87.8  2e-16  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.344842  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0382  hypothetical protein  32 
 
 		 134 aa  77  0.0000000000003  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1919  OsmC family protein  39.81 
 
 		 131 aa  71.2  0.00000000001  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.148561  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1605  OsmC family protein  34.65 
 
 		 161 aa  69.7  0.00000000005  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_4072  hypothetical protein  33.06 
 
 		 134 aa  67.4  0.0000000002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.0853904  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0335  OsmC family protein  30.09 
 
 		 127 aa  67.8  0.0000000002  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  0.252391  normal  1 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_4196  OsmC family protein  33.06 
 
 		 135 aa  67.8  0.0000000002  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_4221  OsmC family protein  33.06 
 
 		 135 aa  67.8  0.0000000002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.741744  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0351  OsmC family protein  33.33 
 
 		 134 aa  63.9  0.000000003  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.999657  normal  0.881663 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3476  OsmC family protein  28.46 
 
 		 135 aa  62.8  0.000000005  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  0.00107457  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1489  OsmC family protein  26.83 
 
 		 181 aa  62  0.000000009  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.172419  normal  1 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_3179  OsmC family protein  32.41 
 
 		 159 aa  60.5  0.00000002  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0034  hypothetical protein  25.78 
 
 		 735 aa  59.7  0.00000004  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1146  hypothetical protein  26.56 
 
 		 732 aa  60.1  0.00000004  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.202327  normal  0.214349 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0845  OsmC family protein  29.01 
 
 		 132 aa  59.3  0.00000006  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  1  normal  0.0344874 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_28020  hypothetical protein  28.7 
 
 		 734 aa  58.9  0.00000007  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.458293  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1082  OsmC-like family protein  25.6 
 
 		 141 aa  58.5  0.00000009  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.0521945  normal  0.207247 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1756  hypothetical protein  22.83 
 
 		 728 aa  57  0.0000002  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1341  OsmC family protein  25.66 
 
 		 133 aa  57.4  0.0000002  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2710  hypothetical protein  25 
 
 		 731 aa  57  0.0000003  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.579153 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0887  hypothetical protein  24.22 
 
 		 132 aa  57  0.0000003  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.873349  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1001  OsmC family protein  27.27 
 
 		 135 aa  56.6  0.0000003  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3569  hypothetical protein  25 
 
 		 727 aa  56.6  0.0000003  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2174  hypothetical protein  24.62 
 
 		 728 aa  57  0.0000003  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3343  hypothetical protein  24.22 
 
 		 728 aa  56.2  0.0000004  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  0.987058 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1130  hypothetical protein  25 
 
 		 135 aa  56.2  0.0000005  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  0.362808 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_2073  hypothetical protein  26.36 
 
 		 734 aa  55.8  0.0000006  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0976  OsmC family protein  32.08 
 
 		 118 aa  55.5  0.0000007  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3033  hypothetical protein  26.67 
 
 		 728 aa  55.5  0.0000008  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.431186  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2297  hypothetical protein  23.85 
 
 		 728 aa  55.5  0.0000008  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.806493 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1251  OsmC family protein  25.45 
 
 		 134 aa  55.1  0.0000009  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.106129  normal  0.568503 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4822  hypothetical protein  26.85 
 
 		 734 aa  54.7  0.000001  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  decreased coverage  0.000227003  normal  0.373155 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0643  hypothetical protein  26.67 
 
 		 729 aa  54.7  0.000001  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_3620  hypothetical protein  23.08 
 
 		 728 aa  53.9  0.000002  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3199  hypothetical protein  26.67 
 
 		 728 aa  54.3  0.000002  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2113  hypothetical protein  23.08 
 
 		 728 aa  53.9  0.000002  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.20686  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3664  hypothetical protein  26.67 
 
 		 729 aa  54.3  0.000002  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3787  hypothetical protein  26.67 
 
 		 729 aa  54.3  0.000002  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.859391  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2832  hypothetical protein  24.22 
 
 		 728 aa  53.9  0.000002  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.134905  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3928  hypothetical protein  26.67 
 
 		 728 aa  54.3  0.000002  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_4047  OsmC family protein  33.05 
 
 		 137 aa  53.9  0.000002  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.325881  normal  0.623088 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1429  OsmC family protein  24.37 
 
 		 135 aa  54.3  0.000002  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.640592  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3599  protein of unknown function DUF181  26.67 
 
 		 729 aa  54.7  0.000002  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3491  OsmC family protein  24.3 
 
 		 131 aa  53.5  0.000003  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3592  protein of unknown function DUF181  26.85 
 
 		 734 aa  53.5  0.000003  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.0680194  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3321  hypothetical protein  26.67 
 
 		 742 aa  53.1  0.000004  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0632  hypothetical protein  26.67 
 
