44 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene SO_3495 on replicon NC_004347
Organism: Shewanella oneidensis MR-1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_004347  SO_3495  hypothetical protein  100 
 
 		 142 aa  297  3e-80  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1143  OsmC family protein  95.07 
 
 		 142 aa  281  2.0000000000000002e-75  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  decreased coverage  0.00000523467  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1075  OsmC family protein  94.37 
 
 		 142 aa  280  6.000000000000001e-75  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1071  OsmC family protein  94.37 
 
 		 142 aa  280  6.000000000000001e-75  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.0000000601559  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2794  OsmC family protein  82.98 
 
 		 142 aa  249  9.000000000000001e-66  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3007  OsmC family protein  65.97 
 
 		 146 aa  204  4e-52  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1670  OsmC family protein  32.37 
 
 		 156 aa  90.5  8e-18  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.0539264  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_04790  OsmC family protein  29.37 
 
 		 144 aa  73.9  0.0000000000006  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0235  OsmC family protein  31.01 
 
 		 147 aa  70.9  0.000000000006  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0897  OsmC family protein  26.92 
 
 		 145 aa  70.1  0.000000000009  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.669017  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2788  hypothetical protein  33.33 
 
 		 186 aa  67  0.00000000008  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1644  OsmC family protein  29.03 
 
 		 193 aa  62.8  0.000000002  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011885  Cyan7425_0190  OsmC family protein  32.69 
 
 		 189 aa  59.3  0.00000002  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  n/a    normal  0.155362 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3526  OsmC family protein  27.94 
 
 		 177 aa  58.5  0.00000003  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.7407  normal  0.298467 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1892  OsmC-like protein  26.87 
 
 		 148 aa  58.2  0.00000004  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0042  OsmC family protein  28.1 
 
 		 142 aa  57  0.00000008  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2505  OsmC family protein  28.93 
 
 		 147 aa  55.5  0.0000002  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0441  OsmC family protein  27.59 
 
 		 189 aa  56.2  0.0000002  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.488218  normal  0.432032 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0339  OsmC family protein  26.87 
 
 		 145 aa  55.1  0.0000003  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.53983  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6241  OsmC family protein  30.83 
 
 		 182 aa  54.7  0.0000004  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0196837  normal  0.733472 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2570  OsmC family protein  29.59 
 
 		 187 aa  53.1  0.000001  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE1727  hypothetical protein  25 
 
 		 138 aa  53.5  0.000001  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2354  OsmC-like protein  22.38 
 
 		 170 aa  50.8  0.000006  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.572746  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1628  OsmC-like protein  30.37 
 
 		 138 aa  50.4  0.000008  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0181271 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1058  OsmC family protein  26.77 
 
 		 200 aa  49.3  0.00002  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.333829 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5247  OsmC family protein  25.41 
 
 		 187 aa  49.3  0.00002  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.402263 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_13840  predicted redox protein, regulator of disulfide bond formation  24.81 
 
 		 145 aa  49.3  0.00002  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1904  OsmC family protein  23.81 
 
 		 193 aa  49.3  0.00002  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.576095  unclonable  0.00000937306 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3413  OsmC family protein  25.42 
 
 		 171 aa  43.9  0.0007  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0361  OsmC family protein  26.32 
 
 		 140 aa  43.5  0.001  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2488  hypothetical protein  26 
 
 		 202 aa  43.5  0.001  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1390  OsmC family protein  28.97 
 
 		 130 aa  42.7  0.002  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.51882  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0908  OsmC-like protein  28.97 
 
 		 130 aa  42.7  0.002  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1368  OsmC family protein  28.97 
 
 		 130 aa  42.7  0.002  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.0210899 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2557  OsmC family protein  26.72 
 
 		 138 aa  42.4  0.002  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.00000559572  hitchhiker  0.00383779 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2898  OsmC-like protein  28.44 
 
 		 135 aa  42.4  0.002  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.533642 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_2212  OsmC family protein  21.74 
 
 		 159 aa  42.4  0.002  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0443  OsmC-like protein  23.44 
 
 		 176 aa  42.7  0.002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.16081  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1301  OsmC family protein  28.04 
 
 		 130 aa  42  0.003  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.0499071 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2612  OsmC family protein  23.21 
 
 		 208 aa  42  0.003  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.43183 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1267  OsmC family protein  28.04 
 
 		 130 aa  41.6  0.004  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0921  OsmC family protein  27.52 
 
 		 136 aa  40.8  0.006  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.418667  normal  1 
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0623  hypothetical protein  24.55 
 
 		 176 aa  40.8  0.007  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  decreased coverage  0.0005983  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0969  OsmC family protein  25 
 
 		 182 aa  40.4  0.007  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  0.298439 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>