64 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Hlac_2206 on replicon NC_012029
Organism: Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_012029  Hlac_2206  OsmC family protein  100 
 
 		 168 aa  335  9.999999999999999e-92  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  0.742376 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0684  OsmC-like protein  54.6 
 
 		 167 aa  154  7e-37  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.503679  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0407  OsmC family protein  44.91 
 
 		 169 aa  146  1.0000000000000001e-34  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.0496053  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0377  OsmC family protein  46.3 
 
 		 169 aa  145  3e-34  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0867  OsmC family protein  47.31 
 
 		 169 aa  145  3e-34  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.376239  hitchhiker  0.00350915 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0330  OsmC family protein  45.68 
 
 		 169 aa  144  5e-34  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.514624  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2855  OsmC family protein  49.38 
 
 		 169 aa  143  1e-33  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.0000502537  normal  0.0640135 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1148  OsmC family protein  45.51 
 
 		 169 aa  138  3e-32  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1127  OsmC family protein  43.56 
 
 		 168 aa  138  3e-32  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  0.938023 
 
 
-
 
NC_010511  M446_2189  OsmC family protein  46.71 
 
 		 169 aa  136  2e-31  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.0335227  normal  0.683604 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0225  OsmC-like protein  44.58 
 
 		 169 aa  135  2e-31  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.439807  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7644  hypothetical protein  45.78 
 
 		 170 aa  135  3.0000000000000003e-31  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.601343  normal  0.571261 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0781  OsmC family protein  46.91 
 
 		 169 aa  135  3.0000000000000003e-31  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.764307  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0693  OsmC-like protein  45.34 
 
 		 168 aa  134  5e-31  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0112  OsmC-like protein  44.58 
 
 		 169 aa  132  3e-30  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.636366  normal  0.66012 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0031  OsmC-like protein  43.37 
 
 		 169 aa  125  3e-28  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.975846 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2892  OsmC family protein  43.83 
 
 		 169 aa  125  3e-28  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.851644  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1639  OsmC family protein  44.17 
 
 		 167 aa  122  2e-27  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.945103  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1145  OsmC family protein  40.61 
 
 		 167 aa  120  6e-27  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.354032  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3648  OsmC family protein  39.39 
 
 		 167 aa  110  6e-24  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1411  OsmC family protein  35.8 
 
 		 153 aa  90.1  1e-17  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.431224  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2788  hypothetical protein  30.13 
 
 		 186 aa  64.3  0.0000000008  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0441  OsmC family protein  33.64 
 
 		 189 aa  59.7  0.00000002  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.488218  normal  0.432032 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2354  OsmC-like protein  31.68 
 
 		 170 aa  57  0.0000001  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.572746  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6241  OsmC family protein  27.22 
 
 		 182 aa  57  0.0000001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0196837  normal  0.733472 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2488  OsmC family protein  30.22 
 
 		 172 aa  54.7  0.0000005  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.0230337  normal  0.160295 
 
 
-
 
NC_011885  Cyan7425_0190  OsmC family protein  30.1 
 
 		 189 aa  53.9  0.000001  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  n/a    normal  0.155362 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3848  OsmC family protein  31.91 
 
 		 181 aa  53.9  0.000001  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.323457  normal  1 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_2325  OsmC family protein  34.13 
 
 		 180 aa  53.1  0.000002  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_07015  hypothetical protein  30.85 
 
 		 181 aa  51.6  0.000004  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3413  OsmC family protein  33.68 
 
 		 171 aa  51.6  0.000005  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1644  OsmC family protein  27.88 
 
 		 193 aa  51.2  0.000006  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0235  OsmC family protein  31.68 
 
 		 147 aa  51.2  0.000006  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_04790  OsmC family protein  30.1 
 
 		 144 aa  50.1  0.00001  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_4241  OsmC family protein  29.81 
 
 		 202 aa  49.7  0.00002  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2570  OsmC family protein  30.1 
 
 		 187 aa  49.3  0.00003  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2054  OsmC family protein  27.45 
 
 		 164 aa  48.9  0.00003  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  0.778931 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3526  OsmC family protein  22.73 
 
 		 177 aa  48.5  0.00005  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.7407  normal  0.298467 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5556  OsmC-like protein  29.77 
 
 		 130 aa  47.8  0.00008  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  hitchhiker  0.0000078778  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2505  OsmC family protein  32.69 
 
 		 147 aa  47.8  0.00008  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1026  OsmC family protein  24.53 
 
 		 206 aa  47  0.0001  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_6160  OsmC family protein  32.5 
 
 		 182 aa  46.2  0.0002  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.76501  normal  1 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0339  OsmC family protein  24.83 
 
 		 145 aa  46.6  0.0002  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.53983  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2488  hypothetical protein  26.26 
 
 		 202 aa  46.6  0.0002  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0623  hypothetical protein  33.71 
 
 		 176 aa  46.2  0.0002  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  decreased coverage  0.0005983  n/a   
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6453  OsmC family protein  31.25 
 
 		 182 aa  45.8  0.0003  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.16719  normal  1 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1593  OsmC family protein  33.96 
 
 		 141 aa  43.5  0.001  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3633  OsmC-like protein  29.25 
 
 		 406 aa  43.9  0.001  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.525721 
 
 
-
 
NC_002967  TDE1270  hypothetical protein  29.41 
 
 		 144 aa  43.1  0.002  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  hitchhiker  0.00225413  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1865  OsmC family protein  35.29 
 
 		 185 aa  43.1  0.002  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.128326  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2794  OsmC family protein  26.04 
 
 		 142 aa  43.1  0.002  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1892  OsmC-like protein  31.82 
 
 		 148 aa  42.7  0.002  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3865  OsmC family protein  28.79 
 
 		 175 aa  42.4  0.003  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.745195  normal  0.175914 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1835  OsmC-like protein  33.33 
 
 		 407 aa  42  0.003  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5418  hypothetical protein  30.93 
 
 		 180 aa  42  0.004  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0304  hypothetical protein  30 
 
 		 190 aa  41.6  0.005  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.119499 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2254  OsmC-like protein  28.42 
 
 		 199 aa  41.6  0.005  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.0977605  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0443  OsmC-like protein  29.52 
 
 		 176 aa  41.6  0.005  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.16081  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2100  OsmC family protein  26.47 
 
 		 185 aa  41.6  0.006  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0206  OsmC family protein  30.77 
 
 		 174 aa  40.8  0.008  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.338673  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2612  OsmC family protein  30.93 
 
 		 208 aa  40.8  0.008  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.43183 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_3616  osmotically inducible protein  29.08 
 
 		 129 aa  40.8  0.008  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000818818  normal  1 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2578  OsmC family protein  29.29 
 
 		 142 aa  40.8  0.009  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1438  OsmC family protein  26.42 
 
 		 137 aa  40.8  0.009  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.139134 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>