97 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Lreu_0042 on replicon NC_009513
Organism: Lactobacillus reuteri DSM 20016



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009513  Lreu_0042  OsmC family protein  100 
 
 
142 aa  295  2e-79  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0235  OsmC family protein  37.78 
 
 
147 aa  103  1e-21  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1892  OsmC-like protein  37.31 
 
 
148 aa  90.5  7e-18  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_13840  predicted redox protein, regulator of disulfide bond formation  30.88 
 
 
145 aa  74.3  0.0000000000006  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0443  OsmC-like protein  32.59 
 
 
176 aa  73.2  0.000000000001  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.16081  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE1727  hypothetical protein  36.07 
 
 
138 aa  72  0.000000000002  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2354  OsmC-like protein  30.95 
 
 
170 aa  71.6  0.000000000004  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.572746  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2505  OsmC family protein  32.2 
 
 
147 aa  71.2  0.000000000004  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3526  OsmC family protein  35.77 
 
 
177 aa  70.9  0.000000000005  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.7407  normal  0.298467 
 
 
-
 
NC_002967  TDE1270  hypothetical protein  33.62 
 
 
144 aa  67.4  0.00000000006  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  hitchhiker  0.00225413  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_04790  OsmC family protein  30.6 
 
 
144 aa  65.5  0.0000000003  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2794  OsmC family protein  29.46 
 
 
142 aa  64.3  0.0000000005  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1143  OsmC family protein  29.6 
 
 
142 aa  60.8  0.000000006  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  decreased coverage  0.00000523467  normal 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1075  OsmC family protein  29.6 
 
 
142 aa  60.5  0.000000007  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1071  OsmC family protein  29.6 
 
 
142 aa  60.5  0.000000007  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.0000000601559  normal 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0339  OsmC family protein  29.66 
 
 
145 aa  60.1  0.00000001  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.53983  n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0586  OsmC family protein  29.2 
 
 
179 aa  57.4  0.00000006  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  0.128993  normal  0.0133234 
 
 
-
 
NC_004347  SO_3495  hypothetical protein  28.1 
 
 
142 aa  57  0.00000008  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1670  OsmC family protein  27.12 
 
 
156 aa  57  0.00000008  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.0539264  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0969  OsmC family protein  34.26 
 
 
182 aa  57  0.00000008  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  normal  0.298439 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2873  hypothetical protein  29.69 
 
 
405 aa  56.6  0.0000001  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.326467  normal  0.0265941 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2570  OsmC family protein  31.09 
 
 
187 aa  54.7  0.0000005  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4769  OsmC family protein  32.09 
 
 
153 aa  54.7  0.0000005  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  hitchhiker  0.00807264  hitchhiker  0.00049584 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1072  OsmC family protein  28.91 
 
 
135 aa  53.9  0.0000008  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.107078  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0982  OsmC family protein  30.88 
 
 
127 aa  53.1  0.000001  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_3616  osmotically inducible protein  33.04 
 
 
129 aa  52.8  0.000002  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000818818  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7018  OsmC family protein  32.09 
 
 
412 aa  52.4  0.000002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00716876 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0049  OsmC family protein  29.71 
 
 
406 aa  52  0.000002  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3655  OsmC family protein  27.34 
 
 
410 aa  52.4  0.000002  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1840  hypothetical protein  32.8 
 
 
405 aa  52  0.000003  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal  0.949047 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1403  OsmC family protein  31.85 
 
 
132 aa  52  0.000003  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0655694  normal  0.111545 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3762  OsmC family protein  26.56 
 
 
410 aa  51.2  0.000005  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3145  redox protein regulator of disulfide bond formation, OsmC-like  31.06 
 
 
132 aa  50.8  0.000006  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.102127 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1348  OsmC family protein  25.38 
 
 
151 aa  49.7  0.00001  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3007  OsmC family protein  25.4 
 
 
146 aa  50.1  0.00001  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1950  OsmC family protein  33.59 
 
 
132 aa  50.1  0.00001  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.378128  normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0921  OsmC family protein  29.69 
 
 
136 aa  48.5  0.00003  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.418667  normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_48750  hypothetical protein  26.72 
 
 
135 aa  48.9  0.00003  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000274485 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_2212  OsmC family protein  34.48 
 
 
159 aa  48.1  0.00004  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4175  hypothetical protein  26.72 
 
 
135 aa  48.1  0.00004  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.214068  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1301  OsmC family protein  32.69 
 
 
130 aa  47  0.00008  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal  0.0499071 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3413  OsmC family protein  30.36 
 
 
171 aa  47  0.00008  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_4048  OsmC family protein  26.12 
 
 
415 aa  47  0.00009  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  unclonable  0.0000134708  normal 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1267  OsmC family protein  32.69 
 
 
130 aa  46.6  0.0001  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4533  OsmC-like protein  32.69 
 
 
130 aa  45.4  0.0002  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.257374 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2193  OsmC family protein  25.9 
 
 
129 aa  45.8  0.0002  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.208378  normal 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2694  OsmC-like protein  30.56 
 
