71 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ping_0635 on replicon NC_008709
Organism: Psychromonas ingrahamii 37



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008709  Ping_0635  transcriptional regulator, MerR family protein  100 
 
 		 598 aa  1224    Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.693916  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3908  MerR family transcriptional regulator  46.01 
 
 		 629 aa  449  1e-125  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_45680  alkaline phosphatase  41.96 
 
 		 533 aa  388  1e-106  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2267  alkaline phosphatase  41.53 
 
 		 624 aa  383  1e-105  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0276  alkaline phosphatase-like protein  42.21 
 
 		 551 aa  382  1e-104  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  hitchhiker  0.000391321  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1975  alkaline phosphatase  42.52 
 
 		 624 aa  379  1e-104  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.0753581  hitchhiker  0.000000246694 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2372  alkaline phosphatase  42.69 
 
 		 624 aa  379  1e-104  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.519374  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1752  alkaline phosphatase  42.22 
 
 		 624 aa  377  1e-103  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.188317  normal  1 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2487  alkaline phosphatase  42.52 
 
 		 624 aa  372  1e-102  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.498769  decreased coverage  0.000143129 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2135  alkaline phosphatase  42.69 
 
 		 624 aa  374  1e-102  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1832  alkaline phosphatase  42.22 
 
 		 624 aa  374  1e-102  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.348845  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2541  alkaline phosphatase-like  39.16 
 
 		 592 aa  369  1e-101  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.954107  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1957  alkaline phosphatase  40.58 
 
 		 635 aa  372  1e-101  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.0223046  normal  0.0148411 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2384  alkaline phosphatase  42.01 
 
 		 624 aa  371  1e-101  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.13062  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_2281  alkaline phosphatase  41.88 
 
 		 624 aa  368  1e-100  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4764  alkaline phosphatase-like protein  39.04 
 
 		 567 aa  364  2e-99  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.469599 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1779  alkaline phosphatase  41.33 
 
 		 627 aa  360  4e-98  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  decreased coverage  0.00922398  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1270  Collagen triple helix repeat protein  40.07 
 
 		 600 aa  359  8e-98  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.932295  hitchhiker  0.000000745074 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3684  LPXTG-motif cell wall anchor domain protein  39.65 
 
 		 774 aa  358  1.9999999999999998e-97  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  0.585223 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2981  Ig family protein  36.53 
 
 		 857 aa  345  1e-93  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1392  alkaline phosphatase  38.93 
 
 		 1355 aa  343  5e-93  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.127583  normal  0.479839 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2477  alkaline phosphatase-like protein  39.28 
 
 		 633 aa  334  3e-90  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3484  hypothetical protein  35.98 
 
 		 622 aa  332  2e-89  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_05423  hypothetical protein  37.46 
 
 		 589 aa  325  1e-87  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_001482  alkaline phosphatase  36.82 
 
 		 589 aa  324  3e-87  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1228  hypothetical protein  35.74 
 
 		 601 aa  324  3e-87  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.0933019  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1758  putative alkaline phosphatase  38.15 
 
 		 621 aa  323  4e-87  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.0727302  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3215  hypothetical protein  35.9 
 
 		 576 aa  323  5e-87  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2478  protein of unknown function DUF1555  34.75 
 
 		 539 aa  311  2.9999999999999997e-83  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.304731  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3636  protein of unknown function DUF1555  34.57 
 
 		 539 aa  307  3e-82  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_2207  Alkaline phosphatase  39.06 
 
 		 1587 aa  303  6.000000000000001e-81  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0744  CHU large protein  35.2 
 
 		 1322 aa  302  1e-80  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.982041  normal  1 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3826  alkaline phosphatase  34.39 
 
 		 575 aa  301  2e-80  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1379  putative alkaline phosphatase  36.52 
 
 		 622 aa  300  5e-80  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1973  alkaline phosphatase-like protein  35.89 
 
 		 546 aa  297  3e-79  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03288  putative alkaline phosphatase  35.98 
 
 		 600 aa  297  5e-79  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_10670  hypothetical protein  34.62 
 
 		 599 aa  263  4.999999999999999e-69  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.143126  normal  0.504233 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6653  alkaline phosphatase-like protein  33.11 
 
