13 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Smed_4634 on replicon NC_009620
Organism: Sinorhizobium medicae WSM419



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009620  Smed_4634  OsmC family protein  100 
 
 		 143 aa  286  7e-77  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.46225 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0310  OsmC family protein  67.38 
 
 		 186 aa  201  3e-51  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0279  OsmC family protein  66.2 
 
 		 142 aa  198  1.9999999999999998e-50  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0834  hypothetical protein  62.14 
 
 		 143 aa  183  6e-46  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1413  OsmC family protein  54.61 
 
 		 140 aa  150  7e-36  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0458  OsmC-like protein  49.6 
 
 		 155 aa  98.6  2e-20  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.725308  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_02740  OsmC family protein  26.19 
 
 		 130 aa  45.8  0.0002  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2694  OsmC family protein  33.33 
 
 		 130 aa  46.2  0.0002  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.0448513  normal  0.13145 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1438  OsmC family protein  34.04 
 
 		 137 aa  45.1  0.0003  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.139134 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1923  OsmC-like protein  35.16 
 
 		 127 aa  43.5  0.0009  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8006  OsmC family protein  27.78 
 
 		 134 aa  41.2  0.005  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3633  OsmC-like protein  31.06 
 
 		 406 aa  40.4  0.007  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.525721 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1272  OsmC family protein  26.04 
 
 		 136 aa  40.4  0.008  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.923187  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>