14 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cpin_5966 on replicon NC_013132
Organism: Chitinophaga pinensis DSM 2588



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013132  Cpin_5966  OsmC family protein  100 
 
 		 131 aa  272  1.0000000000000001e-72  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.136063  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5976  OsmC family protein  28.91 
 
 		 130 aa  89.4  1e-17  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_00995  hypothetical protein  32.04 
 
 		 133 aa  55.8  0.0000002  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0515  OsmC family protein  28.57 
 
 		 134 aa  53.1  0.000001  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.0859672  normal  0.078618 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1698  OsmC family protein  23.31 
 
 		 136 aa  52.8  0.000002  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0444  OsmC family protein  20.74 
 
 		 144 aa  48.9  0.00002  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0342  OsmC family protein  26.92 
 
 		 135 aa  46.6  0.0001  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  0.720795  normal  0.012657 
 
 
-
 
NC_009976  P9211_15061  redox protein, regulator of disulfide bond formation  26.52 
 
 		 320 aa  43.9  0.0008  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  0.0738856  normal  0.127716 
 
 
-
 
NC_009976  P9211_15411  redox protein, regulator of disulfide bond formation  27.84 
 
 		 306 aa  43.9  0.0008  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2380  OsmC family protein  27.45 
 
 		 133 aa  41.2  0.005  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_4047  OsmC family protein  22.14 
 
 		 137 aa  40.8  0.006  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.325881  normal  0.623088 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2843  organic hydroperoxide resistance protein  29.76 
 
 		 139 aa  40.8  0.007  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.151375  normal  1 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3232  OsmC family protein  26.44 
 
 		 139 aa  40  0.01  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  0.0693677 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3761  OsmC family protein  26.44 
 
 		 139 aa  40  0.01  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.80591  hitchhiker  0.00132961 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>