22 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cpin_5976 on replicon NC_013132
Organism: Chitinophaga pinensis DSM 2588



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013132  Cpin_5976  OsmC family protein  100 
 
 		 130 aa  269  9e-72  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5966  OsmC family protein  28.91 
 
 		 131 aa  89.4  1e-17  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.136063  normal  1 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1698  OsmC family protein  33.06 
 
 		 136 aa  50.8  0.000006  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0515  OsmC family protein  30.21 
 
 		 134 aa  48.9  0.00002  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.0859672  normal  0.078618 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0310  OsmC family protein  37 
 
 		 186 aa  48.5  0.00003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009976  P9211_15411  redox protein, regulator of disulfide bond formation  30.3 
 
 		 306 aa  48.1  0.00004  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_00995  hypothetical protein  25.23 
 
 		 133 aa  47.8  0.00005  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0647  OsmC family protein  28.42 
 
 		 137 aa  46.2  0.0002  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_4047  OsmC family protein  25 
 
 		 137 aa  45.1  0.0003  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.325881  normal  0.623088 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_10251  redox protein, regulator of disulfide bond formation  22.56 
 
 		 135 aa  45.4  0.0003  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0566  hypothetical protein  25.38 
 
 		 136 aa  43.9  0.0008  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  0.838093  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0279  OsmC family protein  34.48 
 
 		 142 aa  43.9  0.0008  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2380  OsmC family protein  26.13 
 
 		 133 aa  43.1  0.001  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009976  P9211_15061  redox protein, regulator of disulfide bond formation  24.78 
 
 		 320 aa  42.7  0.002  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  0.0738856  normal  0.127716 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1403  OsmC family protein  29.46 
 
 		 132 aa  42.4  0.002  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0655694  normal  0.111545 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3145  redox protein regulator of disulfide bond formation, OsmC-like  27.68 
 
 		 132 aa  42  0.003  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.102127 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0556  hypothetical protein  23.58 
 
 		 136 aa  41.6  0.004  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  0.768195 
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_17941  hypothetical protein  21.28 
 
 		 122 aa  41.2  0.005  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  0.758447  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0444  OsmC family protein  27.27 
 
 		 144 aa  40.8  0.006  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0342  OsmC family protein  25.44 
 
 		 135 aa  40.4  0.008  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  0.720795  normal  0.012657 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1917  OsmC family protein  30.68 
 
 		 130 aa  40  0.01  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.591016  normal  0.655521 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_0937  redox protein  21.28 
 
 		 122 aa  40  0.01  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  0.393719  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>