67 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Patl_1379 on replicon NC_008228
Organism: Pseudoalteromonas atlantica T6c



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_003910  CPS_1758  putative alkaline phosphatase  66.02 
 
 		 621 aa  855    Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.0727302  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1379  putative alkaline phosphatase  100 
 
 		 622 aa  1254    Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03288  putative alkaline phosphatase  42.62 
 
 		 600 aa  460  9.999999999999999e-129  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1957  alkaline phosphatase  43.84 
 
 		 635 aa  442  9.999999999999999e-123  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.0223046  normal  0.0148411 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1779  alkaline phosphatase  41.16 
 
 		 627 aa  430  1e-119  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  decreased coverage  0.00922398  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2372  alkaline phosphatase  43.46 
 
 		 624 aa  414  1e-114  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.519374  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2384  alkaline phosphatase  42.58 
 
 		 624 aa  411  1e-113  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.13062  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1975  alkaline phosphatase  43.11 
 
 		 624 aa  411  1e-113  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.0753581  hitchhiker  0.000000246694 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2267  alkaline phosphatase  43.01 
 
 		 624 aa  407  1.0000000000000001e-112  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2487  alkaline phosphatase  42.58 
 
 		 624 aa  402  1e-111  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.498769  decreased coverage  0.000143129 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1752  alkaline phosphatase  42.66 
 
 		 624 aa  393  1e-108  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.188317  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_2281  alkaline phosphatase  41.78 
 
 		 624 aa  394  1e-108  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2135  alkaline phosphatase  39.45 
 
 		 624 aa  392  1e-107  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1832  alkaline phosphatase  42.31 
 
 		 624 aa  391  1e-107  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.348845  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3908  MerR family transcriptional regulator  38.79 
 
 		 629 aa  383  1e-105  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2541  alkaline phosphatase-like  39.34 
 
 		 592 aa  350  6e-95  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.954107  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3684  LPXTG-motif cell wall anchor domain protein  40.14 
 
 		 774 aa  338  1.9999999999999998e-91  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  0.585223 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0276  alkaline phosphatase-like protein  36.32 
 
 		 551 aa  337  3.9999999999999995e-91  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  hitchhiker  0.000391321  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_45680  alkaline phosphatase  37.04 
 
 		 533 aa  333  5e-90  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2478  protein of unknown function DUF1555  38.28 
 
 		 539 aa  331  2e-89  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.304731  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4764  alkaline phosphatase-like protein  38.84 
 
 		 567 aa  328  1.0000000000000001e-88  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.469599 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3636  protein of unknown function DUF1555  38.6 
 
 		 539 aa  328  2.0000000000000001e-88  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_05423  hypothetical protein  37.78 
 
 		 589 aa  321  1.9999999999999998e-86  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1270  Collagen triple helix repeat protein  34.57 
 
 		 600 aa  320  3.9999999999999996e-86  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.932295  hitchhiker  0.000000745074 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1392  alkaline phosphatase  36.83 
 
 		 1355 aa  318  1e-85  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.127583  normal  0.479839 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2981  Ig family protein  36.24 
 
 		 857 aa  317  3e-85  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1973  alkaline phosphatase-like protein  40.29 
 
 		 546 aa  315  9.999999999999999e-85  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_2207  Alkaline phosphatase  37.86 
 
 		 1587 aa  308  2.0000000000000002e-82  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3484  hypothetical protein  34.53 
 
 		 622 aa  306  8.000000000000001e-82  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_001482  alkaline phosphatase  36.55 
 
 		 589 aa  305  2.0000000000000002e-81  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3215  hypothetical protein  37.67 
 
 		 576 aa  301  2e-80  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0635  transcriptional regulator, MerR family protein  36.52 
 
 		 598 aa  300  5e-80  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.693916  normal  1 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1228  hypothetical protein  35.19 
 
 		 601 aa  299  1e-79  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.0933019  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2477  alkaline phosphatase-like protein  34.47 
 
 		 633 aa  293  7e-78  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3826  alkaline phosphatase  33.62 
 
 		 575 aa  279  1e-73  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0744  CHU large protein  33.93 
 
 		 1322 aa  273  6e-72  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.982041  normal  1 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_10670  hypothetical protein  32.12 
 
 		 599 aa  262  1e-68  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.143126  normal  0.504233 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3414  hypothetical protein  33.51 
 
 		 506 aa  246  9.999999999999999e-64  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6653  alkaline phosphatase-like protein  34.47 
 
 		 501 aa  239  1e-61  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0978  hypothetical protein  31.61 
 
 		 498 aa  239  1e-61  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.121724  normal  0.659416 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3467  hemolysin-type calcium-binding region  43.15 
 
 		 1175 aa  232  2e-59  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0430  metallophosphoesterase  37.42 
 
 		 2701 aa  227  4e-58  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0406  alkaline phosphatase  36.51 
 
 		 2182 aa  215  1.9999999999999998e-54  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_1697  endonuclease/exonuclease/phosphatase  30.82 
 
 		 1795 aa  205  2e-51  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2372  5'-Nucleotidase domain protein  29.4 
 
 		 2796 aa  195  2e-48  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.308667 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1685  5'-Nucleotidase domain protein  32.08 
 
 		 2852 aa  108  2e-22  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1750  5'-nucleotidase domain-containing protein  31.09 
 
 		 3977 aa  102  3e-20  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2828  endonuclease/exonuclease/phosphatase  26.34 
 
 		 1641 aa  73.9  0.000000000007  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011683  PHATRDRAFT_47869  predicted protein  21.28 
 
 		 721 aa  71.2  0.00000000005  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2774  endonuclease/exonuclease/phosphatase  25.46 
 
 		 1641 aa  70.1  0.0000000001  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.0508724  normal  1 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_0439  putative secreted protein  34.12 
 
 		 754 aa  57  0.0000009  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_11501  alkaline phosphatase  34.12 
 
 		 754 aa  57  0.0000009  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  0.991815  normal  0.0150777 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4261  hypothetical protein  33.9 
 
 		 423 aa  57  0.000001  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.194386  normal  0.0872951 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2495  hypothetical protein  35.4 
 
 		 723 aa  55.8  0.000002  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  0.689072 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3413  hypothetical protein  40.48 
 
 		 733 aa  55.1  0.000004  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1474  hypothetical protein  55.81 
 
 		 612 aa  53.1  0.00002  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.654414  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01691  putative serine rich repeat containing protein  55.56 
 
 		 692 aa  52  0.00003  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_0720  putative secreted protein  33.33 
 
 		 760 aa  50.1  0.0001  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  0.522606  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1242  6-phosphogluconolactonase  26.7 
 
 		 431 aa  48.9  0.0003  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_5160  secreted protein  30.61 
 
 		 775 aa  47.8  0.0006  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.976383  normal  0.0934279 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3304  hypothetical protein  26.18 
 
 		 385 aa  47.8  0.0007  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1157  alkaline phosphatase  50 
 
 		 545 aa  47.4  0.0008  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00798229 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1155  secreted protein  31.52 
 
 		 776 aa  46.6  0.001  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  decreased coverage  0.00335606  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2543  alkaline phosphatase  43.75 
 
 		 640 aa  46.2  0.002  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.365989  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0399  hypothetical protein  31.4 
 
 		 723 aa  45.1  0.004  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1753  hypothetical protein  31.4 
 
 		 723 aa  44.7  0.005  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008688  Pden_5115  hypothetical protein  30.34 
 
 		 720 aa  44.3  0.007  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.44963  normal  0.774948 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>