71 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PMN2A_0937 on replicon NC_007335
Organism: Prochlorococcus marinus str. NATL2A



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007335  PMN2A_0937  redox protein  100 
 
 
122 aa  253  7e-67  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  0.393719  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_17941  hypothetical protein  96.72 
 
 
122 aa  245  1e-64  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  0.758447  normal 
 
 
-
 
NC_009976  P9211_15411  redox protein, regulator of disulfide bond formation  52.46 
 
 
306 aa  147  3e-35  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009976  P9211_15061  redox protein, regulator of disulfide bond formation  53.28 
 
 
320 aa  144  4.0000000000000006e-34  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  0.0738856  normal  0.127716 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_0946  putative redox protein  52.89 
 
 
131 aa  139  9.999999999999999e-33  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_1036  putative stress-induced protein OsmC  50.82 
 
 
135 aa  132  9.999999999999999e-31  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  0.347176  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_11251  putative stress-induced protein OsmC  50 
 
 
139 aa  132  9.999999999999999e-31  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_11241  putative stress-induced protein OsmC  49.18 
 
 
135 aa  130  5e-30  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  0.160014  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_10251  redox protein, regulator of disulfide bond formation  47.93 
 
 
135 aa  130  9e-30  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_4047  OsmC family protein  44.07 
 
 
137 aa  108  2.0000000000000002e-23  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.325881  normal  0.623088 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0444  OsmC family protein  40 
 
 
144 aa  100  7e-21  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0342  OsmC family protein  38.84 
 
 
135 aa  94  7e-19  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  0.720795  normal  0.012657 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0515  OsmC family protein  40.18 
 
 
134 aa  88.6  2e-17  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.0859672  normal  0.078618 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_00995  hypothetical protein  35.54 
 
 
133 aa  86.7  1e-16  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0647  OsmC family protein  37.7 
 
 
137 aa  84.3  5e-16  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0556  hypothetical protein  39.5 
 
 
136 aa  84  6e-16  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  normal  0.768195 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0566  hypothetical protein  37.7 
 
 
136 aa  83.6  8e-16  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  0.838093  normal 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3187  hypothetical protein  35.48 
 
 
136 aa  83.2  0.000000000000001  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2380  OsmC family protein  34.68 
 
 
133 aa  80.5  0.000000000000007  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1698  OsmC family protein  35.71 
 
 
136 aa  75.9  0.0000000000002  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0845  OsmC family protein  30.51 
 
 
132 aa  72.4  0.000000000002  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  normal  0.0344874 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1438  OsmC family protein  31.3 
 
 
137 aa  60.5  0.000000007  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal  0.139134 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1919  OsmC family protein  27.78 
 
 
131 aa  59.3  0.00000002  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.148561  normal 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0382  hypothetical protein  31.58 
 
 
134 aa  58.5  0.00000003  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1538  OsmC family protein  26.55 
 
 
136 aa  58.2  0.00000004  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  hitchhiker  0.000238366  normal 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3491  OsmC family protein  30.97 
 
 
131 aa  57.8  0.00000005  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1840  hypothetical protein  29.81 
 
 
405 aa  56.2  0.0000002  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal  0.949047 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0982  OsmC family protein  32.41 
 
 
127 aa  54.3  0.0000006  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2193  OsmC family protein  28.85 
 
 
129 aa  53.5  0.0000009  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.208378  normal 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1013  OsmC-like protein  27.27 
 
 
423 aa  53.1  0.000001  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.325781  normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0921  OsmC family protein  30.91 
 
 
136 aa  51.6  0.000003  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.418667  normal 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1923  OsmC-like protein  29.36 
 
 
127 aa  50.4  0.000007  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1082  OsmC-like family protein  30 
 
 
141 aa  50.4  0.000009  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.0521945  normal  0.207247 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3145  redox protein regulator of disulfide bond formation, OsmC-like  30.39 
 
 
132 aa  50.1  0.00001  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.102127 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4533  OsmC-like protein  31.87 
 
 
130 aa  49.3  0.00002  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.257374 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2348  OsmC family protein  27.19 
 
 
163 aa  49.3  0.00002  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.684792  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1130  hypothetical protein  29.81 
 
 
135 aa  48.5  0.00003  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  normal  0.362808 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1267  OsmC family protein  31.87 
 
 
130 aa  48.5  0.00003  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1301  OsmC family protein  34.52 
 
 
130 aa  48.1  0.00004  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal  0.0499071 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0541  OsmC family protein  27.78 
 
 
151 aa  47.8  0.00005  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.489752  normal 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1341  OsmC family protein  31 
 
 
133 aa  47.8  0.00005  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0979  OsmC family protein  28.16 
 
 
418 aa  47.4  0.00006  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0974  OsmC family protein  26.72 
 
 
128 aa  47.4  0.00006  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.637714  normal  0.331477 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_48750  hypothetical protein  26.17 
 
 
135 aa  47.8  0.00006  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000274485 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3762  OsmC family protein  28.46 
 
 
410 aa  47.4  0.00007  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1777  OsmC-like protein  25.2 
 
 
410 aa  47  0.00008  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.0113862  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4175  hypothetical protein  27.1 
 
 
135 aa  46.6  0.0001  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.214068  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1390  OsmC family protein  37.65 
 
 
130 aa  46.2  0.0001  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.51882  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0908  OsmC-like protein  37.65 
 
 
130 aa  46.2  0.0001  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1403  OsmC family protein  29.41 
 
 
132 aa  46.2  0.0001  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0655694  normal  0.111545 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1368  OsmC family protein  37.65 
 
 
130 aa  46.6  0.0001  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.0210899 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1440  OsmC family protein  26.13 
 
 
142 aa  46.6  0.0001  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1917  OsmC family protein  33.33 
 
 
130 aa  46.6  0.0001  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.591016  normal  0.655521 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_3616  osmotically inducible protein  33.33 
 
 
129 aa  45.1  0.0003  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000818818  normal 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3655  OsmC family protein  27.64 
 
 
410 aa  45.1  0.0003  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_12698  hypothetical protein  31.52 
 
 
405 aa  44.3  0.0006  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1251  OsmC family protein  28.43 
 
 
134 aa  43.9  0.0007  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.106129  normal  0.568503 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_4048  OsmC family protein  25.64 
 
 
415 aa  43.9  0.0007  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  unclonable  0.0000134708  normal 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1950  OsmC family protein  29.41 
 
 
132 aa  43.9  0.0007  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.378128  normal 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2484  OsmC family protein  26.26 
 
 
133 aa  43.1  0.001  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal  0.092178 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0778  OsmC family protein  26.21 
 
 
137 aa  43.5  0.001  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.231351  normal  0.206875 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4103  OsmC family protein  27.27 
 
 
402 aa  42.4  0.002  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.671514  normal 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_4465  OsmC-like protein  23.89 
 
 
248 aa  42.4  0.002  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0887  hypothetical protein  31 
 
 
132 aa  42.4  0.002  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.873349  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1001  OsmC family protein  31.31 
 
 
135 aa  42.7  0.002  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5556  OsmC-like protein  30.85 
 
 
130 aa  41.6  0.003  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  hitchhiker  0.0000078778  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0395  OsmC family protein  24.07 
 
 
138 aa  41.6  0.004  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2142  OsmC family protein  26.42 
 
 
129 aa  40.4  0.008  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2694  OsmC-like protein  25 
 
 
406 aa  40.4  0.009  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0732  OsmC family protein  35.29 
 
 
137 aa  40  0.009  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.560509  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5976  OsmC family protein  21.28 
 
 
130 aa  40  0.01  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>