153 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rmet_3616 on replicon NC_007974
Organism: Cupriavidus metallidurans CH34



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007974  Rmet_3616  osmotically inducible protein  100 
 
 		 129 aa  264  2.9999999999999995e-70  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000818818  normal  1 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5556  OsmC-like protein  59.23 
 
 		 130 aa  159  1e-38  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  hitchhiker  0.0000078778  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1917  OsmC family protein  47.41 
 
 		 130 aa  109  1.0000000000000001e-23  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.591016  normal  0.655521 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4533  OsmC-like protein  45.69 
 
 		 130 aa  104  4e-22  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.257374 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1301  OsmC family protein  44.83 
 
 		 130 aa  102  1e-21  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.0499071 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0908  OsmC-like protein  44.83 
 
 		 130 aa  103  1e-21  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1368  OsmC family protein  44.83 
 
 		 130 aa  103  1e-21  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.0210899 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1390  OsmC family protein  44.83 
 
 		 130 aa  103  1e-21  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.51882  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1267  OsmC family protein  43.48 
 
 		 130 aa  102  2e-21  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc0376  hypothetical protein  44.35 
 
 		 134 aa  100  5e-21  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0232  OsmC family protein  46.67 
 
 		 134 aa  99  2e-20  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0251  OsmC family protein  45.71 
 
 		 134 aa  98.2  4e-20  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.798103  normal  0.164531 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1856  OsmC family protein  44.14 
 
 		 129 aa  97.4  6e-20  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.610023  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2484  OsmC family protein  47.52 
 
 		 133 aa  96.3  1e-19  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  0.092178 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1950  OsmC family protein  42.86 
 
 		 132 aa  92.8  1e-18  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.378128  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3145  redox protein regulator of disulfide bond formation, OsmC-like  41.96 
 
 		 132 aa  91.7  3e-18  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.102127 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7018  OsmC family protein  41.46 
 
 		 412 aa  90.5  7e-18  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00716876 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1403  OsmC family protein  41.07 
 
 		 132 aa  90.5  7e-18  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0655694  normal  0.111545 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1595  OsmC family protein  44.44 
 
 		 134 aa  89.7  1e-17  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2279  OsmC family protein  44.44 
 
 		 155 aa  89.4  2e-17  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.0377998  normal  0.182149 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0921  OsmC family protein  45.79 
 
 		 136 aa  87.8  5e-17  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.418667  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4769  OsmC family protein  35.94 
 
 		 153 aa  86.7  9e-17  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  hitchhiker  0.00807264  hitchhiker  0.00049584 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1628  OsmC-like protein  43.3 
 
 		 138 aa  85.1  3e-16  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0181271 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4175  hypothetical protein  38.26 
 
 		 135 aa  84.7  3e-16  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.214068  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_48750  hypothetical protein  36.52 
 
 		 135 aa  83.6  8e-16  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000274485 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1082  OsmC-like family protein  38.66 
 
 		 141 aa  82.8  0.000000000000001  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.0521945  normal  0.207247 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3965  OsmC family protein  43.01 
 
 		 132 aa  83.2  0.000000000000001  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0979  OsmC family protein  38.32 
 
 		 418 aa  81.3  0.000000000000004  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2717  OsmC-like protein  43.62 
 
 		 135 aa  80.9  0.000000000000005  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00712413 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2280  OsmC-like protein  38.84 
 
 		 406 aa  80.5  0.000000000000007  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  0.423404 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6635  OsmC family protein  39.64 
 
 		 411 aa  80.1  0.00000000000001  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.659004  hitchhiker  0.00000360166 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3762  OsmC family protein  41.58 
 
 		 410 aa  78.6  0.00000000000002  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1440  OsmC family protein  34.55 
 
 		 142 aa  79  0.00000000000002  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0732  OsmC family protein  40.71 
 
 		 137 aa  77.8  0.00000000000004  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.560509  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3655  OsmC family protein  40.59 
 
 		 410 aa  77.4  0.00000000000007  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1840  hypothetical protein  36.36 
 
 		 405 aa  77  0.00000000000008  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  0.949047 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1930  OsmC family protein  39.64 
 
 		 407 aa  76.3  0.0000000000001  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.0101124  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1835  OsmC-like protein  40.2 
 
 		 407 aa  75.5  0.0000000000002  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4103  OsmC family protein  35.29 
 
 		 402 aa  75.5  0.0000000000003  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.671514  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2873  hypothetical protein  39.05 
 
 		 405 aa  75.1  0.0000000000003  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.326467  normal  0.0265941 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_12698  hypothetical protein  36 
 
 		 405 aa  75.5  0.0000000000003  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2694  OsmC-like protein  37.14 
 
 		 406 aa  74.7  0.0000000000004  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_4048  OsmC family protein  36.07 
 
 		 415 aa  73.9  0.0000000000007  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  unclonable  0.0000134708  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3491  OsmC family protein  36.67 
 
 		 131 aa  73.6  0.0000000000008  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2898  OsmC-like protein  40 
 
 		 135 aa  72.8  0.000000000001  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.533642 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1673  OsmC-like protein  38.46 
 
 		 409 aa  72.4  0.000000000002  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1013  OsmC-like protein  31.3 
 
 		 423 aa  71.6  0.000000000003  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.325781  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1206  OsmC family protein  30.26 
 
