40 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Phep_0515 on replicon NC_013061
Organism: Pedobacter heparinus DSM 2366



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013061  Phep_0515  OsmC family protein  100 
 
 
134 aa  280  6.000000000000001e-75  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.0859672  normal  0.078618 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0566  hypothetical protein  57.14 
 
 
136 aa  158  3e-38  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  0.838093  normal 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0556  hypothetical protein  56.39 
 
 
136 aa  157  3e-38  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  normal  0.768195 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_00995  hypothetical protein  53.79 
 
 
133 aa  152  1e-36  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0647  OsmC family protein  54.41 
 
 
137 aa  152  1e-36  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2380  OsmC family protein  52.27 
 
 
133 aa  148  2e-35  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1698  OsmC family protein  50 
 
 
136 aa  146  1.0000000000000001e-34  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3187  hypothetical protein  48.84 
 
 
136 aa  134  6.0000000000000005e-31  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0342  OsmC family protein  46.32 
 
 
135 aa  133  7.000000000000001e-31  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  0.720795  normal  0.012657 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0444  OsmC family protein  44.85 
 
 
144 aa  125  2.0000000000000002e-28  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_10251  redox protein, regulator of disulfide bond formation  40.3 
 
 
135 aa  115  3e-25  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_4047  OsmC family protein  43.61 
 
 
137 aa  113  7.999999999999999e-25  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.325881  normal  0.623088 
 
 
-
 
NC_009091  P9301_11241  putative stress-induced protein OsmC  40 
 
 
135 aa  109  1.0000000000000001e-23  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  0.160014  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_11251  putative stress-induced protein OsmC  40.3 
 
 
139 aa  107  4.0000000000000004e-23  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_1036  putative stress-induced protein OsmC  38.52 
 
 
135 aa  104  4e-22  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  0.347176  n/a   
 
 
-
 
NC_009976  P9211_15061  redox protein, regulator of disulfide bond formation  38.58 
 
 
320 aa  102  2e-21  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  0.0738856  normal  0.127716 
 
 
-
 
NC_009976  P9211_15411  redox protein, regulator of disulfide bond formation  39.84 
 
 
306 aa  99  2e-20  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0845  OsmC family protein  36.92 
 
 
132 aa  95.1  3e-19  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  normal  0.0344874 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_0946  putative redox protein  38.02 
 
 
131 aa  93.6  9e-19  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_17941  hypothetical protein  40.18 
 
 
122 aa  89.4  2e-17  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  0.758447  normal 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_0937  redox protein  40.18 
 
 
122 aa  88.6  2e-17  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  0.393719  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1538  OsmC family protein  25.93 
 
 
136 aa  57  0.00000008  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  hitchhiker  0.000238366  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5966  OsmC family protein  28.57 
 
 
131 aa  53.1  0.000001  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.136063  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5976  OsmC family protein  30.21 
 
 
130 aa  48.9  0.00002  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1001  OsmC family protein  30.09 
 
 
135 aa  46.6  0.0001  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_4465  OsmC-like protein  29.63 
 
 
248 aa  45.1  0.0003  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2348  OsmC family protein  28.71 
 
 
163 aa  45.1  0.0004  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.684792  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0541  OsmC family protein  30.61 
 
 
151 aa  44.7  0.0005  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.489752  normal 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3491  OsmC family protein  24.79 
 
 
131 aa  44.3  0.0006  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1130  hypothetical protein  27.43 
 
 
135 aa  43.9  0.0008  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  normal  0.362808 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2174  hypothetical protein  28.07 
 
 
728 aa  42.4  0.002  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1438  OsmC family protein  22.64 
 
 
137 aa  42  0.003  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal  0.139134 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3343  hypothetical protein  28.72 
 
 
728 aa  41.6  0.004  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal  0.987058 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3489  hypothetical protein  27.66 
 
 
742 aa  40.8  0.006  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3321  hypothetical protein  27.66 
 
 
742 aa  40.8  0.006  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1341  OsmC family protein  28.68 
 
 
133 aa  40.8  0.007  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0632  hypothetical protein  27.66 
 
 
742 aa  40.8  0.007  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2505  OsmC family protein  23.26 
 
 
147 aa  40.4  0.007  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3137  OsmC family protein  27.91 
 
 
131 aa  40.4  0.008  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.565798  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3747  OsmC family protein  29.7 
 
 
148 aa  40  0.01  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>