170 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene CHU_1082 on replicon NC_008255
Organism: Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008255  CHU_1082  OsmC-like family protein  100 
 
 
141 aa  290  4e-78  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.0521945  normal  0.207247 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3491  OsmC family protein  47.33 
 
 
131 aa  134  5e-31  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1438  OsmC family protein  43.28 
 
 
137 aa  124  3e-28  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal  0.139134 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1301  OsmC family protein  54.81 
 
 
130 aa  116  9e-26  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal  0.0499071 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1267  OsmC family protein  53.85 
 
 
130 aa  115  1.9999999999999998e-25  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1917  OsmC family protein  54.81 
 
 
130 aa  115  1.9999999999999998e-25  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.591016  normal  0.655521 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1950  OsmC family protein  46.09 
 
 
132 aa  115  3e-25  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.378128  normal 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1368  OsmC family protein  54.81 
 
 
130 aa  115  3e-25  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.0210899 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0908  OsmC-like protein  54.81 
 
 
130 aa  115  3e-25  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1390  OsmC family protein  54.81 
 
 
130 aa  115  3e-25  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.51882  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4533  OsmC-like protein  53.85 
 
 
130 aa  114  5e-25  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.257374 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3145  redox protein regulator of disulfide bond formation, OsmC-like  51.85 
 
 
132 aa  112  2.0000000000000002e-24  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.102127 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0921  OsmC family protein  42.86 
 
 
136 aa  110  5e-24  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.418667  normal 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1403  OsmC family protein  50 
 
 
132 aa  107  5e-23  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0655694  normal  0.111545 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_4048  OsmC family protein  41.43 
 
 
415 aa  105  2e-22  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  unclonable  0.0000134708  normal 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2658  OsmC family protein  44.35 
 
 
133 aa  101  3e-21  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.653298  normal  0.498397 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3655  OsmC family protein  38.03 
 
 
410 aa  101  4e-21  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1206  OsmC family protein  35.76 
 
 
413 aa  101  4e-21  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.423514  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0979  OsmC family protein  39.34 
 
 
418 aa  100  8e-21  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3762  OsmC family protein  38.03 
 
 
410 aa  99.8  1e-20  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4175  hypothetical protein  40.46 
 
 
135 aa  97.1  7e-20  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.214068  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_48750  hypothetical protein  42.62 
 
 
135 aa  96.3  1e-19  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000274485 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4769  OsmC family protein  43.1 
 
 
153 aa  95.1  3e-19  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  hitchhiker  0.00807264  hitchhiker  0.00049584 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1919  OsmC family protein  36.92 
 
 
131 aa  94.7  3e-19  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.148561  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6635  OsmC family protein  46.72 
 
 
411 aa  94.4  5e-19  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.659004  hitchhiker  0.00000360166 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1777  OsmC-like protein  40.71 
 
 
410 aa  93.6  8e-19  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.0113862  normal 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1856  OsmC family protein  42.99 
 
 
129 aa  93.6  9e-19  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.610023  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_12698  hypothetical protein  40.52 
 
 
405 aa  92  2e-18  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2717  OsmC-like protein  43.24 
 
 
135 aa  91.3  5e-18  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00712413 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0941  OsmC family protein  37.6 
 
 
409 aa  91.3  5e-18  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.3755  normal  0.451532 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1840  hypothetical protein  41.23 
 
 
405 aa  90.5  7e-18  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal  0.949047 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0974  OsmC family protein  40.77 
 
 
128 aa  89  2e-17  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.637714  normal  0.331477 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1440  OsmC family protein  36.36 
 
 
142 aa  87.4  7e-17  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2193  OsmC family protein  38.58 
 
 
129 aa  87.4  7e-17  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.208378  normal 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0732  OsmC family protein  46.74 
 
 
137 aa  87  7e-17  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.560509  normal 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3633  OsmC-like protein  41.18 
 
 
406 aa  86.7  9e-17  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal  0.525721 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1673  OsmC-like protein  39.17 
 
 
409 aa  86.7  1e-16  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4103  OsmC family protein  37.68 
 
 
402 aa  86.7  1e-16  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.671514  normal 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1923  OsmC-like protein  38.66 
 
 
127 aa  85.9  2e-16  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1013  OsmC-like protein  40.52 
 
 
423 aa  84  7e-16  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.325781  normal 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5429  OsmC family protein  38.18 
 
 
397 aa  83.2  0.000000000000001  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1835  OsmC-like protein  38.26 
 
 
407 aa  82.8  0.000000000000001  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_3616  osmotically inducible protein  38.66 
 
 
129 aa  82.8  0.000000000000001  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000818818  normal 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0982  OsmC family protein  38.17 
 
 
127 aa  82.8  0.000000000000001  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2142  OsmC family protein  35.61 
 
 
129 aa  83.2  0.000000000000001  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2297  OsmC-like protein  32.2 
 
 
133 aa  81.6  0.000000000000003  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.922047  normal  0.948773 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1930  OsmC family protein  37.39 
 
 
407 aa  81.6  0.000000000000004  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.0101124  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0049  OsmC family protein  35.34 
 
 
406 aa  80.5  0.000000000000007  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6443  OsmC family protein  39.25 
 
 
408 aa  79.7  0.00000000000001  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.588479  normal 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2280  OsmC-like protein  36.52 
 
 
406 aa  79  0.00000000000002  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal  0.423404 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_6150  OsmC family protein  39.25 
 
