109 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ppha_1341 on replicon NC_011060
Organism: Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011060  Ppha_1341  OsmC family protein  100 
 
 		 133 aa  271  2.0000000000000002e-72  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1001  OsmC family protein  77.27 
 
 		 135 aa  216  7.999999999999999e-56  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0887  hypothetical protein  75.57 
 
 		 132 aa  209  1e-53  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.873349  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1429  OsmC family protein  73.48 
 
 		 135 aa  203  5e-52  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.640592  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1130  hypothetical protein  74.62 
 
 		 135 aa  202  9e-52  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  0.362808 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1251  OsmC family protein  70.99 
 
 		 134 aa  194  2.0000000000000003e-49  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.106129  normal  0.568503 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1489  OsmC family protein  65.38 
 
 		 181 aa  184  2e-46  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.172419  normal  1 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0351  OsmC family protein  51.52 
 
 		 134 aa  143  6e-34  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.999657  normal  0.881663 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_4221  OsmC family protein  53.03 
 
 		 135 aa  142  2e-33  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.741744  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_4072  hypothetical protein  53.03 
 
 		 134 aa  141  4e-33  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.0853904  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_4196  OsmC family protein  52.27 
 
 		 135 aa  140  6e-33  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0382  hypothetical protein  47.33 
 
 		 134 aa  137  7e-32  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3476  OsmC family protein  50 
 
 		 135 aa  125  1.0000000000000001e-28  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  0.00107457  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0034  hypothetical protein  39.06 
 
 		 735 aa  106  1e-22  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3321  hypothetical protein  38.28 
 
 		 742 aa  105  2e-22  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0632  hypothetical protein  38.28 
 
 		 742 aa  105  2e-22  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3489  hypothetical protein  38.28 
 
 		 742 aa  105  2e-22  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_3179  OsmC family protein  45.71 
 
 		 159 aa  105  3e-22  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3569  hypothetical protein  37.5 
 
 		 727 aa  104  4e-22  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0643  hypothetical protein  37.5 
 
 		 729 aa  104  4e-22  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3199  hypothetical protein  37.5 
 
 		 728 aa  104  4e-22  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3664  hypothetical protein  37.5 
 
 		 729 aa  104  4e-22  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3787  hypothetical protein  37.5 
 
 		 729 aa  104  4e-22  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.859391  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3599  protein of unknown function DUF181  37.5 
 
 		 729 aa  104  4e-22  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3343  hypothetical protein  37.5 
 
 		 728 aa  102  2e-21  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  0.987058 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3928  hypothetical protein  36.72 
 
 		 728 aa  102  2e-21  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1146  hypothetical protein  35.94 
 
 		 732 aa  101  4e-21  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.202327  normal  0.214349 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3033  hypothetical protein  36.72 
 
 		 728 aa  100  5e-21  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.431186  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2297  hypothetical protein  36.72 
 
 		 728 aa  100  5e-21  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.806493 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3253  hypothetical protein  35.94 
 
 		 728 aa  100  6e-21  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_28020  hypothetical protein  36.72 
 
 		 734 aa  100  7e-21  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.458293  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3211  hypothetical protein  36.72 
 
 		 728 aa  100  8e-21  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.357431  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2832  hypothetical protein  35.94 
 
 		 728 aa  100  8e-21  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.134905  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3620  hypothetical protein  35.94 
 
 		 728 aa  99.8  1e-20  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1756  hypothetical protein  37.21 
 
 		 728 aa  99.4  1e-20  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2710  hypothetical protein  36.72 
 
 		 731 aa  100  1e-20  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.579153 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2174  hypothetical protein  36.72 
 
 		 728 aa  99.8  1e-20  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2113  hypothetical protein  35.94 
 
 		 728 aa  99.8  1e-20  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.20686  normal  1 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0824  hypothetical protein  35.94 
 
 		 728 aa  98.2  3e-20  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.0307116  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4822  hypothetical protein  36.72 
 
 		 734 aa  98.6  3e-20  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  decreased coverage  0.000227003  normal  0.373155 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3592  protein of unknown function DUF181  35.94 
 
 		 734 aa  97.4  5e-20  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.0680194  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3214  hypothetical protein  35.94 
 
 		 734 aa  97.1  8e-20  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.668386  normal  0.254813 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0738  hypothetical protein  34.38 
 
 		 728 aa  96.3  1e-19  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_2073  hypothetical protein  35.16 
 
 		 734 aa  93.6  8e-19  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2348  OsmC family protein  28.21 
 
 		 163 aa  70.1  0.00000000001  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.684792  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2557  OsmC family protein  26.98 
 
 		 138 aa  67.4  0.00000000006  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.00000559572  hitchhiker  0.00383779 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0541  OsmC family protein  28.93 
 
 		 151 aa  65.9  0.0000000002  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.489752  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4617  OsmC family protein  31.67 
 
 		 133 aa  64.7  0.0000000004  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  0.327663 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0361  OsmC family protein  26.61 
 
 		 140 aa  63.5  0.0000000009  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1613  OsmC family protein  30.83 
 
 		 133 aa  62.4  0.000000002  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0335  OsmC family protein  29.31 
 
