26 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rleg2_0279 on replicon NC_011369
Organism: Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011369  Rleg2_0279  OsmC family protein  100 
 
 
142 aa  289  1e-77  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0310  OsmC family protein  91.49 
 
 
186 aa  269  9e-72  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0834  hypothetical protein  65.71 
 
 
143 aa  198  1.9999999999999998e-50  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4634  OsmC family protein  66.2 
 
 
143 aa  184  5e-46  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal  0.46225 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1413  OsmC family protein  48.23 
 
 
140 aa  144  5e-34  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0458  OsmC-like protein  37.69 
 
 
155 aa  82.8  0.000000000000001  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.725308  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3619  OsmC family protein  36.22 
 
 
149 aa  55.5  0.0000002  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.108059  hitchhiker  0.0000417493 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_5733  OsmC family protein  31.25 
 
 
138 aa  47  0.00008  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.930531  normal  0.319768 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_6486  OsmC family protein  31.25 
 
 
138 aa  46.6  0.0001  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5976  OsmC family protein  34.48 
 
 
130 aa  43.9  0.0008  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4967  OsmC family protein  27.5 
 
 
141 aa  43.5  0.001  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.35536  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4004  OsmC family protein  32.58 
 
 
136 aa  43.5  0.001  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.911432  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_3618  organic hydroperoxide resistance protein OhrB  28.57 
 
 
140 aa  42.4  0.002  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1819  OsmC-like protein  31.25 
 
 
137 aa  42  0.002  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2927  OsmC-like protein  28.16 
 
 
142 aa  42.7  0.002  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.855798  normal  0.446671 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1204  OsmC family protein  28.57 
 
 
140 aa  42  0.003  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal  0.0357718 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1194  OsmC family protein  28.57 
 
 
140 aa  42  0.003  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1177  OsmC-like protein  28.57 
 
 
140 aa  42  0.003  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.772559  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0422  OsmC family protein  30.3 
 
 
140 aa  41.6  0.004  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.163658  normal 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3597  OsmC family protein  29.71 
 
 
140 aa  41.2  0.004  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  unclonable  0.0000000000950914  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4272  OsmC family protein  30.43 
 
 
138 aa  40.8  0.006  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.0619727  normal  0.629976 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03141  putative organic hydroperoxide resistance protein  29.23 
 
 
142 aa  40.8  0.007  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.499234  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3893  OsmC family protein  28.87 
 
 
165 aa  40.4  0.007  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.254046  normal  0.0151662 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1244  OsmC family protein  27.54 
 
 
144 aa  40.4  0.008  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  unclonable  0.00000000339163  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6635  OsmC family protein  26.26 
 
 
411 aa  40.4  0.008  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.659004  hitchhiker  0.00000360166 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0921  OsmC family protein  27.55 
 
 
136 aa  40.4  0.009  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.418667  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>