290 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Smed_5571 on replicon NC_009621
Organism: Sinorhizobium medicae WSM419



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009621  Smed_5571  OsmC family protein  100 
 
 		 408 aa  826    Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.0439292 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0049  OsmC family protein  60.78 
 
 		 406 aa  476  1e-133  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1835  OsmC-like protein  58.17 
 
 		 407 aa  446  1.0000000000000001e-124  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0941  OsmC family protein  55.85 
 
 		 409 aa  437  1e-121  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.3755  normal  0.451532 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3633  OsmC-like protein  56.58 
 
 		 406 aa  429  1e-119  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.525721 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2873  hypothetical protein  56.65 
 
 		 405 aa  424  1e-117  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.326467  normal  0.0265941 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2280  OsmC-like protein  55.67 
 
 		 406 aa  424  1e-117  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  0.423404 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1673  OsmC-like protein  55.06 
 
 		 409 aa  422  1e-117  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1930  OsmC family protein  57.49 
 
 		 407 aa  424  1e-117  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.0101124  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2694  OsmC-like protein  53.92 
 
 		 406 aa  417  9.999999999999999e-116  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7018  OsmC family protein  53.58 
 
 		 412 aa  415  9.999999999999999e-116  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00716876 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_4048  OsmC family protein  50.12 
 
 		 415 aa  407  1.0000000000000001e-112  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  unclonable  0.0000134708  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1206  OsmC family protein  50.12 
 
 		 413 aa  397  1e-109  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.423514  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1777  OsmC-like protein  52.46 
 
 		 410 aa  393  1e-108  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.0113862  normal  1 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1013  OsmC-like protein  53.69 
 
 		 423 aa  394  1e-108  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.325781  normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1840  hypothetical protein  53.69 
 
 		 405 aa  389  1e-107  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  0.949047 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4103  OsmC family protein  48.52 
 
 		 402 aa  391  1e-107  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.671514  normal  1 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_12698  hypothetical protein  44.83 
 
 		 405 aa  372  1e-102  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5429  OsmC family protein  49.01 
 
 		 397 aa  352  5.9999999999999994e-96  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3655  OsmC family protein  47.09 
 
 		 410 aa  351  1e-95  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3762  OsmC family protein  47.33 
 
 		 410 aa  348  9e-95  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0979  OsmC family protein  49.01 
 
 		 418 aa  345  1e-93  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6443  OsmC family protein  48.89 
 
 		 408 aa  333  4e-90  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.588479  normal  1 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_6150  OsmC family protein  48.65 
 
 		 408 aa  331  1e-89  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.773624  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6635  OsmC family protein  41.77 
 
 		 411 aa  283  5.000000000000001e-75  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.659004  hitchhiker  0.00000360166 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3394  hypothetical protein  53.81 
 
 		 251 aa  269  5.9999999999999995e-71  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.689408  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp0226  hypothetical protein  55.69 
 
 		 257 aa  267  2e-70  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl0227  hypothetical protein  55.69 
 
 		 257 aa  265  1e-69  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0403  OsmC family protein  56.97 
 
 		 259 aa  249  9e-65  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1127  putative redox protein  46.43 
 
 		 256 aa  237  2e-61  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2450  hypothetical protein  49.61 
 
 		 258 aa  234  2.0000000000000002e-60  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1200  putative redox protein  46.12 
 
 		 256 aa  223  3e-57  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000020196 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3247  putative redox protein  46.77 
 
 		 250 aa  221  1.9999999999999999e-56  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.184697  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1911  hydrolase of the alpha/beta superfamily protein  45.74 
 
 		 259 aa  220  3.9999999999999997e-56  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.0630248  normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_3055  OsmC-like family protein  47.22 
 
 		 255 aa  218  2e-55  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2961  OsmC-like family protein  45.97 
 
 		 250 aa  211  2e-53  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.0745233  normal  0.293641 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2376  putative redox protein  40.8 
 
 		 259 aa  207  4e-52  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0234  alpha/beta hydrolase fold protein  40.78 
 
 		 256 aa  180  4e-44  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  0.104073 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1067  hypothetical protein  55.94 
 
 		 145 aa  167  2e-40  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.0889291  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2717  OsmC-like protein  49.62 
 
 		 135 aa  126  9e-28  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00712413 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4769  OsmC family protein  43.88 
 
 		 153 aa  123  5e-27  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  hitchhiker  0.00807264  hitchhiker  0.00049584 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1403  OsmC family protein  37.59 
 
 		 132 aa  90.9  4e-17  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0655694  normal  0.111545 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0732  OsmC family protein  37.78 
 
 		 137 aa  89.7  8e-17  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.560509  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3145  redox protein regulator of disulfide bond formation, OsmC-like  37.59 
 
 		 132 aa  89  1e-16  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.102127 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1919  OsmC family protein  36.29 
 
 		 131 aa  87.4  5e-16  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.148561  normal  1 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1856  OsmC family protein  36.09 
 
 		 129 aa  87  5e-16  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.610023  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0819  hypothetical protein  29.54 
 
 		 253 aa  86.7  6e-16  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2142  OsmC family protein  38.93 
 
 		 129 aa  84.7  0.000000000000002  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1950  OsmC family protein  36.09 
 
 		 132 aa  84  0.000000000000004  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.378128  normal  1 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1440  OsmC family protein  38.02 
 
 		 142 aa  84  0.000000000000005  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1368  OsmC family protein  33.78 
 
