34 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Psyc_0566 on replicon NC_007204
Organism: Psychrobacter arcticus 273-4



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007204  Psyc_0566  hypothetical protein  100 
 
 		 136 aa  281  3.0000000000000004e-75  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  0.838093  normal  1 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0556  hypothetical protein  93.38 
 
 		 136 aa  267  2.9999999999999997e-71  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  0.768195 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0647  OsmC family protein  68.89 
 
 		 137 aa  196  6e-50  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2380  OsmC family protein  56.15 
 
 		 133 aa  162  2.0000000000000002e-39  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0515  OsmC family protein  57.14 
 
 		 134 aa  158  3e-38  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.0859672  normal  0.078618 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_00995  hypothetical protein  54.33 
 
 		 133 aa  152  1e-36  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3187  hypothetical protein  50.4 
 
 		 136 aa  128  3e-29  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0342  OsmC family protein  48.8 
 
 		 135 aa  127  5.0000000000000004e-29  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  0.720795  normal  0.012657 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0444  OsmC family protein  49.25 
 
 		 144 aa  125  1.0000000000000001e-28  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1698  OsmC family protein  45.31 
 
 		 136 aa  124  3e-28  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_10251  redox protein, regulator of disulfide bond formation  44.44 
 
 		 135 aa  117  6e-26  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_4047  OsmC family protein  48.41 
 
 		 137 aa  117  7e-26  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.325881  normal  0.623088 
 
 
-
 
NC_008816  A9601_11251  putative stress-induced protein OsmC  41.79 
 
 		 139 aa  106  1e-22  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_1036  putative stress-induced protein OsmC  41.48 
 
 		 135 aa  105  2e-22  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  0.347176  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_11241  putative stress-induced protein OsmC  41.35 
 
 		 135 aa  102  2e-21  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  0.160014  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0845  OsmC family protein  37.82 
 
 		 132 aa  97.1  8e-20  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  1  normal  0.0344874 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_0946  putative redox protein  36.07 
 
 		 131 aa  93.6  8e-19  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009976  P9211_15411  redox protein, regulator of disulfide bond formation  38.74 
 
 		 306 aa  92  3e-18  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009976  P9211_15061  redox protein, regulator of disulfide bond formation  36.13 
 
 		 320 aa  89.4  2e-17  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  0.0738856  normal  0.127716 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_0937  redox protein  37.7 
 
 		 122 aa  83.6  8e-16  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  0.393719  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_17941  hypothetical protein  36.89 
 
 		 122 aa  81.3  0.000000000000004  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  0.758447  normal  1 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1538  OsmC family protein  27.64 
 
 		 136 aa  63.2  0.000000001  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  hitchhiker  0.000238366  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1082  OsmC-like family protein  32.32 
 
 		 141 aa  50.8  0.000006  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.0521945  normal  0.207247 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1628  OsmC-like protein  23.47 
 
 		 138 aa  45.1  0.0003  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0181271 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2578  OsmC family protein  27.69 
 
 		 142 aa  44.3  0.0005  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3476  OsmC family protein  26.4 
 
 		 135 aa  43.9  0.0007  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  0.00107457  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5976  OsmC family protein  25.38 
 
 		 130 aa  43.9  0.0008  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1438  OsmC family protein  27.59 
 
 		 137 aa  43.9  0.0008  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.139134 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2818  OsmC-like protein  27.83 
 
 		 138 aa  42.4  0.002  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0976  OsmC family protein  23.6 
 
 		 118 aa  41.6  0.004  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3491  OsmC family protein  26.73 
 
 		 131 aa  41.6  0.004  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2193  OsmC family protein  26.89 
 
 		 129 aa  40.8  0.007  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.208378  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_4465  OsmC-like protein  28.97 
 
 		 248 aa  40.4  0.008  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2557  OsmC family protein  26 
 
 		 138 aa  40.4  0.009  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.00000559572  hitchhiker  0.00383779 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>