125 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Swoo_3928 on replicon NC_010506
Organism: Shewanella woodyi ATCC 51908



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_002947  PP_3620  hypothetical protein  76.44 
 
 
728 aa  1154    Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1756  hypothetical protein  81.4 
 
 
728 aa  1240    Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_0795  hypothetical protein  86.05 
 
 
592 aa  1053    Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3214  hypothetical protein  75.38 
 
 
734 aa  1120    Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.668386  normal  0.254813 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2710  hypothetical protein  77.29 
 
 
731 aa  1178    Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal  0.579153 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0824  hypothetical protein  88.03 
 
 
728 aa  1338    Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.0307116  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0034  hypothetical protein  73.17 
 
 
735 aa  1107    Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4822  hypothetical protein  74 
 
 
734 aa  1097    Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  decreased coverage  0.000227003  normal  0.373155 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3321  hypothetical protein  88.17 
 
 
742 aa  1340    Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0632  hypothetical protein  88.17 
 
 
742 aa  1340    Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0738  hypothetical protein  90.17 
 
 
728 aa  1351    Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_39610  hypothetical protein  71.6 
 
 
616 aa  879    Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal  0.812583 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3489  hypothetical protein  87.77 
 
 
742 aa  1337    Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3569  hypothetical protein  81.57 
 
 
727 aa  1234    Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2174  hypothetical protein  77.58 
 
 
728 aa  1201    Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0643  hypothetical protein  89.38 
 
 
729 aa  1350    Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3033  hypothetical protein  89.55 
 
 
728 aa  1353    Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.431186  normal 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_2073  hypothetical protein  71.41 
 
 
734 aa  1100    Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3199  hypothetical protein  88.86 
 
 
728 aa  1344    Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1146  hypothetical protein  75.93 
 
 
732 aa  1152    Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.202327  normal  0.214349 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_28020  hypothetical protein  76.33 
 
 
734 aa  1145    Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.458293  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2113  hypothetical protein  76.3 
 
 
728 aa  1153    Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.20686  normal 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3343  hypothetical protein  87.36 
 
 
728 aa  1327    Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal  0.987058 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3664  hypothetical protein  89.24 
 
 
729 aa  1351    Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3211  hypothetical protein  89 
 
 
728 aa  1348    Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.357431  normal 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3253  hypothetical protein  93.13 
 
 
728 aa  1408    Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3787  hypothetical protein  89 
 
 
729 aa  1349    Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.859391  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2297  hypothetical protein  76.58 
 
 
728 aa  1155    Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal  0.806493 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2832  hypothetical protein  76.13 
 
 
728 aa  1162    Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.134905  normal 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3928  hypothetical protein  100 
 
 
728 aa  1500    Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3592  protein of unknown function DUF181  74.83 
 
 
734 aa  1132    Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.0680194  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3599  protein of unknown function DUF181  89 
 
 
729 aa  1350    Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2241  protein of unknown function DUF181  45.69 
 
 
587 aa  541  9.999999999999999e-153  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.173958  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1002  hypothetical protein  46.06 
 
 
586 aa  539  9.999999999999999e-153  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.332512  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1066  hypothetical protein  46.23 
 
 
586 aa  539  9.999999999999999e-153  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.0179082  normal 
 
 
-
 
CP001509  ECD_00909  hypothetical protein  46.06 
 
 
586 aa  538  1e-151  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2738  protein of unknown function DUF181  46.06 
 
 
586 aa  538  1e-151  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.143697  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_00916  hypothetical protein  46.06 
 
 
586 aa  538  1e-151  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1011  hypothetical protein  46.06 
 
 
586 aa  538  1e-151  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.0000298438  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2691  hypothetical protein  46.06 
 
 
586 aa  538  1e-151  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal  0.864502 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2216  hypothetical protein  45.89 
 
 
586 aa  537  1e-151  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.522723  normal  0.321049 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2423  hypothetical protein  45.89 
 
 
586 aa  537  1e-151  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  hitchhiker  0.00238381  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1008  hypothetical protein  45.08 
 
 
611 aa  531  1e-149  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1073  hypothetical protein  44.73 
 
 
597 aa  530  1e-149  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.788303  normal  0.409514 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1088  hypothetical protein  44.73 
 
 
611 aa  531  1e-149  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.654387  normal 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0980  hypothetical protein  44.91 
 
 
597 aa  530  1e-149  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  hitchhiker  0.00400135  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1039  hypothetical protein  44.81 
 
 
586 aa  529  1e-149  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.548133  normal  0.203105 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1425  hypothetical protein  45.25 
 
 
586 aa  528  1e-148  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.824732  normal 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2343  protein of unknown function DUF181  45.36 
 
 
587 aa  526  1e-148  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.786631  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2932  hypothetical protein  44.35 
 
 
578 aa  513  1e-144  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  hitchhiker  0.00000159994  normal 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2587  hypothetical protein  44.35 
 
 
588 aa  509  1e-143  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1948  hypothetical protein  44.35 
 
