81 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Pnec_1560 on replicon NC_010531
Organism: Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010531  Pnec_1560  OsmC family protein  100 
 
 		 88 aa  184  3e-46  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1856  OsmC family protein  79.07 
 
 		 129 aa  146  9e-35  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.610023  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0049  OsmC family protein  45.45 
 
 		 406 aa  77  0.00000000000007  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7018  OsmC family protein  46.75 
 
 		 412 aa  72  0.000000000002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00716876 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1440  OsmC family protein  45.45 
 
 		 142 aa  68.9  0.00000000002  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0941  OsmC family protein  47.89 
 
 		 409 aa  68.9  0.00000000002  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.3755  normal  0.451532 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2717  OsmC-like protein  44.87 
 
 		 135 aa  69.3  0.00000000002  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00712413 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1835  OsmC-like protein  38.46 
 
 		 407 aa  69.3  0.00000000002  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2873  hypothetical protein  42.31 
 
 		 405 aa  65.9  0.0000000002  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.326467  normal  0.0265941 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2694  OsmC-like protein  42.31 
 
 		 406 aa  66.2  0.0000000002  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1930  OsmC family protein  37.66 
 
 		 407 aa  65.5  0.0000000003  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.0101124  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2280  OsmC-like protein  42.31 
 
 		 406 aa  63.9  0.0000000006  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  0.423404 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0979  OsmC family protein  47.54 
 
 		 418 aa  63.5  0.0000000009  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5571  OsmC family protein  43.66 
 
 		 408 aa  63.5  0.000000001  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.0439292 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4175  hypothetical protein  42.86 
 
 		 135 aa  61.2  0.000000005  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.214068  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3633  OsmC-like protein  34.62 
 
 		 406 aa  60.8  0.000000006  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.525721 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_4048  OsmC family protein  40.85 
 
 		 415 aa  60.1  0.00000001  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  unclonable  0.0000134708  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0732  OsmC family protein  39.47 
 
 		 137 aa  60.1  0.00000001  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.560509  normal  1 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6443  OsmC family protein  46.27 
 
 		 408 aa  59.7  0.00000001  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.588479  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_48750  hypothetical protein  41.89 
 
 		 135 aa  59.3  0.00000002  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000274485 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3762  OsmC family protein  35.44 
 
 		 410 aa  58.9  0.00000002  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4769  OsmC family protein  42.86 
 
 		 153 aa  58.5  0.00000003  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  hitchhiker  0.00807264  hitchhiker  0.00049584 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_6150  OsmC family protein  41.67 
 
 		 408 aa  57.8  0.00000004  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.773624  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1673  OsmC-like protein  35 
 
 		 409 aa  57.8  0.00000005  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4103  OsmC family protein  44.44 
 
 		 402 aa  57.4  0.00000007  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.671514  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1628  OsmC-like protein  42.62 
 
 		 138 aa  56.2  0.0000002  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0181271 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1206  OsmC family protein  36.71 
 
 		 413 aa  56.2  0.0000002  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.423514  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2484  OsmC family protein  38.57 
 
 		 133 aa  55.8  0.0000002  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  0.092178 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3655  OsmC family protein  37.68 
 
 		 410 aa  55.8  0.0000002  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1950  OsmC family protein  37.5 
 
 		 132 aa  55.1  0.0000003  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.378128  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1082  OsmC-like family protein  43.75 
 
 		 141 aa  54.7  0.0000004  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.0521945  normal  0.207247 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1403  OsmC family protein  40 
 
 		 132 aa  54.7  0.0000005  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0655694  normal  0.111545 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_3616  osmotically inducible protein  41.94 
 
 		 129 aa  54.3  0.0000006  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000818818  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1595  OsmC family protein  35.38 
 
 		 134 aa  53.9  0.0000007  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3145  redox protein regulator of disulfide bond formation, OsmC-like  40 
 
 		 132 aa  53.9  0.0000007  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.102127 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5429  OsmC family protein  46.43 
 
 		 397 aa  53.9  0.0000007  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1777  OsmC-like protein  42.65 
 
 		 410 aa  53.5  0.0000009  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.0113862  normal  1 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1013  OsmC-like protein  45.76 
 
 		 423 aa  52.8  0.000001  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.325781  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3491  OsmC family protein  41.07 
 
 		 131 aa  53.1  0.000001  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2279  OsmC family protein  35.38 
 
