83 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene DvMF_3179 on replicon NC_011769
Organism: Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011769  DvMF_3179  OsmC family protein  100 
 
 		 159 aa  320  4e-87  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0382  hypothetical protein  47.71 
 
 		 134 aa  112  1.0000000000000001e-24  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1429  OsmC family protein  53.64 
 
 		 135 aa  113  1.0000000000000001e-24  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.640592  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_4221  OsmC family protein  48.15 
 
 		 135 aa  112  3e-24  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.741744  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1001  OsmC family protein  50 
 
 		 135 aa  111  5e-24  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0351  OsmC family protein  50 
 
 		 134 aa  110  8.000000000000001e-24  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.999657  normal  0.881663 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_4196  OsmC family protein  47.22 
 
 		 135 aa  109  1.0000000000000001e-23  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1489  OsmC family protein  48.57 
 
 		 181 aa  109  2.0000000000000002e-23  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.172419  normal  1 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_4072  hypothetical protein  46.3 
 
 		 134 aa  108  2.0000000000000002e-23  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.0853904  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1251  OsmC family protein  49.53 
 
 		 134 aa  105  3e-22  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.106129  normal  0.568503 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1341  OsmC family protein  45.71 
 
 		 133 aa  105  4e-22  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0887  hypothetical protein  50.47 
 
 		 132 aa  104  6e-22  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.873349  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1130  hypothetical protein  48.6 
 
 		 135 aa  104  6e-22  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  0.362808 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3476  OsmC family protein  36.36 
 
 		 135 aa  95.9  2e-19  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  0.00107457  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0361  OsmC family protein  39.81 
 
 		 140 aa  90.9  6e-18  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2348  OsmC family protein  38.53 
 
 		 163 aa  83.2  0.000000000000002  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.684792  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0824  hypothetical protein  37.14 
 
 		 728 aa  80.9  0.000000000000006  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.0307116  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3343  hypothetical protein  37.38 
 
 		 728 aa  80.9  0.000000000000007  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  0.987058 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3569  hypothetical protein  35.29 
 
 		 727 aa  79.7  0.00000000000001  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0034  hypothetical protein  35.24 
 
 		 735 aa  79  0.00000000000002  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3033  hypothetical protein  34.29 
 
 		 728 aa  79  0.00000000000002  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.431186  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0738  hypothetical protein  35.24 
 
 		 728 aa  79.3  0.00000000000002  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0335  OsmC family protein  39.25 
 
 		 127 aa  79  0.00000000000003  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  0.252391  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2557  OsmC family protein  38.24 
 
 		 138 aa  78.6  0.00000000000003  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.00000559572  hitchhiker  0.00383779 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3253  hypothetical protein  35.24 
 
 		 728 aa  78.6  0.00000000000003  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3787  hypothetical protein  33.33 
 
 		 729 aa  77.8  0.00000000000005  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.859391  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3664  hypothetical protein  33.33 
 
 		 729 aa  77.8  0.00000000000005  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0643  hypothetical protein  33.33 
 
 		 729 aa  77.8  0.00000000000005  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3199  hypothetical protein  33.33 
 
 		 728 aa  77.8  0.00000000000005  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3599  protein of unknown function DUF181  33.33 
 
 		 729 aa  77.8  0.00000000000005  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3928  hypothetical protein  34.29 
 
 		 728 aa  77.8  0.00000000000006  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2174  hypothetical protein  36.45 
 
 		 728 aa  77.8  0.00000000000006  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3211  hypothetical protein  34.29 
 
 		 728 aa  75.5  0.0000000000003  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.357431  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3489  hypothetical protein  32.38 
 
 		 742 aa  75.1  0.0000000000003  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0632  hypothetical protein  32.38 
 
 		 742 aa  75.1  0.0000000000003  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3321  hypothetical protein  32.38 
 
 		 742 aa  75.1  0.0000000000003  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3620  hypothetical protein  37.27 
 
 		 728 aa  74.7  0.0000000000005  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2113  hypothetical protein  37.27 
 
 		 728 aa  74.7  0.0000000000005  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.20686  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2832  hypothetical protein  35.24 
 
 		 728 aa  72.8  0.000000000002  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.134905  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2297  hypothetical protein  36.36 
 
 		 728 aa  72.8  0.000000000002  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.806493 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3081  OsmC-like protein  36.45 
 