 
588 aa  509  1e-143  Yersinia pestis Angola  Bacteria  hitchhiker  0.00321676  normal  0.0629552 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2675  hypothetical protein  44.35 
 
 
588 aa  509  1e-143  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1731  hypothetical protein  44.31 
 
 
587 aa  508  9.999999999999999e-143  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.219135  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1704  hypothetical protein  44.6 
 
 
587 aa  507  9.999999999999999e-143  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.202332  normal 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0612  hypothetical protein  44.74 
 
 
582 aa  504  1e-141  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal  0.166851 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1999  protein of unknown function DUF181  44.48 
 
 
587 aa  504  1e-141  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.86626  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2565  hypothetical protein  44.44 
 
 
576 aa  486  1e-136  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.333323  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1265  hypothetical protein  40.99 
 
 
584 aa  434  1e-120  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0890  protein of unknown function DUF181  37.54 
 
 
592 aa  390  1e-107  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0114  hypothetical protein  40.5 
 
 
536 aa  373  1e-102  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0463  protein of unknown function DUF181  35.97 
 
 
540 aa  313  4.999999999999999e-84  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3580  hypothetical protein  26.83 
 
 
618 aa  139  1e-31  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  decreased coverage  0.00000420617  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0382  hypothetical protein  37.88 
 
 
134 aa  103  1e-20  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0351  OsmC family protein  35.16 
 
 
134 aa  103  1e-20  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.999657  normal  0.881663 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1341  OsmC family protein  36.72 
 
 
133 aa  102  3e-20  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_4072  hypothetical protein  35.16 
 
 
134 aa  99.8  1e-19  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.0853904  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_4221  OsmC family protein  34.38 
 
 
135 aa  99.8  2e-19  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.741744  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0887  hypothetical protein  38.28 
 
 
132 aa  99  3e-19  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.873349  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_4196  OsmC family protein  34.38 
 
 
135 aa  98.6  4e-19  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1130  hypothetical protein  37.1 
 
 
135 aa  95.9  2e-18  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  normal  0.362808 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1489  OsmC family protein  35.43 
 
 
181 aa  96.3  2e-18  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.172419  normal 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1001  OsmC family protein  35.16 
 
 
135 aa  94.4  6e-18  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1251  OsmC family protein  37.61 
 
 
134 aa  94  8e-18  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.106129  normal  0.568503 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1429  OsmC family protein  36.51 
 
 
135 aa  89.4  2e-16  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.640592  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3476  OsmC family protein  32.06 
 
 
135 aa  82  0.00000000000004  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  0.00107457  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_3179  OsmC family protein  34.29 
 
 
159 aa  77.8  0.0000000000007  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0335  OsmC family protein  31.01 
 
 
127 aa  70.5  0.0000000001  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  0.252391  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1628  OsmC-like protein  30 
 
 
138 aa  68.2  0.0000000005  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal  0.0181271 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3081  OsmC-like protein  29.41 
 
 
134 aa  67.4  0.0000000009  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.344842  normal 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3762  OsmC family protein  28.12 
 
 
410 aa  60.1  0.0000001  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3655  OsmC family protein  28.12 
 
 
410 aa  60.5  0.0000001  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0395  OsmC family protein  27.68 
 
 
138 aa  58.5  0.0000005  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006366  plpl0009  hypothetical protein  25.97 
 
 
353 aa  57.4  0.000001  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  normal  0.264047  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3682  hypothetical protein  30.28 
 
 
125 aa  56.6  0.000001  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1001  protein of unknown function DUF181  25.94 
 
 
580 aa  57.4  0.000001  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4103  OsmC family protein  27.34 
 
 
402 aa  57.4  0.000001  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.671514  normal 
 
 
-
 
NC_006365  plpp0013  hypothetical protein  26.59 
 
 
353 aa  55.8  0.000003  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  normal  0.077067  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1028  hypothetical protein  26.32 
 
 
575 aa  55.8  0.000003  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2348  OsmC family protein  22.61 
 
 
163 aa  55.1  0.000004  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.684792  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0235  protein of unknown function DUF181  25 
 
 
572 aa  54.7  0.000006  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5429  OsmC family protein  27.78 
 
 
397 aa  54.3  0.000007  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_4465  OsmC-like protein  26.67 
 
 
248 aa  54.3  0.000008  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1021  protein of unknown function DUF181  23.88 
 
 
486 aa  53.5  0.00001  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0541  OsmC family protein  25.4 
 
 
151 aa  53.9  0.00001  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.489752  normal 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1738  protein of unknown function DUF181  27.35 
 
 
572 aa  53.5  0.00001  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  normal  0.858461 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2484  OsmC family protein  27.27 
 
 
133 aa  51.6  0.00006  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal  0.092178 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0376  hypothetical protein  27.12 
 
 
134 aa  50.4  0.0001  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0251  OsmC family protein  27.5 
 
 
134 aa  50.1  0.0001  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.798103  normal  0.164531 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0361  OsmC family protein  24.8 
 
 
140 aa  49.3  0.0002  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>