67 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Slin_0444 on replicon NC_013730
Organism: Spirosoma linguale DSM 74



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013730  Slin_0444  OsmC family protein  100 
 
 
144 aa  293  6e-79  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2380  OsmC family protein  51.49 
 
 
133 aa  138  3e-32  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1698  OsmC family protein  46.48 
 
 
136 aa  137  7e-32  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3187  hypothetical protein  51.54 
 
 
136 aa  134  3.0000000000000003e-31  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0647  OsmC family protein  50.74 
 
 
137 aa  131  3e-30  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_4047  OsmC family protein  52.21 
 
 
137 aa  130  5e-30  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.325881  normal  0.623088 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_00995  hypothetical protein  48.51 
 
 
133 aa  127  5.0000000000000004e-29  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0556  hypothetical protein  50.37 
 
 
136 aa  127  5.0000000000000004e-29  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  normal  0.768195 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0566  hypothetical protein  49.25 
 
 
136 aa  125  1.0000000000000001e-28  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  0.838093  normal 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0515  OsmC family protein  44.85 
 
 
134 aa  125  2.0000000000000002e-28  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.0859672  normal  0.078618 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0342  OsmC family protein  49.61 
 
 
135 aa  119  1.9999999999999998e-26  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  0.720795  normal  0.012657 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_10251  redox protein, regulator of disulfide bond formation  43.8 
 
 
135 aa  115  1.9999999999999998e-25  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008816  A9601_11251  putative stress-induced protein OsmC  41.91 
 
 
139 aa  114  5e-25  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_11241  putative stress-induced protein OsmC  41.91 
 
 
135 aa  114  6e-25  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  0.160014  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_1036  putative stress-induced protein OsmC  41.01 
 
 
135 aa  111  4.0000000000000004e-24  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  0.347176  n/a   
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_0946  putative redox protein  43.2 
 
 
131 aa  103  7e-22  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009976  P9211_15061  redox protein, regulator of disulfide bond formation  38.93 
 
 
320 aa  101  3e-21  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  0.0738856  normal  0.127716 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_0937  redox protein  40 
 
 
122 aa  100  7e-21  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  0.393719  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_17941  hypothetical protein  38.4 
 
 
122 aa  98.6  3e-20  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  0.758447  normal 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0845  OsmC family protein  36.96 
 
 
132 aa  96.7  9e-20  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  normal  0.0344874 
 
 
-
 
NC_009976  P9211_15411  redox protein, regulator of disulfide bond formation  37.59 
 
 
306 aa  94.4  5e-19  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1538  OsmC family protein  28.36 
 
 
136 aa  69.3  0.00000000002  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  hitchhiker  0.000238366  normal 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1013  OsmC-like protein  34.48 
 
 
423 aa  55.5  0.0000002  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.325781  normal 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6443  OsmC family protein  32.14 
 
 
408 aa  51.2  0.000005  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.588479  normal 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1082  OsmC-like family protein  28.44 
 
 
141 aa  50.4  0.000008  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.0521945  normal  0.207247 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1438  OsmC family protein  30.97 
 
 
137 aa  50.1  0.000009  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal  0.139134 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_6150  OsmC family protein  31.25 
 
 
408 aa  50.1  0.00001  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.773624  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5966  OsmC family protein  20.74 
 
 
131 aa  48.9  0.00002  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.136063  normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_48750  hypothetical protein  31.91 
 
 
135 aa  49.3  0.00002  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000274485 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2348  OsmC family protein  33.06 
 
 
163 aa  48.5  0.00003  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.684792  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2193  OsmC family protein  29.91 
 
 
129 aa  48.5  0.00003  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.208378  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4175  hypothetical protein  30.85 
 
 
135 aa  48.1  0.00004  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.214068  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1917  OsmC family protein  30.89 
 
 
130 aa  47.8  0.00005  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.591016  normal  0.655521 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1919  OsmC family protein  29.82 
 
 
131 aa  47  0.00009  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.148561  normal 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0778  OsmC family protein  26.76 
 
 
137 aa  45.8  0.0002  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.231351  normal  0.206875 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1267  OsmC family protein  30.89 
 
 
130 aa  46.2  0.0002  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1628  OsmC-like protein  32.26 
 
 
138 aa  45.1  0.0003  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal  0.0181271 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2167  OsmC family protein  28.46 
 
 
136 aa  44.7  0.0004  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.335018  normal 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3762  OsmC family protein  28.57 
 
 
410 aa  44.3  0.0005  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1301  OsmC family protein  30.08 
 
 
130 aa  44.7  0.0005  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal  0.0499071 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1840  hypothetical protein  29.75 
 
 
405 aa  44.3  0.0006  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal  0.949047 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1777  OsmC-like protein  28.46 
 
 
410 aa  44.3  0.0006  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.0113862  normal 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1440  OsmC family protein  30 
 
 
142 aa  43.9  0.0007  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1390  OsmC family protein  30.89 
 
 
130 aa  43.9  0.0007  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.51882  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1368  OsmC family protein  30.89 
 
 
130 aa  43.9  0.0007  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.0210899 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0908  OsmC-like protein  30.89 
 
 
130 aa  43.9  0.0007  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0382  hypothetical protein  29.06 
 
 
134 aa  43.9  0.0008  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1835  OsmC-like protein  32.14 
 
 
407 aa  43.5  0.0009  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3137  OsmC family protein  25.93 
 
 
131 aa  43.5  0.0009  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.565798  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2484  OsmC family protein  28.85 
 
 
133 aa  43.1  0.001  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal  0.092178 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2873  hypothetical protein  30.17 
 
 
405 aa  43.1  0.001  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.326467  normal  0.0265941 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1930  OsmC family protein  31.78 
 
 
407 aa  43.5  0.001  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.0101124  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0979  OsmC family protein  30.25 
 
 
418 aa  43.5  0.001  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4533  OsmC-like protein  28.46 
 
 
130 aa  43.5  0.001  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.257374 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3633  OsmC-like protein  30.36 
 
 
406 aa  42.4  0.002  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal  0.525721 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1923  OsmC-like protein  30.56 
 
 
127 aa  42.7  0.002  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2717  OsmC-like protein  33.01 
 
 
135 aa  42  0.003  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00712413 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1994  OsmC family protein  26.17 
 
 
171 aa  42  0.003  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0235  OsmC family protein  30 
 
 
147 aa  42  0.003  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2505  OsmC family protein  26.36 
 
 
147 aa  41.6  0.004  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0921  OsmC family protein  29 
 
 
136 aa  41.6  0.004  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.418667  normal 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0732  OsmC family protein  35 
 
 
137 aa  41.6  0.004  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.560509  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4617  OsmC family protein  32.47 
 
 
133 aa  41.2  0.005  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  normal  0.327663 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3655  OsmC family protein  27.07 
 
 
410 aa  40.8  0.006  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5976  OsmC family protein  27.27 
 
 
130 aa  40.8  0.006  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003296  RSp1107  organic hydroperoxide resistance protein  27.96 
 
 
141 aa  40.8  0.006  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.463779  normal  0.729784 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3491  OsmC family protein  26.13 
 
 
131 aa  40.8  0.007  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>