100 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Strop_1613 on replicon NC_009380
Organism: Salinispora tropica CNB-440



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009380  Strop_1613  OsmC family protein  100 
 
 
133 aa  268  2e-71  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4617  OsmC family protein  93.98 
 
 
133 aa  254  2e-67  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  normal  0.327663 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_4465  OsmC-like protein  60.47 
 
 
248 aa  159  1e-38  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2557  OsmC family protein  52.38 
 
 
138 aa  133  8e-31  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.00000559572  hitchhiker  0.00383779 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2348  OsmC family protein  55.2 
 
 
163 aa  131  3e-30  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.684792  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0361  OsmC family protein  50.78 
 
 
140 aa  131  3.9999999999999996e-30  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0541  OsmC family protein  48.82 
 
 
151 aa  122  2e-27  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.489752  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0395  OsmC family protein  44.96 
 
 
138 aa  117  4.9999999999999996e-26  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3081  OsmC-like protein  34.88 
 
 
134 aa  90.5  7e-18  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.344842  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1919  OsmC family protein  38.18 
 
 
131 aa  74.3  0.0000000000005  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.148561  normal 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1605  OsmC family protein  36.67 
 
 
161 aa  72.8  0.000000000001  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2505  OsmC family protein  29.75 
 
 
147 aa  62.4  0.000000002  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1341  OsmC family protein  30.83 
 
 
133 aa  62.4  0.000000002  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0382  hypothetical protein  28.33 
 
 
134 aa  62  0.000000003  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_3179  OsmC family protein  32.71 
 
 
159 aa  61.6  0.000000003  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3476  OsmC family protein  27.93 
 
 
135 aa  60.1  0.00000001  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  0.00107457  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0845  OsmC family protein  27.72 
 
 
132 aa  60.1  0.00000001  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  normal  0.0344874 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1082  OsmC-like family protein  28 
 
 
141 aa  58.2  0.00000004  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.0521945  normal  0.207247 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0335  OsmC family protein  30.97 
 
 
127 aa  57.4  0.00000006  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  0.252391  normal 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2142  OsmC family protein  45.16 
 
 
129 aa  56.6  0.0000001  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0351  OsmC family protein  28.95 
 
 
134 aa  55.5  0.0000003  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.999657  normal  0.881663 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_4072  hypothetical protein  31.9 
 
 
134 aa  54.7  0.0000004  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.0853904  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_4221  OsmC family protein  30.83 
 
 
135 aa  54.3  0.0000006  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.741744  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_4196  OsmC family protein  33.96 
 
 
135 aa  54.3  0.0000006  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0235  OsmC family protein  24.03 
 
 
147 aa  53.9  0.0000007  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2354  OsmC-like protein  38.81 
 
 
170 aa  52.8  0.000001  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.572746  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3491  OsmC family protein  26.19 
 
 
131 aa  53.5  0.000001  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_4047  OsmC family protein  30.69 
 
 
137 aa  53.1  0.000001  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.325881  normal  0.623088 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1440  OsmC family protein  29.91 
 
 
142 aa  52.8  0.000001  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1001  OsmC family protein  31.03 
 
 
135 aa  52.8  0.000002  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1251  OsmC family protein  28.83 
 
 
134 aa  51.6  0.000003  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.106129  normal  0.568503 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1489  OsmC family protein  27.93 
 
 
181 aa  52  0.000003  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.172419  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1438  OsmC family protein  31.71 
 
 
137 aa  51.2  0.000005  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal  0.139134 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1950  OsmC family protein  30.19 
 
 
132 aa  50.8  0.000006  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.378128  normal 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0887  hypothetical protein  28.83 
 
 
132 aa  50.8  0.000006  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.873349  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_4048  OsmC family protein  29.17 
 
 
415 aa  50.8  0.000006  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  unclonable  0.0000134708  normal 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1904  OsmC family protein  44 
 
 
193 aa  50.8  0.000006  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.576095  unclonable  0.00000937306 
 
 
-
 
NC_009976  P9211_15061  redox protein, regulator of disulfide bond formation  23.85 
 
 
320 aa  50.1  0.00001  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  0.0738856  normal  0.127716 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1835  OsmC-like protein  35.07 
 
 
407 aa  49.7  0.00001  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_04790  OsmC family protein  27.42 
 
 
144 aa  49.7  0.00001  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0342  OsmC family protein  30.7 
 
 
135 aa  49.3  0.00002  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  0.720795  normal  0.012657 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1698  OsmC family protein  32.35 
 
 
136 aa  49.3  0.00002  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1917  OsmC family protein  28.23 
 
 
130 aa  48.5  0.00003  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.591016  normal  0.655521 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_10251  redox protein, regulator of disulfide bond formation  28.71 
 
 
135 aa  48.1  0.00004  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4533  OsmC-like protein  28.8 
 
 
130 aa  47.8  0.00005  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.257374 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2280  OsmC-like protein  32.52 
 
 
406 aa  47.8  0.00005  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal  0.423404 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1628  OsmC-like protein  28.57 
 
 
138 aa  47.4  0.00006  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal  0.0181271 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2873  hypothetical protein  50 
 
 
405 aa  47.4  0.00006  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.326467  normal  0.0265941 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1267  OsmC family protein  28.23 
 
