91 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cpha266_1001 on replicon NC_008639
Organism: Chlorobium phaeobacteroides DSM 266



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008639  Cpha266_1001  OsmC family protein  100 
 
 
135 aa  278  1e-74  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1429  OsmC family protein  80.45 
 
 
135 aa  228  3e-59  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.640592  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1130  hypothetical protein  80.77 
 
 
135 aa  226  6e-59  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  normal  0.362808 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0887  hypothetical protein  79.07 
 
 
132 aa  223  8e-58  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.873349  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1341  OsmC family protein  77.27 
 
 
133 aa  216  7.999999999999999e-56  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1251  OsmC family protein  71.21 
 
 
134 aa  204  5e-52  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.106129  normal  0.568503 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1489  OsmC family protein  72.66 
 
 
181 aa  202  1e-51  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.172419  normal 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_4221  OsmC family protein  56.06 
 
 
135 aa  150  4e-36  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.741744  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0351  OsmC family protein  54.48 
 
 
134 aa  150  5e-36  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.999657  normal  0.881663 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_4196  OsmC family protein  56.06 
 
 
135 aa  150  7e-36  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_4072  hypothetical protein  54.55 
 
 
134 aa  147  3e-35  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.0853904  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0382  hypothetical protein  52.67 
 
 
134 aa  144  6e-34  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3476  OsmC family protein  50.79 
 
 
135 aa  129  2.0000000000000002e-29  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  0.00107457  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_3179  OsmC family protein  50 
 
 
159 aa  111  4.0000000000000004e-24  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0034  hypothetical protein  36.72 
 
 
735 aa  99.4  1e-20  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3489  hypothetical protein  36.72 
 
 
742 aa  98.2  3e-20  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0632  hypothetical protein  36.72 
 
 
742 aa  98.2  3e-20  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3321  hypothetical protein  36.72 
 
 
742 aa  98.2  3e-20  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3787  hypothetical protein  36.72 
 
 
729 aa  97.4  5e-20  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.859391  normal 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0643  hypothetical protein  36.72 
 
 
729 aa  97.4  5e-20  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3664  hypothetical protein  36.72 
 
 
729 aa  97.4  6e-20  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3599  protein of unknown function DUF181  36.72 
 
 
729 aa  97.4  6e-20  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3199  hypothetical protein  36.72 
 
 
728 aa  97.1  7e-20  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1146  hypothetical protein  37.4 
 
 
732 aa  96.3  1e-19  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.202327  normal  0.214349 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3569  hypothetical protein  35.94 
 
 
727 aa  95.5  2e-19  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3343  hypothetical protein  36.72 
 
 
728 aa  95.1  3e-19  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal  0.987058 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2297  hypothetical protein  38.28 
 
 
728 aa  94.7  4e-19  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal  0.806493 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2832  hypothetical protein  37.4 
 
 
728 aa  94.4  4e-19  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.134905  normal 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3928  hypothetical protein  35.16 
 
 
728 aa  94.4  4e-19  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_28020  hypothetical protein  36.8 
 
 
734 aa  94  6e-19  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.458293  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3033  hypothetical protein  35.94 
 
 
728 aa  94  6e-19  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.431186  normal 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2174  hypothetical protein  37.8 
 
 
728 aa  93.6  7e-19  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_3620  hypothetical protein  37.5 
 
 
728 aa  93.6  8e-19  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2113  hypothetical protein  37.5 
 
 
728 aa  93.6  8e-19  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.20686  normal 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1756  hypothetical protein  35.38 
 
 
728 aa  93.6  8e-19  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3253  hypothetical protein  34.38 
 
 
728 aa  93.2  1e-18  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3211  hypothetical protein  35.16 
 
 
728 aa  92  2e-18  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.357431  normal 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0824  hypothetical protein  35.16 
 
 
728 aa  91.3  4e-18  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.0307116  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2710  hypothetical protein  36 
 
 
731 aa  91.3  5e-18  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal  0.579153 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3592  protein of unknown function DUF181  37.01 
 
 
734 aa  89.7  1e-17  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.0680194  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4822  hypothetical protein  36 
 
 
734 aa  89.4  1e-17  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  decreased coverage  0.000227003  normal  0.373155 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0738  hypothetical protein  32.81 
 
 
728 aa  89  2e-17  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3214  hypothetical protein  35.2 
 
 
734 aa  88.6  3e-17  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.668386  normal  0.254813 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_2073  hypothetical protein  35.94 
 
 
734 aa  85.5  2e-16  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0335  OsmC family protein  31.15 
 
 
127 aa  67.8  0.00000000004  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  0.252391  normal 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0361  OsmC family protein  24.22 
 