 
406 aa  45.4  0.0002  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1835  OsmC-like protein  31.53 
 
 
407 aa  45.8  0.0002  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2100  OsmC family protein  27.5 
 
 
185 aa  45.4  0.0002  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1390  OsmC family protein  31.73 
 
 
130 aa  45.1  0.0003  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.51882  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1923  OsmC-like protein  27.93 
 
 
127 aa  45.4  0.0003  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1440  OsmC family protein  27.42 
 
 
142 aa  45.1  0.0003  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3633  OsmC-like protein  26.02 
 
 
406 aa  45.4  0.0003  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal  0.525721 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0908  OsmC-like protein  31.73 
 
 
130 aa  45.1  0.0003  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1368  OsmC family protein  31.73 
 
 
130 aa  45.1  0.0003  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.0210899 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4668  OsmC family protein  27.35 
 
 
183 aa  44.7  0.0004  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.35857  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6635  OsmC family protein  32.32 
 
 
411 aa  44.7  0.0004  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.659004  hitchhiker  0.00000360166 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1013  OsmC-like protein  28.97 
 
 
423 aa  45.1  0.0004  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.325781  normal 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3485  OsmC family protein  30.56 
 
 
185 aa  44.7  0.0004  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0897  OsmC family protein  28.23 
 
 
145 aa  44.7  0.0005  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.669017  normal 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1777  OsmC-like protein  27.27 
 
 
410 aa  44.3  0.0005  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.0113862  normal 
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0623  hypothetical protein  30.28 
 
 
176 aa  44.3  0.0006  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  decreased coverage  0.0005983  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2694  OsmC family protein  30.43 
 
 
130 aa  44.3  0.0006  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.0448513  normal  0.13145 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1310  OsmC family protein  25.64 
 
 
183 aa  43.9  0.0008  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.47097  normal 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0335  OsmC family protein  32.22 
 
 
127 aa  43.5  0.001  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  0.252391  normal 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2142  OsmC family protein  28.8 
 
 
129 aa  43.5  0.001  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0039  OsmC-like protein  29.73 
 
 
179 aa  43.1  0.001  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3491  OsmC family protein  23.68 
 
 
131 aa  43.1  0.001  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1026  OsmC family protein  28.57 
 
 
206 aa  43.5  0.001  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1151  OsmC family protein  27.35 
 
 
183 aa  43.5  0.001  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.824502  normal  0.359642 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1930  OsmC family protein  29.01 
 
 
407 aa  43.1  0.001  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.0101124  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0974  OsmC family protein  30.25 
 
 
128 aa  43.5  0.001  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.637714  normal  0.331477 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1436  OsmC family protein  32.56 
 
 
134 aa  42.4  0.002  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1673  OsmC-like protein  28.47 
 
 
409 aa  42.7  0.002  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1919  OsmC family protein  29.36 
 
 
131 aa  42.4  0.002  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.148561  normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3965  OsmC family protein  26.15 
 
 
132 aa  42.7  0.002  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2612  OsmC family protein  28.97 
 
 
208 aa  42.7  0.002  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal  0.43183 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3793  OsmC family protein  28.7 
 
 
185 aa  42.7  0.002  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal  0.242728 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1917  OsmC family protein  32.38 
 
 
130 aa  42.7  0.002  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.591016  normal  0.655521 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5571  OsmC family protein  26.15 
 
 
408 aa  41.6  0.003  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal  0.0439292 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5418  hypothetical protein  29.36 
 
 
180 aa  42  0.003  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2280  OsmC-like protein  29.52 
 
 
406 aa  42  0.003  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal  0.423404 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5247  OsmC family protein  26.67 
 
 
187 aa  42  0.003  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal  0.402263 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_4241  OsmC family protein  27.19 
 
 
202 aa  41.6  0.004  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0304  hypothetical protein  27.1 
 
 
190 aa  41.2  0.004  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal  0.119499 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0441  OsmC family protein  28.07 
 
 
189 aa  41.6  0.004  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.488218  normal  0.432032 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6241  OsmC family protein  26.47 
 
 
182 aa  41.2  0.005  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0196837  normal  0.733472 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2279  OsmC family protein  28.72 
 
 
155 aa  41.2  0.005  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.0377998  normal  0.182149 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5957  OsmC family protein  28.57 
 
 
190 aa  40.8  0.006  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1595  OsmC family protein  28.72 
 
 
134 aa  40.8  0.006  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2488  OsmC family protein  28.57 
 
 
172 aa  40.4  0.008  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.0230337  normal  0.160295 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2175  OsmC-like protein  24.79 
 
 
185 aa  40.4  0.008  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.416909  normal 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2836  OsmC family protein  25.22 
 
 
177 aa  40.4  0.008  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3867  OsmC family protein  28.7 
 
 
185 aa  40.4  0.008  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal  0.0319528 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1082  OsmC-like family protein  27.52 
 
 
141 aa  40.4  0.008  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.0521945  normal  0.207247 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1856  OsmC family protein  32.26 
 
 
129 aa  40.4  0.009  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.610023  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_12698  hypothetical protein  25.66 
 
 
405 aa  40  0.01  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>