 
130 aa  47.4  0.00007  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1301  OsmC family protein  28.23 
 
 
130 aa  46.6  0.0001  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal  0.0499071 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_12698  hypothetical protein  24.63 
 
 
405 aa  46.6  0.0001  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0908  OsmC-like protein  29.81 
 
 
130 aa  45.8  0.0002  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1390  OsmC family protein  29.81 
 
 
130 aa  45.8  0.0002  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.51882  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_11241  putative stress-induced protein OsmC  23.26 
 
 
135 aa  45.8  0.0002  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  0.160014  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1368  OsmC family protein  29.81 
 
 
130 aa  45.8  0.0002  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.0210899 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1429  OsmC family protein  26.61 
 
 
135 aa  45.4  0.0003  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.640592  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0976  OsmC family protein  31.46 
 
 
118 aa  45.1  0.0003  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3007  OsmC family protein  29.37 
 
 
146 aa  44.7  0.0004  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3145  redox protein regulator of disulfide bond formation, OsmC-like  27 
 
 
132 aa  44.7  0.0004  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.102127 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0979  OsmC family protein  28.81 
 
 
418 aa  44.7  0.0004  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1892  OsmC-like protein  41.86 
 
 
148 aa  44.7  0.0004  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1206  OsmC family protein  42 
 
 
413 aa  44.7  0.0005  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.423514  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3413  OsmC family protein  32.79 
 
 
171 aa  44.3  0.0005  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0982  OsmC family protein  38.78 
 
 
127 aa  44.3  0.0006  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4175  hypothetical protein  26.13 
 
 
135 aa  44.3  0.0006  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.214068  n/a   
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5429  OsmC family protein  29.03 
 
 
397 aa  44.3  0.0006  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1840  hypothetical protein  30.48 
 
 
405 aa  44.3  0.0006  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal  0.949047 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1130  hypothetical protein  24.17 
 
 
135 aa  43.9  0.0007  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  normal  0.362808 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1930  OsmC family protein  31.78 
 
 
407 aa  43.9  0.0007  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.0101124  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0921  OsmC family protein  29.25 
 
 
136 aa  43.9  0.0008  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.418667  normal 
 
 
-
 
NC_009976  P9211_15411  redox protein, regulator of disulfide bond formation  23.76 
 
 
306 aa  43.5  0.0009  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1923  OsmC-like protein  33.33 
 
 
127 aa  43.5  0.0009  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_48750  hypothetical protein  26 
 
 
135 aa  42.7  0.001  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000274485 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1013  OsmC-like protein  27.97 
 
 
423 aa  43.5  0.001  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.325781  normal 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1595  OsmC family protein  24.06 
 
 
134 aa  43.1  0.001  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3762  OsmC family protein  26.32 
 
 
410 aa  43.1  0.001  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3633  OsmC-like protein  32.8 
 
 
406 aa  43.5  0.001  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal  0.525721 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2279  OsmC family protein  25.74 
 
 
155 aa  43.5  0.001  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.0377998  normal  0.182149 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0647  OsmC family protein  32.41 
 
 
137 aa  43.1  0.001  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2484  OsmC family protein  25.83 
 
 
133 aa  43.5  0.001  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal  0.092178 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3211  hypothetical protein  27.93 
 
 
728 aa  42.4  0.002  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.357431  normal 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2694  OsmC-like protein  30.43 
 
 
406 aa  42.7  0.002  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2717  OsmC-like protein  38.64 
 
 
135 aa  42.4  0.002  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00712413 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5571  OsmC family protein  29.1 
 
 
408 aa  42  0.002  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal  0.0439292 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2898  OsmC-like protein  26.42 
 
 
135 aa  42.7  0.002  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal  0.533642 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0941  OsmC family protein  37.88 
 
 
409 aa  42  0.003  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.3755  normal  0.451532 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0049  OsmC family protein  29.36 
 
 
406 aa  42  0.003  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6443  OsmC family protein  27.61 
 
 
408 aa  41.6  0.004  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.588479  normal 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_6150  OsmC family protein  27.61 
 
 
408 aa  41.6  0.004  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.773624  normal 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1777  OsmC-like protein  32.52 
 
 
410 aa  41.6  0.004  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.0113862  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3526  OsmC family protein  29.37 
 
 
177 aa  41.2  0.005  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.7407  normal  0.298467 
 
 
-
 
NC_008816  A9601_11251  putative stress-induced protein OsmC  22.48 
 
 
139 aa  40.8  0.006  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3965  OsmC family protein  25.83 
 
 
132 aa  40.8  0.007  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2100  OsmC family protein  24.79 
 
 
185 aa  40.8  0.007  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_0946  putative redox protein  25.23 
 
 
131 aa  40.4  0.008  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1403  OsmC family protein  39.53 
 
 
132 aa  40.4  0.008  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0655694  normal  0.111545 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3033  hypothetical protein  27.93 
 
 
728 aa  40.4  0.009  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.431186  normal 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1670  OsmC family protein  24.6 
 
 
156 aa  40  0.009  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.0539264  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3928  hypothetical protein  27.93 
 
 
728 aa  40.4  0.009  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002967  TDE1270  hypothetical protein  37.78 
 
 
144 aa  40  0.01  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  hitchhiker  0.00225413  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>