 
140 aa  65.1  0.0000000003  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2557  OsmC family protein  23.44 
 
 
138 aa  65.1  0.0000000003  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.00000559572  hitchhiker  0.00383779 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2348  OsmC family protein  26.02 
 
 
163 aa  64.7  0.0000000005  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.684792  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0541  OsmC family protein  27.87 
 
 
151 aa  60.5  0.000000007  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.489752  normal 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0908  OsmC-like protein  31.96 
 
 
130 aa  57.8  0.00000005  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1390  OsmC family protein  31.96 
 
 
130 aa  57.8  0.00000005  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.51882  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1368  OsmC family protein  31.96 
 
 
130 aa  57.4  0.00000006  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.0210899 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2484  OsmC family protein  27.1 
 
 
133 aa  57.4  0.00000007  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal  0.092178 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4617  OsmC family protein  32.76 
 
 
133 aa  56.2  0.0000001  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  normal  0.327663 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_4465  OsmC-like protein  27.27 
 
 
248 aa  56.6  0.0000001  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1267  OsmC family protein  30.93 
 
 
130 aa  53.9  0.0000007  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3081  OsmC-like protein  25.2 
 
 
134 aa  53.9  0.0000007  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.344842  normal 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1301  OsmC family protein  30.93 
 
 
130 aa  53.1  0.000001  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal  0.0499071 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1950  OsmC family protein  29.91 
 
 
132 aa  52.8  0.000002  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.378128  normal 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0251  OsmC family protein  28.71 
 
 
134 aa  52.4  0.000002  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.798103  normal  0.164531 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1917  OsmC family protein  31.87 
 
 
130 aa  52.4  0.000002  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.591016  normal  0.655521 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1613  OsmC family protein  31.03 
 
 
133 aa  52.8  0.000002  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0395  OsmC family protein  24.22 
 
 
138 aa  52  0.000003  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4533  OsmC-like protein  29.9 
 
 
130 aa  50.8  0.000006  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.257374 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0232  OsmC family protein  27.72 
 
 
134 aa  49.7  0.00001  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1628  OsmC-like protein  26.09 
 
 
138 aa  49.3  0.00002  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal  0.0181271 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1403  OsmC family protein  30.3 
 
 
132 aa  49.3  0.00002  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0655694  normal  0.111545 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0376  hypothetical protein  26.73 
 
 
134 aa  48.5  0.00003  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3145  redox protein regulator of disulfide bond formation, OsmC-like  28.28 
 
 
132 aa  48.1  0.00004  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.102127 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3965  OsmC family protein  21.74 
 
 
132 aa  47.8  0.00005  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1605  OsmC family protein  23.31 
 
 
161 aa  47.8  0.00006  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1531  OsmC family protein  36.71 
 
 
154 aa  46.6  0.0001  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0515  OsmC family protein  30.09 
 
 
134 aa  46.6  0.0001  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.0859672  normal  0.078618 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2898  OsmC-like protein  26.09 
 
 
135 aa  45.8  0.0002  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal  0.533642 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1919  OsmC family protein  26 
 
 
131 aa  45.8  0.0002  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.148561  normal 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3682  hypothetical protein  29.03 
 
 
125 aa  45.4  0.0003  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_17941  hypothetical protein  32.32 
 
 
122 aa  44.7  0.0004  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  0.758447  normal 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_3616  osmotically inducible protein  26.74 
 
 
129 aa  44.7  0.0004  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000818818  normal 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_0937  redox protein  31.31 
 
 
122 aa  42.7  0.002  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  0.393719  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_48750  hypothetical protein  26.44 
 
 
135 aa  42.4  0.002  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000274485 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0339  OsmC family protein  36.54 
 
 
145 aa  41.2  0.004  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.53983  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3689  OsmC family protein  24.47 
 
 
133 aa  41.6  0.004  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal  0.952273 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4103  OsmC family protein  25.74 
 
 
402 aa  41.2  0.004  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.671514  normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1930  OsmC family protein  23.08 
 
 
407 aa  41.2  0.005  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.0101124  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1835  OsmC-like protein  26.32 
 
 
407 aa  41.2  0.005  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_5525  OsmC family protein  24.47 
 
 
133 aa  41.2  0.005  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1673  OsmC-like protein  27.59 
 
 
409 aa  40.8  0.007  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0342  OsmC family protein  25.83 
 
 
135 aa  40.4  0.007  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  0.720795  normal  0.012657 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0974  OsmC family protein  30.51 
 
 
128 aa  40.4  0.008  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.637714  normal  0.331477 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1436  OsmC family protein  24.73 
 
 
134 aa  40.4  0.008  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0921  OsmC family protein  21.43 
 
 
136 aa  40  0.01  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.418667  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>