67 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene RPD_0112 on replicon NC_007958
Organism: Rhodopseudomonas palustris BisB5



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007958  RPD_0112  OsmC-like protein  100 
 
 		 169 aa  335  1.9999999999999998e-91  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.636366  normal  0.66012 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2892  OsmC family protein  88.17 
 
 		 169 aa  284  5e-76  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.851644  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7644  hypothetical protein  86.39 
 
 		 170 aa  275  3e-73  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.601343  normal  0.571261 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0225  OsmC-like protein  82.25 
 
 		 169 aa  269  1e-71  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.439807  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0693  OsmC-like protein  74.4 
 
 		 168 aa  262  2e-69  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0031  OsmC-like protein  82.25 
 
 		 169 aa  259  1e-68  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.975846 
 
 
-
 
NC_010511  M446_2189  OsmC family protein  73.81 
 
 		 169 aa  258  2e-68  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.0335227  normal  0.683604 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0377  OsmC family protein  72.62 
 
 		 169 aa  254  3e-67  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0330  OsmC family protein  72.02 
 
 		 169 aa  254  6e-67  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.514624  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0407  OsmC family protein  71.43 
 
 		 169 aa  253  9e-67  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.0496053  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1148  OsmC family protein  72.62 
 
 		 169 aa  251  5.000000000000001e-66  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0867  OsmC family protein  72.12 
 
 		 169 aa  247  5e-65  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.376239  hitchhiker  0.00350915 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0781  OsmC family protein  64.46 
 
 		 169 aa  212  1.9999999999999998e-54  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.764307  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2855  OsmC family protein  59.64 
 
 		 169 aa  197  6e-50  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.0000502537  normal  0.0640135 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1127  OsmC family protein  60 
 
 		 168 aa  196  1.0000000000000001e-49  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  0.938023 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1639  OsmC family protein  53.7 
 
 		 167 aa  170  9e-42  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.945103  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1145  OsmC family protein  51.22 
 
 		 167 aa  162  2.0000000000000002e-39  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.354032  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3648  OsmC family protein  46.95 
 
 		 167 aa  149  2e-35  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0684  OsmC-like protein  50.61 
 
 		 167 aa  139  1.9999999999999998e-32  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.503679  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_2206  OsmC family protein  44.58 
 
 		 168 aa  132  1.9999999999999998e-30  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  0.742376 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1411  OsmC family protein  41.46 
 
 		 153 aa  123  1e-27  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.431224  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0339  OsmC family protein  31.08 
 
 		 145 aa  69.3  0.00000000002  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.53983  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_4241  OsmC family protein  36.36 
 
 		 202 aa  69.3  0.00000000002  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0441  OsmC family protein  36.08 
 
 		 189 aa  66.6  0.0000000001  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.488218  normal  0.432032 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2488  hypothetical protein  36.63 
 
 		 202 aa  65.9  0.0000000003  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2788  hypothetical protein  36 
 
 		 186 aa  65.1  0.0000000004  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2254  OsmC-like protein  34.34 
 
 		 199 aa  62.8  0.000000002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.0977605  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1892  OsmC-like protein  31.85 
 
 		 148 aa  58.9  0.00000004  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3848  OsmC family protein  30.93 
 
 		 181 aa  56.2  0.0000002  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.323457  normal  1 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_07015  hypothetical protein  32.63 
 
 		 181 aa  56.2  0.0000002  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2570  OsmC family protein  34.65 
 
 		 187 aa  55.1  0.0000004  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1865  OsmC family protein  35.4 
 
 		 185 aa  55.1  0.0000005  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.128326  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2488  OsmC family protein  28.23 
 
 		 172 aa  53.1  0.000002  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.0230337  normal  0.160295 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0235  OsmC family protein  33.64 
 
 		 147 aa  53.1  0.000002  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3526  OsmC family protein  27.88 
 
 		 177 aa  51.6  0.000005  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.7407  normal  0.298467 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_13840  predicted redox protein, regulator of disulfide bond formation  34.83 
 
 		 145 aa  51.6  0.000005  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2175  OsmC-like protein  31.07 
 
 		 185 aa  50.1  0.00001  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.416909  normal  1 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_2325  OsmC family protein  31.45 
 
 		 180 aa  50.1  0.00002  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6241  OsmC family protein  28.57 
 
 		 182 aa  49.7  0.00002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0196837  normal  0.733472 
 
 
-
 
NC_008545  Bcen2424_6854  OsmC family protein  33.77 
 
 		 186 aa  49.3  0.00003  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.521419  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_2212  OsmC family protein  32.97 
 
 		 159 aa  48.9  0.00003  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1644  OsmC family protein  29.7 
 
 		 193 aa  48.5  0.00004  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4851  OsmC-like protein  29.52 
 
 		 187 aa  48.9  0.00004  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.137347 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6453  OsmC family protein  29.7 
 
 		 182 aa  48.1  0.00005  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.16719  normal  1 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_6160  OsmC family protein  29.7 
 
 		 182 aa  47.8  0.00007  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.76501  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1151  OsmC family protein  29.47 
 
 		 183 aa  47.4  0.0001  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.824502  normal  0.359642 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2505  OsmC family protein  30.09 
 
 		 147 aa  47.4  0.0001  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1310  OsmC family protein  30.53 
 
 		 183 aa  47.4  0.0001  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.47097  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3413  OsmC family protein  27.93 
 
 		 171 aa  46.2  0.0002  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_04790  OsmC family protein  32.65 
 
 		 144 aa  46.6  0.0002  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4668  OsmC family protein  30.53 
 
 		 183 aa  46.2  0.0002  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.35857  normal  1 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0443  OsmC-like protein  31.68 
 
 		 176 aa  46.2  0.0002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.16081  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2354  OsmC-like protein  30.93 
 
 		 170 aa  46.2  0.0002  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.572746  n/a   
 
 
-
 
NC_011885  Cyan7425_0190  OsmC family protein  29.13 
 
 		 189 aa  45.4  0.0003  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  n/a    normal  0.155362 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4264  hypothetical protein  25.25 
 
 		 184 aa  44.7  0.0006  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1978  OsmC family protein  27 
 
 		 186 aa  44.3  0.0008  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0586  OsmC family protein  32.67 
 
 		 179 aa  43.5  0.001  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  0.128993  normal  0.0133234 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4432  OsmC family protein  26.26 
 
 		 184 aa  43.5  0.001  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.670087  normal  1 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3421  OsmC family protein  26.26 
 
 		 184 aa  43.5  0.001  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.320541  normal  1 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0969  OsmC family protein  28.28 
 
 		 182 aa  42.7  0.002  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  0.298439 
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0623  hypothetical protein  27.47 
 
 		 176 aa  42.4  0.003  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  decreased coverage  0.0005983  n/a   
 
 
-
 
NC_008545  Bcen2424_6912  OsmC family protein  25.25 
 
 		 184 aa  42.7  0.003  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3268  OsmC family protein  25.25 
 
 		 184 aa  42.4  0.003  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  0.200885 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4895  OsmC-like protein  25.25 
 
 		 184 aa  42.4  0.003  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0304  hypothetical protein  27.84 
 
 		 190 aa  42.4  0.003  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.119499 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0349  OsmC family protein  32.35 
 
 		 163 aa  42  0.004  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5247  OsmC family protein  24.84 
 
 		 187 aa  41.2  0.007  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.402263 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>