72 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Syncc9902_0946 on replicon NC_007513
Organism: Synechococcus sp. CC9902



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007513  Syncc9902_0946  putative redox protein  100 
 
 
131 aa  271  2.0000000000000002e-72  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_10251  redox protein, regulator of disulfide bond formation  55.38 
 
 
135 aa  157  6e-38  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009976  P9211_15061  redox protein, regulator of disulfide bond formation  52.31 
 
 
320 aa  147  7e-35  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  0.0738856  normal  0.127716 
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_17941  hypothetical protein  52.89 
 
 
122 aa  140  6e-33  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  0.758447  normal 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_0937  redox protein  52.89 
 
 
122 aa  139  9.999999999999999e-33  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  0.393719  n/a   
 
 
-
 
NC_009976  P9211_15411  redox protein, regulator of disulfide bond formation  51.64 
 
 
306 aa  137  3e-32  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_1036  putative stress-induced protein OsmC  47.29 
 
 
135 aa  127  6e-29  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  0.347176  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_11241  putative stress-induced protein OsmC  45.74 
 
 
135 aa  126  1.0000000000000001e-28  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  0.160014  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_11251  putative stress-induced protein OsmC  45.74 
 
 
139 aa  125  1.0000000000000001e-28  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0342  OsmC family protein  44.44 
 
 
135 aa  112  2.0000000000000002e-24  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  0.720795  normal  0.012657 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_00995  hypothetical protein  41.27 
 
 
133 aa  106  1e-22  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3187  hypothetical protein  39.84 
 
 
136 aa  104  5e-22  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0444  OsmC family protein  43.2 
 
 
144 aa  103  7e-22  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_4047  OsmC family protein  42.28 
 
 
137 aa  103  9e-22  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.325881  normal  0.623088 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0647  OsmC family protein  40 
 
 
137 aa  99.4  2e-20  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0556  hypothetical protein  37.8 
 
 
136 aa  97.1  7e-20  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  normal  0.768195 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0566  hypothetical protein  36.07 
 
 
136 aa  93.6  8e-19  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  0.838093  normal 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0515  OsmC family protein  38.02 
 
 
134 aa  93.6  8e-19  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.0859672  normal  0.078618 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1698  OsmC family protein  34.85 
 
 
136 aa  91.3  4e-18  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2380  OsmC family protein  31.78 
 
 
133 aa  86.7  9e-17  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0845  OsmC family protein  29.84 
 
 
132 aa  75.9  0.0000000000002  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  normal  0.0344874 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1919  OsmC family protein  31.53 
 
 
131 aa  64.3  0.0000000005  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.148561  normal 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1538  OsmC family protein  25.78 
 
 
136 aa  63.5  0.000000001  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  hitchhiker  0.000238366  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1438  OsmC family protein  30.17 
 
 
137 aa  60.1  0.00000001  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal  0.139134 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1082  OsmC-like family protein  32.11 
 
 
141 aa  58.9  0.00000002  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.0521945  normal  0.207247 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3491  OsmC family protein  27.78 
 
 
131 aa  55.5  0.0000003  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1368  OsmC family protein  31.13 
 
 
130 aa  52.8  0.000001  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.0210899 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0908  OsmC-like protein  31.13 
 
 
130 aa  53.1  0.000001  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0979  OsmC family protein  29.09 
 
 
418 aa  53.1  0.000001  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2193  OsmC family protein  30.19 
 
 
129 aa  53.5  0.000001  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.208378  normal 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1390  OsmC family protein  31.13 
 
 
130 aa  53.1  0.000001  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.51882  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2717  OsmC-like protein  31.25 
 
 
135 aa  52.4  0.000002  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00712413 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1267  OsmC family protein  30.19 
 
 
130 aa  52.4  0.000002  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3145  redox protein regulator of disulfide bond formation, OsmC-like  28.68 
 
 
132 aa  51.2  0.000005  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.102127 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1206  OsmC family protein  27.61 
 