 		 413 aa  71.6  0.000000000003  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.423514  n/a   
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5429  OsmC family protein  36.79 
 
 		 397 aa  71.2  0.000000000004  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3633  OsmC-like protein  38.61 
 
 		 406 aa  70.9  0.000000000005  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.525721 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1919  OsmC family protein  37.5 
 
 		 131 aa  70.1  0.000000000009  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.148561  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0049  OsmC family protein  34.86 
 
 		 406 aa  69.7  0.00000000001  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1832  OsmC-like protein  33.65 
 
 		 133 aa  68.2  0.00000000004  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1777  OsmC-like protein  35.05 
 
 		 410 aa  65.9  0.0000000002  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.0113862  normal  1 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0941  OsmC family protein  34.31 
 
 		 409 aa  64.3  0.0000000006  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.3755  normal  0.451532 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6443  OsmC family protein  32.67 
 
 		 408 aa  63.2  0.000000001  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.588479  normal  1 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5571  OsmC family protein  32.38 
 
 		 408 aa  63.2  0.000000001  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.0439292 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1923  OsmC-like protein  37 
 
 		 127 aa  62  0.000000002  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2658  OsmC family protein  35 
 
 		 133 aa  62  0.000000002  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.653298  normal  0.498397 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_6150  OsmC family protein  31.68 
 
 		 408 aa  61.6  0.000000003  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.773624  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0974  OsmC family protein  39.13 
 
 		 128 aa  59.7  0.00000001  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.637714  normal  0.331477 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0982  OsmC family protein  35.56 
 
 		 127 aa  57  0.00000008  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2297  OsmC-like protein  31.97 
 
 		 133 aa  56.2  0.0000001  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.922047  normal  0.948773 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1438  OsmC family protein  32.22 
 
 		 137 aa  56.2  0.0000001  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.139134 
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_1560  OsmC family protein  41.94 
 
 		 88 aa  54.3  0.0000006  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2193  OsmC family protein  33.63 
 
 		 129 aa  53.9  0.0000007  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.208378  normal  1 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1489  OsmC family protein  25.49 
 
 		 181 aa  53.5  0.0000009  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.172419  normal  1 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0042  OsmC family protein  33.04 
 
 		 142 aa  52.8  0.000002  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4564  OsmC-like protein  29.51 
 
 		 133 aa  52  0.000003  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3799  OsmC family protein  29.51 
 
 		 133 aa  52  0.000003  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.732158  normal  0.104892 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3725  OsmC family protein  29.51 
 
 		 133 aa  52  0.000003  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.196532 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_5525  OsmC family protein  29.91 
 
 		 133 aa  51.2  0.000004  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0351  OsmC family protein  28.7 
 
 		 134 aa  51.2  0.000005  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.999657  normal  0.881663 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3689  OsmC family protein  30.17 
 
 		 133 aa  50.4  0.000007  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.952273 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_4196  OsmC family protein  26.15 
 
 		 135 aa  50.4  0.000009  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0518  OsmC-like protein superfamily protein  28.7 
 
 		 153 aa  49.7  0.00001  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4937  OsmC family protein  31.11 
 
 		 133 aa  49.7  0.00001  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.659641 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0949  hydrolase  28.7 
 
 		 133 aa  49.3  0.00002  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_4072  hypothetical protein  25.81 
 
 		 134 aa  49.3  0.00002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.0853904  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0240  hypothetical protein  28.7 
 
 		 133 aa  48.9  0.00003  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_1423  hypothetical protein  28.7 
 
 		 133 aa  48.9  0.00003  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2657  putative hydrolase  28.7 
 
 		 133 aa  48.9  0.00003  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2518  hypothetical protein  28.7 
 
 		 133 aa  48.9  0.00003  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.0608844  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_4221  OsmC family protein  25 
 
 		 135 aa  48.5  0.00003  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.741744  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_17941  hypothetical protein  34.29 
 
 		 122 aa  47  0.00009  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  0.758447  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2710  hypothetical protein  26.97 
 
 		 731 aa  45.8  0.0002  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.579153 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1130  hypothetical protein  23.53 
 
 		 135 aa  45.8  0.0002  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  0.362808 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1072  OsmC family protein  33.96 
 
 		 135 aa  45.8  0.0002  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.107078  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1603  OsmC family protein  28.44 
 
 		 142 aa  45.1  0.0003  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000000485336 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_0937  redox protein  33.33 
 
 		 122 aa  45.1  0.0003  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  0.393719  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0824  hypothetical protein  25.84 
 
 		 728 aa  45.1  0.0003  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.0307116  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4026  OsmC family protein  26.32 
 
 		 138 aa  45.1  0.0003  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_3179  OsmC family protein  28 
 
 		 159 aa  45.1  0.0003  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3321  hypothetical protein  26.97 
 
 		 742 aa  44.7  0.0004  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0632  hypothetical protein  26.97 
 
 		 742 aa  44.7  0.0004  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3489  hypothetical protein  26.97 
 
 		 742 aa  44.7  0.0004  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1001  OsmC family protein  26.74 
 
 		 135 aa  44.7  0.0004  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0361  OsmC family protein  29.91 
 
 		 140 aa  45.1  0.0004  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3343  hypothetical protein  26.97 
 
 		 728 aa  44.7  0.0004  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  0.987058 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3928  hypothetical protein  26.97 
 
 		 728 aa  44.7  0.0004  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>