38 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene BBta_p0218 on replicon NC_009475
Organism: Bradyrhizobium sp. BTAi1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009475  BBta_p0218  hypothetical protein  100 
 
 		 74 aa  150  5e-36  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  n/a    normal  0.354041 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3526  OsmC family protein  62.3 
 
 		 177 aa  85.1  3e-16  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.7407  normal  0.298467 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2354  OsmC-like protein  46.55 
 
 		 170 aa  61.6  0.000000003  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.572746  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3413  OsmC family protein  39.06 
 
 		 171 aa  57  0.00000009  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2488  OsmC family protein  35.62 
 
 		 172 aa  50.4  0.000009  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.0230337  normal  0.160295 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0235  OsmC family protein  42.03 
 
 		 147 aa  50.4  0.000009  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4264  hypothetical protein  34.72 
 
 		 184 aa  48.9  0.00002  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1026  OsmC family protein  43.86 
 
 		 206 aa  49.3  0.00002  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6453  OsmC family protein  34.72 
 
 		 182 aa  47.8  0.00005  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.16719  normal  1 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0443  OsmC-like protein  40.54 
 
 		 176 aa  47.8  0.00005  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.16081  n/a   
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_6160  OsmC family protein  34.72 
 
 		 182 aa  47.4  0.00006  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.76501  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1978  OsmC family protein  36.36 
 
 		 186 aa  45.8  0.0002  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4432  OsmC family protein  34.25 
 
 		 184 aa  45.1  0.0003  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.670087  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2100  OsmC family protein  41.94 
 
 		 185 aa  45.4  0.0003  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2570  OsmC family protein  40.91 
 
 		 187 aa  45.4  0.0003  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3421  OsmC family protein  34.25 
 
 		 184 aa  45.1  0.0003  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.320541  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4895  OsmC-like protein  34.72 
 
 		 184 aa  45.1  0.0003  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008545  Bcen2424_6912  OsmC family protein  34.72 
 
 		 184 aa  45.1  0.0003  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3268  OsmC family protein  34.72 
 
 		 184 aa  45.1  0.0003  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  0.200885 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5247  OsmC family protein  33.87 
 
 		 187 aa  44.7  0.0004  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.402263 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2505  OsmC family protein  36.51 
 
 		 147 aa  44.7  0.0004  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008545  Bcen2424_6854  OsmC family protein  33.82 
 
 		 186 aa  44.7  0.0004  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.521419  n/a   
 
 
-
 
NC_011885  Cyan7425_0190  OsmC family protein  36.51 
 
 		 189 aa  44.3  0.0005  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  n/a    normal  0.155362 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1072  OsmC family protein  34.92 
 
 		 135 aa  44.3  0.0006  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.107078  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0441  OsmC family protein  41.38 
 
 		 189 aa  43.9  0.0007  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.488218  normal  0.432032 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1644  OsmC family protein  39.34 
 
 		 193 aa  43.9  0.0008  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4791  OsmC family protein  37.14 
 
 		 187 aa  43.5  0.001  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.361207  normal  0.435509 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0407  OsmC family protein  30.88 
 
 		 169 aa  43.5  0.001  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.0496053  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2855  OsmC family protein  36.84 
 
 		 169 aa  42.4  0.002  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.0000502537  normal  0.0640135 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0377  OsmC family protein  30.88 
 
 		 169 aa  42  0.003  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1348  OsmC family protein  34.92 
 
 		 151 aa  42  0.003  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0330  OsmC family protein  30.88 
 
 		 169 aa  41.2  0.004  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.514624  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0693  OsmC-like protein  32.35 
 
 		 168 aa  40.8  0.006  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2788  hypothetical protein  39.66 
 
 		 186 aa  40.8  0.006  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_04790  OsmC family protein  34.43 
 
 		 144 aa  40.8  0.007  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_2189  OsmC family protein  35.09 
 
 		 169 aa  40.8  0.007  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.0335227  normal  0.683604 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1892  OsmC-like protein  31.51 
 
 		 148 aa  40.4  0.008  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2488  hypothetical protein  31.88 
 
 		 202 aa  40.4  0.008  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>