 		 127 aa  60.8  0.000000006  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  0.252391  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0908  OsmC-like protein  28.87 
 
 		 130 aa  57.8  0.00000004  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1390  OsmC family protein  28.87 
 
 		 130 aa  57.8  0.00000004  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.51882  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1368  OsmC family protein  28.87 
 
 		 130 aa  57.8  0.00000005  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.0210899 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_4465  OsmC-like protein  25.66 
 
 		 248 aa  57.4  0.00000007  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2484  OsmC family protein  26.17 
 
 		 133 aa  57  0.00000009  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  0.092178 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1628  OsmC-like protein  23.08 
 
 		 138 aa  55.5  0.0000002  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0181271 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3682  hypothetical protein  33.33 
 
 		 125 aa  55.1  0.0000003  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4533  OsmC-like protein  29.9 
 
 		 130 aa  55.1  0.0000003  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.257374 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3145  redox protein regulator of disulfide bond formation, OsmC-like  30.21 
 
 		 132 aa  54.3  0.0000005  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.102127 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1267  OsmC family protein  27.84 
 
 		 130 aa  54.3  0.0000005  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1301  OsmC family protein  27.84 
 
 		 130 aa  53.5  0.0000009  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.0499071 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0395  OsmC family protein  27.18 
 
 		 138 aa  52.8  0.000001  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2354  OsmC-like protein  28.46 
 
 		 170 aa  52.8  0.000001  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.572746  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1950  OsmC family protein  28.71 
 
 		 132 aa  52.8  0.000001  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.378128  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3081  OsmC-like protein  30.09 
 
 		 134 aa  52.8  0.000002  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.344842  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3965  OsmC family protein  22.77 
 
 		 132 aa  52.8  0.000002  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0251  OsmC family protein  26.8 
 
 		 134 aa  52.4  0.000002  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.798103  normal  0.164531 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1917  OsmC family protein  28.87 
 
 		 130 aa  50.8  0.000006  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.591016  normal  0.655521 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1403  OsmC family protein  28.12 
 
 		 132 aa  50.4  0.000008  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0655694  normal  0.111545 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2898  OsmC-like protein  26.73 
 
 		 135 aa  50.4  0.000009  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.533642 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0232  OsmC family protein  25.88 
 
 		 134 aa  50.4  0.000009  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_17941  hypothetical protein  32 
 
 		 122 aa  49.7  0.00001  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  0.758447  normal  1 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0235  OsmC family protein  26.92 
 
 		 147 aa  49.7  0.00001  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc0376  hypothetical protein  25.88 
 
 		 134 aa  49.3  0.00002  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1919  OsmC family protein  24.27 
 
 		 131 aa  49.3  0.00002  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.148561  normal  1 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0342  OsmC family protein  28.7 
 
 		 135 aa  48.9  0.00002  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  0.720795  normal  0.012657 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_0937  redox protein  31 
 
 		 122 aa  47.8  0.00005  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  0.393719  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0339  OsmC family protein  27.43 
 
 		 145 aa  46.2  0.0001  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.53983  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1440  OsmC family protein  32.1 
 
 		 142 aa  45.8  0.0002  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_4048  OsmC family protein  21.21 
 
 		 415 aa  45.4  0.0003  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  unclonable  0.0000134708  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3655  OsmC family protein  23.33 
 
 		 410 aa  44.7  0.0004  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_3616  osmotically inducible protein  24.51 
 
 		 129 aa  44.3  0.0005  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000818818  normal  1 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2505  OsmC family protein  33.33 
 
 		 147 aa  44.3  0.0006  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_10251  redox protein, regulator of disulfide bond formation  23.53 
 
 		 135 aa  43.1  0.001  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1930  OsmC family protein  21.24 
 
 		 407 aa  43.1  0.001  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.0101124  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3762  OsmC family protein  22.95 
 
 		 410 aa  43.5  0.001  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2717  OsmC-like protein  23.16 
 
 		 135 aa  42.4  0.002  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00712413 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_0946  putative redox protein  23.3 
 
 		 131 aa  42.7  0.002  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2951  OsmC-like protein  32.26 
 
 		 162 aa  42.4  0.002  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000581038 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1673  OsmC-like protein  29.63 
 
 		 409 aa  42.4  0.002  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1835  OsmC-like protein  22.32 
 
 		 407 aa  42.4  0.002  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008816  A9601_11251  putative stress-induced protein OsmC  28.43 
 
 		 139 aa  42.7  0.002  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0921  OsmC family protein  23.89 
 
 		 136 aa  42.4  0.002  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.418667  normal  1 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1832  OsmC-like protein  28.09 
 
 		 133 aa  42  0.003  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1698  OsmC family protein  28.04 
 
 		 136 aa  42  0.003  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2280  OsmC-like protein  20.57 
 
 		 406 aa  41.2  0.005  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  0.423404 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0982  OsmC family protein  31.08 
 
 		 127 aa  41.2  0.005  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3648  OsmC family protein  19.26 
 
 		 167 aa  41.2  0.005  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009091  P9301_11241  putative stress-induced protein OsmC  28.43 
 
 		 135 aa  40.8  0.006  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  0.160014  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>