117 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Shew_3033 on replicon NC_009092
Organism: Shewanella loihica PV-4



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_002947  PP_3620  hypothetical protein  76.17 
 
 		 728 aa  1140    Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1756  hypothetical protein  82.23 
 
 		 728 aa  1239    Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_0795  hypothetical protein  90.1 
 
 		 592 aa  1087    Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3214  hypothetical protein  76.17 
 
 		 734 aa  1113    Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.668386  normal  0.254813 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2710  hypothetical protein  76.33 
 
 		 731 aa  1156    Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.579153 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0824  hypothetical protein  89.56 
 
 		 728 aa  1356    Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.0307116  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0034  hypothetical protein  74.97 
 
 		 735 aa  1115    Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4822  hypothetical protein  74.41 
 
 		 734 aa  1092    Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  decreased coverage  0.000227003  normal  0.373155 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3321  hypothetical protein  91.61 
 
 		 742 aa  1376    Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0632  hypothetical protein  91.33 
 
 		 742 aa  1372    Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0738  hypothetical protein  89.76 
 
 		 728 aa  1355    Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_39610  hypothetical protein  73.66 
 
 		 616 aa  888    Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  0.812583 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3489  hypothetical protein  91.47 
 
 		 742 aa  1375    Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3569  hypothetical protein  83.65 
 
 		 727 aa  1251    Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2174  hypothetical protein  79.53 
 
 		 728 aa  1212    Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0643  hypothetical protein  91.15 
 
 		 729 aa  1366    Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3033  hypothetical protein  100 
 
 		 728 aa  1498    Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.431186  normal  1 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_2073  hypothetical protein  72.45 
 
 		 734 aa  1095    Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3199  hypothetical protein  91.86 
 
 		 728 aa  1380    Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1146  hypothetical protein  75.8 
 
 		 732 aa  1144    Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.202327  normal  0.214349 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2113  hypothetical protein  76.03 
 
 		 728 aa  1139    Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.20686  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3343  hypothetical protein  89.82 
 
 		 728 aa  1353    Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  0.987058 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3664  hypothetical protein  90.93 
 
 		 729 aa  1372    Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3211  hypothetical protein  87.33 
 
 		 728 aa  1315    Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.357431  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3253  hypothetical protein  89.82 
 
 		 728 aa  1352    Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3787  hypothetical protein  90.8 
 
 		 729 aa  1371    Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.859391  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2297  hypothetical protein  76.03 
 
 		 728 aa  1141    Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.806493 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2832  hypothetical protein  76.03 
 
 		 728 aa  1154    Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.134905  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3928  hypothetical protein  89.55 
 
 		 728 aa  1353    Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3592  protein of unknown function DUF181  75.27 
 
 		 734 aa  1129    Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.0680194  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3599  protein of unknown function DUF181  90.66 
 
 		 729 aa  1369    Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_28020  hypothetical protein  77.32 
 
 		 734 aa  1150    Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.458293  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2241  protein of unknown function DUF181  46.9 
 
 		 587 aa  551  1e-155  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.173958  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_00909  hypothetical protein  46.63 
 
 		 586 aa  544  1e-153  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2738  protein of unknown function DUF181  46.63 
 
 		 586 aa  544  1e-153  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.143697  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1011  hypothetical protein  46.63 
 
 		 586 aa  544  1e-153  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.0000298438  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1002  hypothetical protein  46.63 
 
 		 586 aa  544  1e-153  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.332512  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_00916  hypothetical protein  46.63 
 
 		 586 aa  544  1e-153  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2691  hypothetical protein  46.63 
 
 		 586 aa  544  1e-153  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  0.864502 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2216  hypothetical protein  46.46 
 
 		 586 aa  542  1e-153  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.522723  normal  0.321049 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2423  hypothetical protein  46.46 
 
 		 586 aa  543  1e-153  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  hitchhiker  0.00238381  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1066  hypothetical protein  46.46 
 
 		 586 aa  542  1e-153  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.0179082  normal  1 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2343  protein of unknown function DUF181  46.82 
 
 		 587 aa  540  9.999999999999999e-153  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.786631  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1425  hypothetical protein  45.77 
 
 		 586 aa  533  1e-150  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.824732  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1008  hypothetical protein  45.77 
 
 		 611 aa  534  1e-150  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1073  hypothetical protein  45.42 
 
 		 597 aa  533  1e-150  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.788303  normal  0.409514 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1088  hypothetical protein  45.6 
 
 		 611 aa  535  1e-150  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.654387  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0980  hypothetical protein  45.6 
 
 		 597 aa  533  1e-150  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  hitchhiker  0.00400135  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1039  hypothetical protein  45.42 
 
 		 586 aa  532  1e-150  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.548133  normal  0.203105 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1731  hypothetical protein  46.55 
 
 		 587 aa  524  1e-147  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.219135  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2587  hypothetical protein  45.86 
 
 		 588 aa  522  1e-147  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1948  hypothetical protein  45.86 
 
 		 588 aa  522  1e-147  Yersinia pestis Angola  Bacteria  hitchhiker  0.00321676  normal  0.0629552 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2675  hypothetical protein  45.86 
 