 		 742 aa  53.1  0.000004  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3489  hypothetical protein  26.67 
 
 		 742 aa  53.1  0.000004  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3211  hypothetical protein  26.67 
 
 		 728 aa  53.1  0.000004  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.357431  normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1950  OsmC family protein  28.3 
 
 		 132 aa  52.4  0.000006  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.378128  normal  1 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0824  hypothetical protein  23.81 
 
 		 728 aa  52.4  0.000007  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.0307116  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3253  hypothetical protein  25.71 
 
 		 728 aa  52.4  0.000007  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3214  hypothetical protein  25.93 
 
 		 734 aa  52  0.000009  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.668386  normal  0.254813 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_00995  hypothetical protein  30.51 
 
 		 133 aa  52  0.000009  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0738  hypothetical protein  24.76 
 
 		 728 aa  52  0.00001  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_10251  redox protein, regulator of disulfide bond formation  31.07 
 
 		 135 aa  51.2  0.00002  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3965  OsmC family protein  28.95 
 
 		 132 aa  50.4  0.00002  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0908  OsmC-like protein  29.73 
 
 		 130 aa  50.1  0.00003  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2354  OsmC-like protein  31.62 
 
 		 170 aa  50.1  0.00003  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.572746  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1390  OsmC family protein  29.73 
 
 		 130 aa  50.1  0.00003  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.51882  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1368  OsmC family protein  29.73 
 
 		 130 aa  50.4  0.00003  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.0210899 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0647  OsmC family protein  32.71 
 
 		 137 aa  49.7  0.00004  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0342  OsmC family protein  31.58 
 
 		 135 aa  48.1  0.0001  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  0.720795  normal  0.012657 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3762  OsmC family protein  30.97 
 
 		 410 aa  47.8  0.0002  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0235  OsmC family protein  25.22 
 
 		 147 aa  46.6  0.0003  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2505  OsmC family protein  27.5 
 
 		 147 aa  47  0.0003  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1267  OsmC family protein  28.83 
 
 		 130 aa  46.6  0.0004  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1595  OsmC family protein  30.28 
 
 		 134 aa  46.6  0.0004  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2717  OsmC-like protein  28.7 
 
 		 135 aa  46.2  0.0006  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00712413 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4769  OsmC family protein  26.53 
 
 		 153 aa  45.8  0.0006  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  hitchhiker  0.00807264  hitchhiker  0.00049584 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3187  hypothetical protein  27.59 
 
 		 136 aa  45.8  0.0006  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2484  OsmC family protein  28.18 
 
 		 133 aa  45.8  0.0006  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  0.092178 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_48750  hypothetical protein  25.71 
 
 		 135 aa  45.4  0.0008  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000274485 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4175  hypothetical protein  25.74 
 
 		 135 aa  45.4  0.0008  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.214068  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4103  OsmC family protein  22.76 
 
 		 402 aa  45.4  0.0008  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.671514  normal  1 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1301  OsmC family protein  30.09 
 
 		 130 aa  45.4  0.0008  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.0499071 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2279  OsmC family protein  30.28 
 
 		 155 aa  45.4  0.0009  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.0377998  normal  0.182149 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2898  OsmC-like protein  26.13 
 
 		 135 aa  44.7  0.001  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.533642 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3145  redox protein regulator of disulfide bond formation, OsmC-like  28 
 
 		 132 aa  45.4  0.001  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.102127 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1904  OsmC family protein  41.18 
 
 		 193 aa  44.7  0.001  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.576095  unclonable  0.00000937306 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3655  OsmC family protein  29.2 
 
 		 410 aa  45.1  0.001  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1438  OsmC family protein  26.92 
 
 		 137 aa  45.1  0.001  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.139134 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0515  OsmC family protein  29.63 
 
 		 134 aa  45.1  0.001  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.0859672  normal  0.078618 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4533  OsmC-like protein  27.93 
 
 		 130 aa  44.3  0.002  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.257374 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1892  OsmC-like protein  28.69 
 
 		 148 aa  43.9  0.002  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3007  OsmC family protein  25 
 
 		 146 aa  43.9  0.002  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0921  OsmC family protein  27.45 
 
 		 136 aa  44.3  0.002  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.418667  normal  1 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1917  OsmC family protein  28.83 
 
 		 130 aa  44.3  0.002  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.591016  normal  0.655521 
 
 
-
 
NC_002967  TDE1270  hypothetical protein  25.66 
 
 		 144 aa  43.9  0.003  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  hitchhiker  0.00225413  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1628  OsmC-like protein  25.21 
 
 		 138 aa  43.9  0.003  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0181271 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2519  hypothetical protein  29.35 
 
 		 149 aa  43.5  0.003  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.425061  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1440  OsmC family protein  25.23 
 
 		 142 aa  43.5  0.003  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>