 
408 aa  79.3  0.00000000000002  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.773624  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2873  hypothetical protein  37.4 
 
 
405 aa  79  0.00000000000002  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.326467  normal  0.0265941 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4564  OsmC-like protein  31.36 
 
 
133 aa  78.6  0.00000000000003  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3799  OsmC family protein  31.36 
 
 
133 aa  78.6  0.00000000000003  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.732158  normal  0.104892 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3725  OsmC family protein  31.36 
 
 
133 aa  78.6  0.00000000000003  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.196532 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7018  OsmC family protein  37.82 
 
 
412 aa  77.4  0.00000000000005  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00716876 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3689  OsmC family protein  31.36 
 
 
133 aa  77.4  0.00000000000006  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal  0.952273 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2694  OsmC-like protein  37.39 
 
 
406 aa  77.4  0.00000000000007  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5571  OsmC family protein  33.33 
 
 
408 aa  76.6  0.0000000000001  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal  0.0439292 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_5525  OsmC family protein  30.51 
 
 
133 aa  75.5  0.0000000000002  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4937  OsmC family protein  30.51 
 
 
133 aa  73.6  0.0000000000009  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal  0.659641 
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0240  hypothetical protein  35.59 
 
 
133 aa  73.2  0.000000000001  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0949  hydrolase  35.59 
 
 
133 aa  73.2  0.000000000001  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_1423  hypothetical protein  35.59 
 
 
133 aa  73.2  0.000000000001  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2657  putative hydrolase  35.59 
 
 
133 aa  73.2  0.000000000001  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2518  hypothetical protein  35.59 
 
 
133 aa  73.2  0.000000000001  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.0608844  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0518  OsmC-like protein superfamily protein  36.79 
 
 
153 aa  72.4  0.000000000002  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE1727  hypothetical protein  34.96 
 
 
138 aa  70.9  0.000000000006  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2484  OsmC family protein  33.33 
 
 
133 aa  70.5  0.000000000007  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal  0.092178 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5556  OsmC-like protein  41.35 
 
 
130 aa  68.9  0.00000000002  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  hitchhiker  0.0000078778  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3965  OsmC family protein  36 
 
 
132 aa  65.5  0.0000000002  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1595  OsmC family protein  32.38 
 
 
134 aa  65.1  0.0000000003  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1619  hypothetical protein  33.9 
 
 
129 aa  64.7  0.0000000004  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0276  hypothetical protein  33.9 
 
 
129 aa  64.7  0.0000000004  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2279  OsmC family protein  33.01 
 
 
155 aa  63.5  0.0000000008  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.0377998  normal  0.182149 
 
 
-
 
NC_002967  TDE1270  hypothetical protein  28.37 
 
 
144 aa  63.2  0.000000001  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  hitchhiker  0.00225413  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0232  OsmC family protein  29.63 
 
 
134 aa  63.2  0.000000001  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1628  OsmC-like protein  33.66 
 
 
138 aa  61.6  0.000000003  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal  0.0181271 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2898  OsmC-like protein  33.64 
 
 
135 aa  61.2  0.000000004  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal  0.533642 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0251  OsmC family protein  28.15 
 
 
134 aa  60.8  0.000000006  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.798103  normal  0.164531 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_00995  hypothetical protein  31.25 
 
 
133 aa  60.5  0.000000008  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_0946  putative redox protein  32.11 
 
 
131 aa  58.9  0.00000002  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_10251  redox protein, regulator of disulfide bond formation  28.57 
 
 
135 aa  59.3  0.00000002  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0647  OsmC family protein  35.19 
 
 
137 aa  58.9  0.00000002  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0376  hypothetical protein  29.27 
 
 
134 aa  58.5  0.00000003  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2557  OsmC family protein  26.23 
 
 
138 aa  58.9  0.00000003  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.00000559572  hitchhiker  0.00383779 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_4465  OsmC-like protein  25.6 
 
 
248 aa  58.5  0.00000003  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1613  OsmC family protein  28 
 
 
133 aa  58.2  0.00000004  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009976  P9211_15061  redox protein, regulator of disulfide bond formation  29.73 
 
 
320 aa  57.4  0.00000006  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  0.0738856  normal  0.127716 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4617  OsmC family protein  27.87 
 
 
133 aa  57  0.00000008  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  normal  0.327663 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0342  OsmC family protein  33.33 
 
 
135 aa  56.6  0.0000001  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  0.720795  normal  0.012657 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2354  OsmC-like protein  33.33 
 
 
170 aa  55.5  0.0000002  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.572746  n/a   
 
 
-
 
NC_009976  P9211_15411  redox protein, regulator of disulfide bond formation  28.83 
 
 
306 aa  55.8  0.0000002  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_1560  OsmC family protein  43.75 
 
 
88 aa  54.7  0.0000004  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2348  OsmC family protein  25.62 
 
 
163 aa  53.5  0.000001  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.684792  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0541  OsmC family protein  25.98 
 
 
151 aa  53.1  0.000001  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.489752  normal 
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_17941  hypothetical protein  30.91 
 
 
122 aa  52.8  0.000002  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  0.758447  normal 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1832  OsmC-like protein  29.91 
 
 
133 aa  52  0.000003  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0556  hypothetical protein  32.32 
 
 
136 aa  51.6  0.000003  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  normal  0.768195 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0361  OsmC family protein  25.4 
 
 
140 aa  51.2  0.000004  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>