 
413 aa  50.4  0.000007  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.423514  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1301  OsmC family protein  28.3 
 
 
130 aa  49.7  0.00002  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal  0.0499071 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4533  OsmC-like protein  28.3 
 
 
130 aa  48.5  0.00003  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.257374 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0335  OsmC family protein  22.48 
 
 
127 aa  48.1  0.00004  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  0.252391  normal 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1403  OsmC family protein  27.91 
 
 
132 aa  47.4  0.00006  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0655694  normal  0.111545 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_4048  OsmC family protein  25 
 
 
415 aa  47  0.00009  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  unclonable  0.0000134708  normal 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1013  OsmC-like protein  26.55 
 
 
423 aa  46.6  0.0001  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.325781  normal 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1917  OsmC family protein  27.36 
 
 
130 aa  46.2  0.0001  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.591016  normal  0.655521 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3762  OsmC family protein  26.27 
 
 
410 aa  46.2  0.0001  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1628  OsmC-like protein  29.91 
 
 
138 aa  46.2  0.0001  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal  0.0181271 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6443  OsmC family protein  30.36 
 
 
408 aa  45.8  0.0002  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.588479  normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0921  OsmC family protein  28.04 
 
 
136 aa  45.8  0.0002  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.418667  normal 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5429  OsmC family protein  28.16 
 
 
397 aa  45.8  0.0002  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4175  hypothetical protein  27.52 
 
 
135 aa  45.4  0.0002  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.214068  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1950  OsmC family protein  26.36 
 
 
132 aa  45.1  0.0003  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.378128  normal 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5556  OsmC-like protein  33.33 
 
 
130 aa  45.1  0.0003  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  hitchhiker  0.0000078778  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_48750  hypothetical protein  26.61 
 
 
135 aa  44.3  0.0006  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000274485 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_6150  OsmC family protein  28.57 
 
 
408 aa  44.3  0.0006  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.773624  normal 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3655  OsmC family protein  25.42 
 
 
410 aa  43.9  0.0007  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1440  OsmC family protein  24.78 
 
 
142 aa  43.9  0.0008  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0049  OsmC family protein  23.85 
 
 
406 aa  43.9  0.0008  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_4465  OsmC-like protein  25.44 
 
 
248 aa  43.1  0.001  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1341  OsmC family protein  23.3 
 
 
133 aa  42.7  0.002  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1777  OsmC-like protein  22.73 
 
 
410 aa  42.7  0.002  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.0113862  normal 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1923  OsmC-like protein  26.79 
 
 
127 aa  42.7  0.002  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4617  OsmC family protein  26.13 
 
 
133 aa  42.7  0.002  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  normal  0.327663 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1840  hypothetical protein  24.55 
 
 
405 aa  42.7  0.002  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal  0.949047 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_3616  osmotically inducible protein  29.21 
 
 
129 aa  42.7  0.002  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000818818  normal 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1595  OsmC family protein  30 
 
 
134 aa  41.6  0.003  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2484  OsmC family protein  29.29 
 
 
133 aa  42  0.003  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal  0.092178 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2279  OsmC family protein  30 
 
 
155 aa  42  0.003  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.0377998  normal  0.182149 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5571  OsmC family protein  24.59 
 
 
408 aa  41.2  0.005  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal  0.0439292 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0382  hypothetical protein  26.45 
 
 
134 aa  41.2  0.005  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4769  OsmC family protein  29.36 
 
 
153 aa  41.2  0.005  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  hitchhiker  0.00807264  hitchhiker  0.00049584 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6635  OsmC family protein  26.52 
 
 
411 aa  40.8  0.006  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.659004  hitchhiker  0.00000360166 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1613  OsmC family protein  25.23 
 
 
133 aa  40.4  0.008  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1130  hypothetical protein  25.2 
 
 
135 aa  40.4  0.008  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  normal  0.362808 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2898  OsmC-like protein  29.17 
 
 
135 aa  40.4  0.009  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal  0.533642 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>