89 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PMT9312_0720 on replicon NC_007577
Organism: Prochlorococcus marinus str. MIT 9312



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009049  Rsph17029_0399  hypothetical protein  46.43 
 
 
723 aa  645    Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_11501  alkaline phosphatase  67.23 
 
 
754 aa  1025    Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  0.991815  normal  0.0150777 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_0439  putative secreted protein  66.97 
 
 
754 aa  1021    Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3328  hypothetical protein  48.43 
 
 
721 aa  667    Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.498692  normal  0.26053 
 
 
-
 
NC_008688  Pden_5115  hypothetical protein  46.19 
 
 
720 aa  641    Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.44963  normal  0.774948 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1753  hypothetical protein  46.29 
 
 
723 aa  639    Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2901  hypothetical protein  47.03 
 
 
719 aa  658    Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal  0.427774 
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_0720  putative secreted protein  100 
 
 
760 aa  1550    Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  0.522606  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2495  hypothetical protein  50.13 
 
 
723 aa  707    Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal  0.689072 
 
 
-
 
NC_004311  BRA0616  hypothetical protein  47.07 
 
 
729 aa  619  1e-176  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0581  hypothetical protein  46.94 
 
 
729 aa  616  1e-175  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3413  hypothetical protein  43.95 
 
 
733 aa  597  1e-169  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0876  hypothetical protein  44.4 
 
 
731 aa  577  1.0000000000000001e-163  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1252  hypothetical protein  42.39 
 
 
732 aa  554  1e-156  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.176304  normal 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1343  putative alkaline phosphatase protein  41.61 
 
 
732 aa  548  1e-154  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011682  PHATRDRAFT_47612  predicted protein  37.53 
 
 
793 aa  415  1e-114  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1155  secreted protein  33.64 
 
 
776 aa  399  9.999999999999999e-111  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  decreased coverage  0.00335606  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_5160  secreted protein  32.53 
 
 
775 aa  386  1e-106  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.976383  normal  0.0934279 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4261  hypothetical protein  36.25 
 
 
423 aa  213  1e-53  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.194386  normal  0.0872951 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0978  hypothetical protein  28.28 
 
 
498 aa  113  1.0000000000000001e-23  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.121724  normal  0.659416 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3414  hypothetical protein  25.27 
 
 
506 aa  111  4.0000000000000004e-23  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2774  endonuclease/exonuclease/phosphatase  29.06 
 
 
1641 aa  104  6e-21  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.0508724  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2828  endonuclease/exonuclease/phosphatase  26.56 
 
 
1641 aa  104  7e-21  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6653  alkaline phosphatase-like protein  26.42 
 
 
501 aa  103  2e-20  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_2207  Alkaline phosphatase  23.62 
 
 
1587 aa  92.4  3e-17  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2478  protein of unknown function DUF1555  22.8 
 
 
539 aa  90.5  1e-16  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.304731  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2981  Ig family protein  23.82 
 
 
857 aa  90.1  1e-16  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_45680  alkaline phosphatase  23.77 
 
 
533 aa  88.2  6e-16  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2541  alkaline phosphatase-like  25.67 
 
 
592 aa  87.8  7e-16  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.954107  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3636  protein of unknown function DUF1555  22.59 
 
 
539 aa  87.4  0.000000000000001  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1270  Collagen triple helix repeat protein  23.46 
 
 
600 aa  83.6  0.00000000000001  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.932295  hitchhiker  0.000000745074 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1832  alkaline phosphatase  26.61 
 
 
624 aa  82.8  0.00000000000002  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.348845  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1973  alkaline phosphatase-like protein  21.96 
 
 
546 aa  82.4  0.00000000000003  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_10670  hypothetical protein  24.93 
 
 
599 aa  81.6  0.00000000000005  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.143126  normal  0.504233 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1752  alkaline phosphatase  26.33 
 
 
624 aa  81.6  0.00000000000006  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.188317  normal 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3826  alkaline phosphatase  23.15 
 
 
575 aa  80.1  0.0000000000001  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3684  LPXTG-motif cell wall anchor domain protein  25 
 
 
774 aa  79.7  0.0000000000002  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal  0.585223 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2267  alkaline phosphatase  26.05 
 
 
624 aa  79.3  0.0000000000002  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1975  alkaline phosphatase  26.21 
 
 
624 aa  79  0.0000000000003  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.0753581  hitchhiker  0.000000246694 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2372  alkaline phosphatase  25.93 
 
 
624 aa  78.2  0.0000000000005  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.519374  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0430  metallophosphoesterase  26.15 
 
 
2701 aa  78.2  0.0000000000005  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2384  alkaline phosphatase  26.35 
 
 
624 aa  78.2  0.0000000000006  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.13062  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2487  alkaline phosphatase  25.64 
 
 
624 aa  75.1  0.000000000004  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.498769  decreased coverage  0.000143129 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1750  5'-nucleotidase domain-containing protein  34.27 
 