 		 134 aa  72  0.000000000003  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.344842  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1756  hypothetical protein  32.35 
 
 		 728 aa  71.6  0.000000000004  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_2073  hypothetical protein  37.27 
 
 		 734 aa  71.6  0.000000000004  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3592  protein of unknown function DUF181  33.64 
 
 		 734 aa  70.9  0.000000000007  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.0680194  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1146  hypothetical protein  33 
 
 		 732 aa  70.9  0.000000000008  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.202327  normal  0.214349 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3214  hypothetical protein  34.58 
 
 		 734 aa  70.1  0.00000000001  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.668386  normal  0.254813 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0395  OsmC family protein  34.58 
 
 		 138 aa  70.1  0.00000000001  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_28020  hypothetical protein  33.64 
 
 		 734 aa  70.1  0.00000000001  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.458293  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4822  hypothetical protein  34.58 
 
 		 734 aa  69.7  0.00000000001  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  decreased coverage  0.000227003  normal  0.373155 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2710  hypothetical protein  32.35 
 
 		 731 aa  69.3  0.00000000002  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.579153 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4617  OsmC family protein  35.51 
 
 		 133 aa  64.7  0.0000000005  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  0.327663 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0541  OsmC family protein  35.24 
 
 		 151 aa  63.2  0.000000001  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.489752  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1613  OsmC family protein  32.71 
 
 		 133 aa  61.6  0.000000004  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_4465  OsmC-like protein  32.41 
 
 		 248 aa  60.5  0.000000009  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3682  hypothetical protein  32 
 
 		 125 aa  48.5  0.00004  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1301  OsmC family protein  26.17 
 
 		 130 aa  48.5  0.00004  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.0499071 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0342  OsmC family protein  29.91 
 
 		 135 aa  48.1  0.00005  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  0.720795  normal  0.012657 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0908  OsmC-like protein  24.3 
 
 		 130 aa  47.4  0.00009  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1390  OsmC family protein  24.3 
 
 		 130 aa  47.4  0.00009  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.51882  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1628  OsmC-like protein  27.08 
 
 		 138 aa  47  0.0001  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0181271 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1605  OsmC family protein  29.41 
 
 		 161 aa  47  0.0001  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1368  OsmC family protein  24.3 
 
 		 130 aa  47  0.0001  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.0210899 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1267  OsmC family protein  25.23 
 
 		 130 aa  47  0.0001  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0921  OsmC family protein  29.2 
 
 		 136 aa  45.8  0.0002  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.418667  normal  1 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1436  OsmC family protein  35 
 
 		 134 aa  45.8  0.0003  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_3616  osmotically inducible protein  28 
 
 		 129 aa  45.1  0.0004  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000818818  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0974  OsmC family protein  34.62 
 
 		 128 aa  44.3  0.0007  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.637714  normal  0.331477 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1440  OsmC family protein  28.99 
 
 		 142 aa  43.9  0.001  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1917  OsmC family protein  25.23 
 
 		 130 aa  43.9  0.001  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.591016  normal  0.655521 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1531  OsmC family protein  33.85 
 
 		 154 aa  43.5  0.001  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0339  OsmC family protein  27.97 
 
 		 145 aa  43.5  0.001  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.53983  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_10251  redox protein, regulator of disulfide bond formation  26.25 
 
 		 135 aa  42.7  0.002  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4533  OsmC-like protein  26 
 
 		 130 aa  42.4  0.002  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.257374 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2951  OsmC-like protein  29.36 
 
 		 162 aa  42.7  0.002  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000581038 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1919  OsmC family protein  28.12 
 
 		 131 aa  43.1  0.002  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.148561  normal  1 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0845  OsmC family protein  25.71 
 
 		 132 aa  42.7  0.002  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  1  normal  0.0344874 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0232  OsmC family protein  31.13 
 
 		 134 aa  42.4  0.003  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2484  OsmC family protein  29.67 
 
 		 133 aa  42.4  0.003  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  0.092178 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1923  OsmC-like protein  36 
 
 		 127 aa  41.6  0.004  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4103  OsmC family protein  25.23 
 
 		 402 aa  41.2  0.005  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.671514  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1438  OsmC family protein  25 
 
 		 137 aa  40.8  0.007  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.139134 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2193  OsmC family protein  47.5 
 
 		 129 aa  40.8  0.009  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.208378  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0982  OsmC family protein  26.58 
 
 		 127 aa  40.4  0.009  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>