 		 588 aa  522  1e-147  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1704  hypothetical protein  46.03 
 
 		 587 aa  520  1e-146  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.202332  normal  1 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1999  protein of unknown function DUF181  46.55 
 
 		 587 aa  519  1e-146  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.86626  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2932  hypothetical protein  45.57 
 
 		 578 aa  518  1.0000000000000001e-145  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  hitchhiker  0.00000159994  normal  1 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0612  hypothetical protein  45.85 
 
 		 582 aa  516  1.0000000000000001e-145  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  0.166851 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2565  hypothetical protein  45.39 
 
 		 576 aa  499  1e-140  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.333323  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1265  hypothetical protein  41.3 
 
 		 584 aa  434  1e-120  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0890  protein of unknown function DUF181  38.8 
 
 		 592 aa  398  1e-109  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0114  hypothetical protein  40.62 
 
 		 536 aa  360  6e-98  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0463  protein of unknown function DUF181  33.27 
 
 		 540 aa  307  5.0000000000000004e-82  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3580  hypothetical protein  24.47 
 
 		 618 aa  136  9.999999999999999e-31  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  decreased coverage  0.00000420617  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1341  OsmC family protein  36.72 
 
 		 133 aa  100  7e-20  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0382  hypothetical protein  36.36 
 
 		 134 aa  100  1e-19  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_4072  hypothetical protein  36.72 
 
 		 134 aa  100  1e-19  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.0853904  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0351  OsmC family protein  35.16 
 
 		 134 aa  100  1e-19  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.999657  normal  0.881663 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_4221  OsmC family protein  35.94 
 
 		 135 aa  99.8  2e-19  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.741744  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0887  hypothetical protein  39.06 
 
 		 132 aa  99  3e-19  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.873349  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_4196  OsmC family protein  35.94 
 
 		 135 aa  99  3e-19  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1130  hypothetical protein  37.1 
 
 		 135 aa  94.4  6e-18  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  0.362808 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1001  OsmC family protein  35.94 
 
 		 135 aa  94  9e-18  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1489  OsmC family protein  33.07 
 
 		 181 aa  90.9  7e-17  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.172419  normal  1 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1251  OsmC family protein  35.9 
 
 		 134 aa  90.5  1e-16  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.106129  normal  0.568503 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1429  OsmC family protein  34.92 
 
 		 135 aa  85.1  0.000000000000005  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.640592  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_3179  OsmC family protein  34.29 
 
 		 159 aa  79  0.0000000000003  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3476  OsmC family protein  31.3 
 
 		 135 aa  77  0.000000000001  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  0.00107457  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1628  OsmC-like protein  31.54 
 
 		 138 aa  69.7  0.0000000002  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0181271 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0335  OsmC family protein  29.46 
 
 		 127 aa  68.2  0.0000000006  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  0.252391  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3081  OsmC-like protein  27.94 
 
 		 134 aa  65.1  0.000000004  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.344842  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0395  OsmC family protein  26.79 
 
 		 138 aa  57  0.000001  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_4465  OsmC-like protein  26.67 
 
 		 248 aa  55.5  0.000004  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1028  hypothetical protein  26.6 
 
 		 575 aa  54.7  0.000006  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1738  protein of unknown function DUF181  28.33 
 
 		 572 aa  53.9  0.00001  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  0.858461 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0361  OsmC family protein  26.4 
 
 		 140 aa  53.9  0.00001  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0541  OsmC family protein  26.19 
 
 		 151 aa  53.1  0.00002  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.489752  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3655  OsmC family protein  25 
 
 		 410 aa  52.8  0.00002  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3682  hypothetical protein  29.36 
 
 		 125 aa  52.4  0.00003  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3762  OsmC family protein  25 
 
 		 410 aa  52.4  0.00003  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2348  OsmC family protein  21.74 
 
 		 163 aa  51.2  0.00006  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.684792  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0251  OsmC family protein  28.81 
 
 		 134 aa  51.2  0.00007  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.798103  normal  0.164531 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1001  protein of unknown function DUF181  24.61 
 
 		 580 aa  50.8  0.00009  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0235  protein of unknown function DUF181  25.32 
 
 		 572 aa  50.4  0.0001  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5429  OsmC family protein  25.93 
 
 		 397 aa  48.9  0.0003  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0232  OsmC family protein  28.33 
 
 		 134 aa  48.9  0.0003  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0376  hypothetical protein  27.12 
 
 		 134 aa  48.5  0.0005  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2557  OsmC family protein  26.98 
 
 		 138 aa  48.1  0.0005  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.00000559572  hitchhiker  0.00383779 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_6108  hypothetical protein  29.27 
 
 		 396 aa  48.1  0.0005  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.886348  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4103  OsmC family protein  23.74 
 
 		 402 aa  47.8  0.0007  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.671514  normal  1 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0004  protein of unknown function DUF181  26.02 
 
 		 584 aa  47.8  0.0007  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.0544869 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>