 		 501 aa  249  9e-65  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0430  metallophosphoesterase  34.57 
 
 		 2701 aa  246  6e-64  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0978  hypothetical protein  32.29 
 
 		 498 aa  244  3e-63  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.121724  normal  0.659416 
 
 
-
 
NC_010511  M446_1697  endonuclease/exonuclease/phosphatase  32.97 
 
 		 1795 aa  234  2.0000000000000002e-60  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3414  hypothetical protein  32.5 
 
 		 506 aa  223  6e-57  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2372  5'-Nucleotidase domain protein  31.41 
 
 		 2796 aa  215  1.9999999999999998e-54  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.308667 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0406  alkaline phosphatase  33.16 
 
 		 2182 aa  203  6e-51  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3467  hemolysin-type calcium-binding region  39.68 
 
 		 1175 aa  198  3e-49  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1750  5'-nucleotidase domain-containing protein  34.88 
 
 		 3977 aa  114  7.000000000000001e-24  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1685  5'-Nucleotidase domain protein  34.9 
 
 		 2852 aa  107  5e-22  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4261  hypothetical protein  23.32 
 
 		 423 aa  89.4  2e-16  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.194386  normal  0.0872951 
 
 
-
 
NC_011683  PHATRDRAFT_47869  predicted protein  25.18 
 
 		 721 aa  80.9  0.00000000000007  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2828  endonuclease/exonuclease/phosphatase  32.34 
 
 		 1641 aa  76.3  0.000000000002  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_0439  putative secreted protein  34.34 
 
 		 754 aa  70.9  0.00000000007  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_11501  alkaline phosphatase  33.73 
 
 		 754 aa  68.9  0.0000000002  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  0.991815  normal  0.0150777 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2774  endonuclease/exonuclease/phosphatase  31.13 
 
 		 1641 aa  68.9  0.0000000003  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.0508724  normal  1 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2495  hypothetical protein  31.29 
 
 		 723 aa  63.5  0.000000009  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  0.689072 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_5160  secreted protein  29.92 
 
 		 775 aa  58.2  0.0000005  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.976383  normal  0.0934279 
 
 
-
 
NC_011682  PHATRDRAFT_47612  predicted protein  24.76 
 
 		 793 aa  57.8  0.0000006  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1753  hypothetical protein  26.53 
 
 		 723 aa  57.8  0.0000006  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0399  hypothetical protein  26.53 
 
 		 723 aa  57.8  0.0000006  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2901  hypothetical protein  26.09 
 
 		 719 aa  56.2  0.000002  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  0.427774 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1155  secreted protein  22.64 
 
 		 776 aa  53.5  0.00001  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  decreased coverage  0.00335606  normal  1 
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_0720  putative secreted protein  33.33 
 
 		 760 aa  51.6  0.00004  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  0.522606  n/a   
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3328  hypothetical protein  27.33 
 
 		 721 aa  50.4  0.00008  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.498692  normal  0.26053 
 
 
-
 
NC_008688  Pden_5115  hypothetical protein  26.82 
 
 		 720 aa  50.1  0.0001  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.44963  normal  0.774948 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1252  hypothetical protein  31.03 
 
 		 732 aa  47  0.001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.176304  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2720  YVTN beta-propeller repeat-containing protein  29.17 
 
 		 327 aa  46.6  0.001  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.441743  normal  0.222343 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1343  putative alkaline phosphatase protein  31.03 
 
 		 732 aa  46.6  0.001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2182  40-residue YVTN family beta-propeller repeat protein  23.41 
 
 		 328 aa  45.4  0.003  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.960919  normal  0.361947 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1847  YVTN beta-propeller repeat-containing protein  23.41 
 
 		 328 aa  45.1  0.004  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0109  40-residue YVTN family beta-propeller repeat-containing protein  26 
 
 		 354 aa  44.7  0.005  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1798  40-residue YVTN family beta-propeller repeat protein  23.41 
 
 		 328 aa  44.3  0.006  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.178604 
 
 
-
 
NC_010511  M446_5012  YVTN beta-propeller repeat-containing protein  25.69 
 
 		 328 aa  43.9  0.009  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.0147653 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>