66 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rpal_2892 on replicon NC_011004
Organism: Rhodopseudomonas palustris TIE-1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011004  Rpal_2892  OsmC family protein  100 
 
 		 169 aa  334  3.9999999999999995e-91  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.851644  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0112  OsmC-like protein  88.17 
 
 		 169 aa  285  2e-76  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.636366  normal  0.66012 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7644  hypothetical protein  83.43 
 
 		 170 aa  269  1e-71  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.601343  normal  0.571261 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0225  OsmC-like protein  80.47 
 
 		 169 aa  261  4e-69  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.439807  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0693  OsmC-like protein  72.62 
 
 		 168 aa  254  5e-67  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_2189  OsmC family protein  73.21 
 
 		 169 aa  253  6e-67  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.0335227  normal  0.683604 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0031  OsmC-like protein  79.29 
 
 		 169 aa  251  3e-66  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.975846 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0377  OsmC family protein  71.43 
 
 		 169 aa  248  3e-65  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0330  OsmC family protein  70.83 
 
 		 169 aa  246  8e-65  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.514624  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1148  OsmC family protein  72.62 
 
 		 169 aa  246  1e-64  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0407  OsmC family protein  70.24 
 
 		 169 aa  246  2e-64  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.0496053  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0867  OsmC family protein  72.56 
 
 		 169 aa  241  1.9999999999999999e-63  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.376239  hitchhiker  0.00350915 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0781  OsmC family protein  63.41 
 
 		 169 aa  208  2e-53  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.764307  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2855  OsmC family protein  62.05 
 
 		 169 aa  202  2e-51  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.0000502537  normal  0.0640135 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1127  OsmC family protein  61.44 
 
 		 168 aa  197  5e-50  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  0.938023 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1639  OsmC family protein  52.47 
 
 		 167 aa  168  4e-41  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.945103  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1145  OsmC family protein  50.61 
 
 		 167 aa  162  1.0000000000000001e-39  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.354032  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3648  OsmC family protein  47.56 
 
 		 167 aa  155  3e-37  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0684  OsmC-like protein  48.19 
 
 		 167 aa  138  3e-32  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.503679  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_2206  OsmC family protein  43.83 
 
 		 168 aa  125  3e-28  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  0.742376 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1411  OsmC family protein  42.68 
 
 		 153 aa  122  3e-27  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.431224  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0339  OsmC family protein  29.45 
 
 		 145 aa  68.6  0.00000000005  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.53983  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0441  OsmC family protein  36.46 
 
 		 189 aa  65.5  0.0000000003  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.488218  normal  0.432032 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_4241  OsmC family protein  31.31 
 
 		 202 aa  63.2  0.000000002  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2788  hypothetical protein  34 
 
 		 186 aa  60.1  0.00000001  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2488  hypothetical protein  33.66 
 
 		 202 aa  59.7  0.00000002  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3848  OsmC family protein  34.02 
 
 		 181 aa  58.9  0.00000003  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.323457  normal  1 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2254  OsmC-like protein  31.63 
 
 		 199 aa  57.8  0.00000007  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.0977605  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1892  OsmC-like protein  29.93 
 
 		 148 aa  56.2  0.0000002  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2570  OsmC family protein  35.64 
 
 		 187 aa  55.1  0.0000004  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_07015  hypothetical protein  32.63 
 
 		 181 aa  54.3  0.0000008  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3526  OsmC family protein  28.95 
 
 		 177 aa  53.5  0.000001  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.7407  normal  0.298467 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_13840  predicted redox protein, regulator of disulfide bond formation  33.71 
 
 		 145 aa  53.1  0.000002  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0235  OsmC family protein  34 
 
 		 147 aa  53.1  0.000002  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2488  OsmC family protein  28.33 
 
 		 172 aa  53.1  0.000002  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.0230337  normal  0.160295 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6241  OsmC family protein  29.17 
 
 		 182 aa  49.3  0.00002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0196837  normal  0.733472 
 
 
-
 
NC_008545  Bcen2424_6854  OsmC family protein  33.77 
 
 		 186 aa  49.3  0.00003  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.521419  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_04790  OsmC family protein  32.65 
 
 		 144 aa  49.3  0.00003  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1865  OsmC family protein  33.04 
 
 		 185 aa  48.9  0.00004  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.128326  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4851  OsmC-like protein  29.9 
 
 		 187 aa  48.1  0.00005  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.137347 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0443  OsmC-like protein  32.22 
 
 		 176 aa  48.1  0.00005  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.16081  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_2212  OsmC family protein  27.52 
 
 		 159 aa  47.8  0.00008  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_6160  OsmC family protein  28 
 
 		 182 aa  47.4  0.00009  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.76501  normal  1 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6453  OsmC family protein  28 
 
 		 182 aa  47.4  0.00009  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.16719  normal  1 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2175  OsmC-like protein  26.21 
 
 		 185 aa  47  0.0001  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.416909  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1151  OsmC family protein  28.42 
 
 		 183 aa  47  0.0001  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.824502  normal  0.359642 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_2325  OsmC family protein  28.93 
 
 		 180 aa  46.6  0.0001  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3413  OsmC family protein  27.93 
 
 		 171 aa  46.2  0.0002  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1310  OsmC family protein  30.53 
 
 		 183 aa  46.2  0.0002  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.47097  normal  1 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2505  OsmC family protein  29.2 
 
 		 147 aa  45.8  0.0003  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1644  OsmC family protein  27.27 
 
 		 193 aa  45.8  0.0003  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4668  OsmC family protein  27.37 
 
 		 183 aa  45.4  0.0003  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.35857  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2354  OsmC-like protein  29.47 
 
 		 170 aa  45.1  0.0005  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.572746  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4264  hypothetical protein  25 
 
 		 184 aa  44.7  0.0007  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011885  Cyan7425_0190  OsmC family protein  29.13 
 
 		 189 aa  44.3  0.0009  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  n/a    normal  0.155362 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1978  OsmC family protein  27 
 
 		 186 aa  44.3  0.0009  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3421  OsmC family protein  26.53 
 
 		 184 aa  43.5  0.001  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.320541  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4432  OsmC family protein  26.53 
 
 		 184 aa  43.5  0.001  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.670087  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0304  hypothetical protein  27.84 
 
 		 190 aa  43.1  0.002  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.119499 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0969  OsmC family protein  29.29 
 
 		 182 aa  43.1  0.002  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  0.298439 
 
 
-
 
NC_008545  Bcen2424_6912  OsmC family protein  27.71 
 
 		 184 aa  42.7  0.003  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3268  OsmC family protein  27.71 
 
 		 184 aa  42.4  0.003  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  0.200885 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4895  OsmC-like protein  27.71 
 
 		 184 aa  42.4  0.003  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0586  OsmC family protein  30.69 
 
 		 179 aa  41.2  0.007  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  0.128993  normal  0.0133234 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0349  OsmC family protein  31.37 
 
 		 163 aa  41.2  0.007  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1593  OsmC family protein  25.49 
 
 		 141 aa  40.8  0.009  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>