 		 130 aa  82.4  0.00000000000001  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.0210899 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1390  OsmC family protein  33.78 
 
 		 130 aa  82.4  0.00000000000001  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.51882  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1917  OsmC family protein  37.9 
 
 		 130 aa  82.8  0.00000000000001  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.591016  normal  0.655521 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0908  OsmC-like protein  33.78 
 
 		 130 aa  82.4  0.00000000000001  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1301  OsmC family protein  36.29 
 
 		 130 aa  81.6  0.00000000000002  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.0499071 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1267  OsmC family protein  36.29 
 
 		 130 aa  81.6  0.00000000000002  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0601  dienelactone hydrolase  30.05 
 
 		 259 aa  80.9  0.00000000000004  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4175  hypothetical protein  31.62 
 
 		 135 aa  80.1  0.00000000000006  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.214068  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3491  OsmC family protein  31.2 
 
 		 131 aa  79.7  0.00000000000008  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2658  OsmC family protein  34.31 
 
 		 133 aa  79  0.0000000000001  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.653298  normal  0.498397 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0921  OsmC family protein  35.48 
 
 		 136 aa  79  0.0000000000001  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.418667  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0982  OsmC family protein  36.23 
 
 		 127 aa  78.6  0.0000000000002  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4533  OsmC-like protein  36.29 
 
 		 130 aa  78.6  0.0000000000002  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.257374 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1923  OsmC-like protein  33.85 
 
 		 127 aa  77.4  0.0000000000004  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0974  OsmC family protein  32.33 
 
 		 128 aa  77.4  0.0000000000004  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.637714  normal  0.331477 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4937  OsmC family protein  35.16 
 
 		 133 aa  77  0.0000000000006  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.659641 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0929  putative hydrolase  29.64 
 
 		 252 aa  77  0.0000000000006  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.119531  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1082  OsmC-like family protein  33.33 
 
 		 141 aa  76.6  0.0000000000007  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.0521945  normal  0.207247 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3799  OsmC family protein  34.38 
 
 		 133 aa  76.3  0.0000000000009  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.732158  normal  0.104892 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3725  OsmC family protein  34.38 
 
 		 133 aa  76.3  0.0000000000009  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.196532 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4564  OsmC-like protein  34.38 
 
 		 133 aa  76.3  0.0000000000009  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_48750  hypothetical protein  32.52 
 
 		 135 aa  76.3  0.000000000001  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000274485 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2297  OsmC-like protein  34.38 
 
 		 133 aa  75.1  0.000000000002  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.922047  normal  0.948773 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1628  OsmC-like protein  31.4 
 
 		 138 aa  74.3  0.000000000004  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0181271 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1438  OsmC family protein  30.53 
 
 		 137 aa  72  0.00000000002  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.139134 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1279  dipeptidyl aminopeptidase/acylaminoacyl-peptidase-like protein  26.61 
 
 		 261 aa  70.5  0.00000000006  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.000359236  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0518  OsmC-like protein superfamily protein  33.59 
 
 		 153 aa  69.3  0.0000000001  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1483  hypothetical protein  26.67 
 
 		 237 aa  68.9  0.0000000001  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1578  dienelactone hydrolase  26.38 
 
 		 255 aa  68.2  0.0000000002  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2518  hypothetical protein  33.59 
 
 		 133 aa  67.4  0.0000000004  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.0608844  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2657  putative hydrolase  33.59 
 
 		 133 aa  67.4  0.0000000004  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0240  hypothetical protein  33.59 
 
 		 133 aa  67.4  0.0000000004  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0949  hydrolase  33.59 
 
 		 133 aa  67.4  0.0000000004  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_1423  hypothetical protein  33.59 
 
 		 133 aa  67.4  0.0000000004  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE1727  hypothetical protein  34.11 
 
 		 138 aa  67  0.0000000006  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2484  OsmC family protein  30.08 
 
 		 133 aa  65.9  0.000000001  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  0.092178 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0085  hypothetical protein  28.3 
 
 		 284 aa  65.9  0.000000001  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.720281  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3965  OsmC family protein  29.29 
 
 		 132 aa  65.1  0.000000002  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1762  alpha/beta fold family hydrolase  25.2 
 
 		 260 aa  64.7  0.000000003  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  hitchhiker  0.00000326151  normal  0.089199 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3689  OsmC family protein  31.25 
 
 		 133 aa  64.7  0.000000003  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.952273 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_5525  OsmC family protein  31.5 
 
 		 133 aa  64.7  0.000000003  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0457  Lysophospholipase-like protein  24.22 
 
 		 274 aa  63.9  0.000000004  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5556  OsmC-like protein  33.87 
 
 		 130 aa  63.9  0.000000005  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  hitchhiker  0.0000078778  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2193  OsmC family protein  31.54 
 
 		 129 aa  63.9  0.000000005  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.208378  normal  1 
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_1560  OsmC family protein  43.66 
 
 		 88 aa  63.5  0.000000007  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1619  hypothetical protein  33.59 
 
 		 129 aa  63.2  0.000000008  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_3616  osmotically inducible protein  32.38 
 
 		 129 aa  63.2  0.000000008  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000818818  normal  1 
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0276  hypothetical protein  33.59 
 
 		 129 aa  63.2  0.000000008  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0232  OsmC family protein  29.85 
 
 		 134 aa  62.8  0.00000001  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0251  OsmC family protein  29.1 
 
 		 134 aa  62.4  0.00000001  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.798103  normal  0.164531 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>