 		 155 aa  52.4  0.000002  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.0377998  normal  0.182149 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0974  OsmC family protein  40.58 
 
 		 128 aa  52.4  0.000002  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.637714  normal  0.331477 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3965  OsmC family protein  46 
 
 		 132 aa  51.6  0.000003  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1923  OsmC-like protein  44.23 
 
 		 127 aa  51.6  0.000004  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5556  OsmC-like protein  47.92 
 
 		 130 aa  51.2  0.000005  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  hitchhiker  0.0000078778  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6635  OsmC family protein  38.57 
 
 		 411 aa  50.4  0.000008  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.659004  hitchhiker  0.00000360166 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1438  OsmC family protein  31.58 
 
 		 137 aa  50.1  0.00001  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.139134 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0982  OsmC family protein  44.44 
 
 		 127 aa  49.7  0.00001  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1832  OsmC-like protein  36.36 
 
 		 133 aa  49.7  0.00001  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2898  OsmC-like protein  38.57 
 
 		 135 aa  50.1  0.00001  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.533642 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0921  OsmC family protein  41.43 
 
 		 136 aa  50.1  0.00001  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.418667  normal  1 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_12698  hypothetical protein  34.38 
 
 		 405 aa  49.3  0.00002  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2142  OsmC family protein  39.68 
 
 		 129 aa  49.3  0.00002  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_5525  OsmC family protein  45.1 
 
 		 133 aa  48.9  0.00003  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3689  OsmC family protein  45.1 
 
 		 133 aa  48.5  0.00003  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.952273 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1840  hypothetical protein  37.18 
 
 		 405 aa  48.1  0.00004  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  0.949047 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3799  OsmC family protein  43.14 
 
 		 133 aa  47.8  0.00005  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.732158  normal  0.104892 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1919  OsmC family protein  44.19 
 
 		 131 aa  47.8  0.00005  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.148561  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4564  OsmC-like protein  43.14 
 
 		 133 aa  47.8  0.00005  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3725  OsmC family protein  43.14 
 
 		 133 aa  47.8  0.00005  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.196532 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2297  OsmC-like protein  43.14 
 
 		 133 aa  47.8  0.00006  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.922047  normal  0.948773 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4937  OsmC family protein  40.82 
 
 		 133 aa  45.1  0.0003  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.659641 
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1619  hypothetical protein  42.86 
 
 		 129 aa  44.7  0.0004  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0276  hypothetical protein  42.86 
 
 		 129 aa  44.7  0.0004  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2518  hypothetical protein  42.86 
 
 		 133 aa  44.7  0.0005  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.0608844  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc0376  hypothetical protein  41.86 
 
 		 134 aa  44.7  0.0005  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0240  hypothetical protein  42.86 
 
 		 133 aa  44.7  0.0005  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0949  hydrolase  42.86 
 
 		 133 aa  44.7  0.0005  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0251  OsmC family protein  32.89 
 
 		 134 aa  44.7  0.0005  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.798103  normal  0.164531 
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_1423  hypothetical protein  42.86 
 
 		 133 aa  44.7  0.0005  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0232  OsmC family protein  32.89 
 
 		 134 aa  44.7  0.0005  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2657  putative hydrolase  42.86 
 
 		 133 aa  44.7  0.0005  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2193  OsmC family protein  40.74 
 
 		 129 aa  43.9  0.0008  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.208378  normal  1 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1436  OsmC family protein  33.87 
 
 		 134 aa  43.5  0.0008  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1390  OsmC family protein  34.67 
 
 		 130 aa  43.1  0.001  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.51882  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0908  OsmC-like protein  34.67 
 
 		 130 aa  43.1  0.001  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1267  OsmC family protein  43.14 
 
 		 130 aa  42.4  0.002  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0518  OsmC-like protein superfamily protein  41.67 
 
 		 153 aa  42.4  0.002  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1368  OsmC family protein  41.07 
 
 		 130 aa  42.7  0.002  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.0210899 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4533  OsmC-like protein  44.44 
 
 		 130 aa  40.8  0.006  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.257374 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1301  OsmC family protein  41.18 
 
 		 130 aa  40.4  0.008  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.0499071 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0342  OsmC family protein  34.78 
 
 		 135 aa  40  0.01  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  0.720795  normal  0.012657 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>