 
3977 aa  74.7  0.000000000006  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_2281  alkaline phosphatase  25.22 
 
 
624 aa  73.6  0.00000000001  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1957  alkaline phosphatase  24.47 
 
 
635 aa  71.6  0.00000000005  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.0223046  normal  0.0148411 
 
 
-
 
NC_010511  M446_1697  endonuclease/exonuclease/phosphatase  24.85 
 
 
1795 aa  71.6  0.00000000005  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2135  alkaline phosphatase  24.5 
 
 
624 aa  70.1  0.0000000001  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1685  5'-Nucleotidase domain protein  39.51 
 
 
2852 aa  67.4  0.000000001  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0744  CHU large protein  23.03 
 
 
1322 aa  65.5  0.000000004  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.982041  normal 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1392  alkaline phosphatase  30.13 
 
 
1355 aa  64.7  0.000000006  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.127583  normal  0.479839 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1779  alkaline phosphatase  23.4 
 
 
627 aa  61.6  0.00000005  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  decreased coverage  0.00922398  normal 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2094  hypothetical protein  29.22 
 
 
451 aa  61.6  0.00000006  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03288  putative alkaline phosphatase  38.1 
 
 
600 aa  60.1  0.0000001  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3215  hypothetical protein  34.75 
 
 
576 aa  59.7  0.0000002  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3467  hemolysin-type calcium-binding region  25.76 
 
 
1175 aa  59.7  0.0000002  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1822  hypothetical protein  30.74 
 
 
451 aa  59.3  0.0000003  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.430536  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_4033  hypothetical protein  31.07 
 
 
512 aa  58.5  0.0000004  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.104579  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0276  alkaline phosphatase-like protein  35.79 
 
 
551 aa  58.2  0.0000005  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  hitchhiker  0.000391321  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4951  hypothetical protein  29.06 
 
 
438 aa  58.2  0.0000006  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal  0.0822619 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2477  alkaline phosphatase-like protein  26.09 
 
 
633 aa  57.8  0.0000007  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4265  hypothetical protein  27.17 
 
 
429 aa  57.8  0.0000007  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.223589  normal  0.265147 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3484  hypothetical protein  27.32 
 
 
622 aa  57.4  0.000001  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_001482  alkaline phosphatase  29.68 
 
 
589 aa  56.2  0.000002  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1228  hypothetical protein  25 
 
 
601 aa  55.1  0.000004  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.0933019  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1074  protein of unknown function DUF1555  25.34 
 
 
501 aa  54.7  0.000006  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4764  alkaline phosphatase-like protein  28.75 
 
 
567 aa  54.7  0.000006  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal  0.469599 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0807  hypothetical protein  28.28 
 
 
453 aa  54.3  0.000009  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_05423  hypothetical protein  29.09 
 
 
589 aa  54.3  0.000009  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1103  protein of unknown function DUF1555  25.34 
 
 
501 aa  53.9  0.00001  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.428306  normal  0.970899 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3999  phytase  26.92 
 
 
1844 aa  53.9  0.00001  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2372  5'-Nucleotidase domain protein  33.33 
 
 
2796 aa  53.9  0.00001  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal  0.308667 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1010  hypothetical protein  26.53 
 
 
454 aa  52.8  0.00002  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0406  alkaline phosphatase  24.41 
 
 
2182 aa  53.1  0.00002  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1758  putative alkaline phosphatase  36.9 
 
 
621 aa  52.4  0.00004  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.0727302  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3908  MerR family transcriptional regulator  30.23 
 
 
629 aa  52  0.00004  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0635  transcriptional regulator, MerR family protein  33.33 
 
 
598 aa  51.6  0.00005  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.693916  normal 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1041  hypothetical protein  25.1 
 
 
453 aa  51.2  0.00007  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1379  putative alkaline phosphatase  33.33 
 
 
622 aa  50.4  0.0001  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0223  hypothetical protein  27.98 
 
 
513 aa  49.3  0.0002  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1112  hypothetical protein  28.8 
 
 
457 aa  50.1  0.0002  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0225  hypothetical protein  27.98 
 
 
513 aa  48.9  0.0004  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  normal  0.0695472 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_4114  hypothetical protein  27.38 
 
 
513 aa  47.8  0.0007  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1141  hypothetical protein  28.26 
 
 
457 aa  47.4  0.001  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4876  hypothetical protein  25.2 
 
 
457 aa  47  0.001  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_4234  hypothetical protein  27.38 
 
 
513 aa  46.6  0.002  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  decreased coverage  0.0000811354 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1903  hypothetical protein  25.35 
 
 
494 aa  46.2  0.002  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000927643 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2070  hypothetical protein  25.25 
 
 
417 aa  45.8  0.003  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal  0.927231 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3119  phytase  25.28 
 
 
998 aa  45.1  0.005  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal  0.446959 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>